75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0217 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0217  protein HemY  100 
 
 		 393 aa  801    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00317  heme biosynthesis protein  48.21 
 
 		 393 aa  385  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002103  HemY-like protein  48.98 
 
 		 393 aa  383  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2401  hemY protein  48.21 
 
 		 398 aa  356  3.9999999999999996e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3990  putative protoheme IX biogenesis protein  31.98 
 
 		 399 aa  200  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00160322  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4019  putative protoheme IX biogenesis protein  32.01 
 
 		 406 aa  199  7.999999999999999e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.124831  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0176  putative protoheme IX biogenesis protein  32.37 
 
 		 398 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0533  putative protoheme IX biogenesis protein  32.01 
 
 		 406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0195  putative protoheme IX biogenesis protein  31.75 
 
 		 406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4177  HemY protein  32.03 
 
 		 398 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.849055  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03626  hypothetical protein  32.03 
 
 		 398 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.274284  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5240  putative protoheme IX biogenesis protein  32.03 
 
 		 398 aa  194  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4261  putative protoheme IX biogenesis protein  32.03 
 
 		 398 aa  194  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4167  putative protoheme IX biogenesis protein  32.03 
 
 		 398 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.307244 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4317  putative protoheme IX biogenesis protein  32.03 
 
 		 398 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00516083  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4022  putative protoheme IX biogenesis protein  32.03 
 
 		 398 aa  194  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000011562  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03677  predicted protoheme IX synthesis protein  32.03 
 
 		 398 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.28898  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4205  putative protoheme IX biogenesis protein  31.77 
 
 		 398 aa  192  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0124972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0175  putative protoheme IX biogenesis protein  31.58 
 
 		 398 aa  189  7e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00876626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0225  putative protoheme IX biogenesis protein  30.43 
 
 		 397 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3983  putative protoheme IX biogenesis protein  30.53 
 
 		 399 aa  186  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4174  putative protoheme IX biogenesis protein  29.47 
 
 		 397 aa  179  4.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123419  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4163  putative protoheme IX biogenesis protein  31.17 
 
 		 399 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000026961  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4148  putative protoheme IX biogenesis protein  31.17 
 
 		 399 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0333333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4217  putative protoheme IX biogenesis protein  31.17 
 
 		 399 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0192261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4265  putative protoheme IX biogenesis protein  31.17 
 
 		 399 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00998904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4324  putative protoheme IX biogenesis protein  31.17 
 
 		 399 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00653056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0047  porphyrin biosynthesis protein  33.7 
 
 		 425 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2663  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  29.59 
 
 		 395 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0505  HemY-like  30.65 
 
 		 427 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.331612  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2794  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  28.39 
 
 		 395 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2667  HemY domain-containing protein  31.25 
 
 		 435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000205656 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2177  HemY  30.14 
 
 		 392 aa  138  1e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0484  HemY domain-containing protein  31.34 
 
 		 413 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2204  hemY protein  29.86 
 
 		 392 aa  137  4e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.103218  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3639  HemY domain-containing protein  28.83 
 
 		 396 aa  130  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.510419  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3062  hemY protein, putative  26.53 
 
 		 424 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3106  HemY-like protein  29.22 
 
 		 409 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.417009  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47570  HemY-like protein  29.63 
 
 		 410 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.825409  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00147  uncharacterized enzyme of heme biosynthesis  27.89 
 
 		 391 aa  124  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3664  metal dependent phosphohydrolase  25.8 
 
 		 403 aa  123  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0026  HemY-like protein  30.29 
 
 		 390 aa  120  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3594  HemY domain-containing protein  27.16 
 
 		 409 aa  119  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1028  HemY domain-containing protein  26.84 
 
 		 441 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.791332  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0131  hemY protein, putative  25.76 
 
 		 414 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6003  HemY protein  27.25 
 
 		 412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0259  HemY domain-containing protein  28.87 
 
 		 412 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5484  HemY-like  26.18 
 
 		 412 aa  112  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0283  HemY domain-containing protein  32.13 
 
 		 415 aa  112  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0339  HemY-like  24.81 
 
 		 393 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0214  HemY domain-containing protein  29.43 
 
 		 412 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0059  HemY, N-terminal  25.13 
 
 		 414 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0189  HemY domain protein  28.27 
 
 		 412 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0211  HemY domain-containing protein  28.65 
 
 		 412 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69420  putative enzyme of heme biosynthesis  26.04 
 
 		 412 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0437  HemY domain-containing protein  25.89 
 
 		 389 aa  100  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0385  HemY-like protein  25 
 
 		 396 aa  98.6  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.639304  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0315  HemY domain-containing protein  27.64 
 
 		 388 aa  96.7  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3904  HemY domain protein  27.09 
 
 		 388 aa  94  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4003  HemY domain-containing protein  27.78 
 
 		 388 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0287535  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3981  HemY domain-containing protein  26.84 
 
 		 388 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3590  HemY domain-containing protein  28.68 
 
 		 388 aa  91.3  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0115  HemY-like  23.08 
 
 		 391 aa  89.7  7e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3641  HemY domain-containing protein  27.02 
 
 		 388 aa  89.7  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0383  HemY domain-containing protein  27.02 
 
 		 388 aa  89  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0385  HemY domain-containing protein  27.02 
 
 		 388 aa  89  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3257  HemY protein  25.86 
 
 		 388 aa  86.7  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.306147 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4316  hemY protein, putative  25.77 
 
 		 388 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4097  HemY domain-containing protein  26.56 
 
 		 388 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.912703 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4136  HemY domain-containing protein  25.73 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0370  HemY domain-containing protein  23.64 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0480  HemY domain-containing protein  26.82 
 
 		 389 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1440  HemY domain protein  24.36 
 
 		 397 aa  55.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.264703  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2164  HemY domain protein  24.91 
 
 		 400 aa  55.1  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0032  HemY-like protein  21.63 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>