41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3661 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3087  HemY domain-containing protein  80.19 
 
 
429 aa  663    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.676454  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3661  putative porphyrin biosynthesis related protein  100 
 
 
429 aa  834    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1377  HemY domain protein  60.3 
 
 
427 aa  454  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.256451  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1996  HemY domain-containing protein  60.53 
 
 
425 aa  451  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.749547  hitchhiker  0.000309488 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2893  HemY domain-containing protein  58.51 
 
 
427 aa  431  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.257354  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2380  HemY domain-containing protein  55.4 
 
 
407 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.49521  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1718  hypothetical protein  57.18 
 
 
429 aa  385  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2229  HemY domain-containing protein  56.9 
 
 
435 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0303881  normal  0.0116936 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1037  HemY domain-containing protein  58.43 
 
 
431 aa  335  1e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.203765  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2999  putative porphyrin biosynthesis-related protein  43.26 
 
 
415 aa  271  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.388807  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0767  HemY domain-containing protein  40.98 
 
 
415 aa  239  5.999999999999999e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000141589 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3409  hypothetical protein  30.88 
 
 
396 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2177  HemY domain-containing protein  29.72 
 
 
396 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.000141397 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1071  HemY domain protein  30.18 
 
 
396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.62835 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0874  HemY protein N-terminus family protein  30.65 
 
 
396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1594  hypothetical protein  30.65 
 
 
396 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.672545  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1080  putative hemY protein  30.65 
 
 
396 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1074  HemY protein N-terminus family protein  30.65 
 
 
396 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3003  hypothetical protein  30.65 
 
 
396 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2281  hypothetical protein  30.65 
 
 
396 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0732  hypothetical protein  30.65 
 
 
396 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1232  putative porphyrin biosynthesis related protein  30.65 
 
 
396 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2423  HemY domain-containing protein  28.15 
 
 
395 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0160079  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1811  HemY-like  28.15 
 
 
395 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2427  HemY domain-containing protein  28.15 
 
 
395 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399788  normal  0.263655 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2569  HemY domain protein  27.56 
 
 
397 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.538959  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2164  HemY domain protein  27.73 
 
 
397 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.757442  normal  0.301743 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3671  HemY, N-terminal  31.37 
 
 
394 aa  92.4  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2355  putative protein porphyrin biosynthesis  28.02 
 
 
397 aa  91.7  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.354187  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2332  HemY domain-containing protein  36.44 
 
 
395 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.30446  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0871  HemY domain-containing protein  37.29 
 
 
395 aa  88.6  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.724762 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2466  HemY domain-containing protein  36.44 
 
 
395 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.618862  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5750  HemY-like protein  35.59 
 
 
395 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308333  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2747  HemY-like protein  27.25 
 
 
396 aa  82.8  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2687  HemY-like  28.61 
 
 
404 aa  77  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0702  HemY, N-terminal:tetratricopeptide TPR_4  27.21 
 
 
396 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1440  HemY domain protein  26.85 
 
 
397 aa  71.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.264703  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0032  HemY-like protein  25.13 
 
 
393 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2401  hemY protein  26.06 
 
 
398 aa  52.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2663  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  22.64 
 
 
395 aa  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2794  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  22.34 
 
 
395 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>