39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1996 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1996  HemY domain-containing protein  100 
 
 
425 aa  823    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.749547  hitchhiker  0.000309488 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2893  HemY domain-containing protein  78.54 
 
 
427 aa  596  1e-169  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.257354  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2380  HemY domain-containing protein  75.12 
 
 
407 aa  556  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.49521  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3661  putative porphyrin biosynthesis related protein  60.53 
 
 
429 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3087  HemY domain-containing protein  60 
 
 
429 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.676454  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1377  HemY domain protein  62.4 
 
 
427 aa  463  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.256451  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2229  HemY domain-containing protein  63.33 
 
 
435 aa  436  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0303881  normal  0.0116936 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1037  HemY domain-containing protein  72.33 
 
 
431 aa  432  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.203765  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1718  hypothetical protein  56.22 
 
 
429 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2999  putative porphyrin biosynthesis-related protein  44.07 
 
 
415 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.388807  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0767  HemY domain-containing protein  41.98 
 
 
415 aa  255  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000141589 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1080  putative hemY protein  34.27 
 
 
396 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1232  putative porphyrin biosynthesis related protein  34.27 
 
 
396 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1594  hypothetical protein  34.03 
 
 
396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.672545  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1074  HemY protein N-terminus family protein  34.03 
 
 
396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3003  hypothetical protein  34.03 
 
 
396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2281  hypothetical protein  34.03 
 
 
396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0732  hypothetical protein  34.03 
 
 
396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3409  hypothetical protein  32.56 
 
 
396 aa  147  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0874  HemY protein N-terminus family protein  33.1 
 
 
396 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2177  HemY domain-containing protein  31.47 
 
 
396 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.000141397 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1071  HemY domain protein  31.4 
 
 
396 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.62835 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2569  HemY domain protein  31.42 
 
 
397 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.538959  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1811  HemY-like  31 
 
 
395 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2423  HemY domain-containing protein  31 
 
 
395 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0160079  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2427  HemY domain-containing protein  31 
 
 
395 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399788  normal  0.263655 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2164  HemY domain protein  30.73 
 
 
397 aa  131  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.757442  normal  0.301743 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2355  putative protein porphyrin biosynthesis  32.11 
 
 
397 aa  120  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.354187  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2747  HemY-like protein  30.96 
 
 
396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0702  HemY, N-terminal:tetratricopeptide TPR_4  30.28 
 
 
396 aa  102  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3671  HemY, N-terminal  28.54 
 
 
394 aa  94.4  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0032  HemY-like protein  27.75 
 
 
393 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2332  HemY domain-containing protein  37.5 
 
 
395 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.30446  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0871  HemY domain-containing protein  38.39 
 
 
395 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.724762 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2466  HemY domain-containing protein  37.5 
 
 
395 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.618862  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1440  HemY domain protein  26.32 
 
 
397 aa  82.8  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.264703  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5750  HemY-like protein  36.61 
 
 
395 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308333  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2687  HemY-like  27.6 
 
 
404 aa  64.3  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2565  putative protein porphyrin biosynthesis  26.82 
 
 
390 aa  46.2  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.425074 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>