60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04231 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04231  porphyrin biosynthesis protein  100 
 
 
418 aa  817    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1135  HemY domain-containing protein  55.15 
 
 
389 aa  382  1e-105  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1228  porphyrin biosynthesis protein  55 
 
 
391 aa  379  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0129  HemY domain protein  55.39 
 
 
431 aa  333  3e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.116978 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0505  HemY-like  29.58 
 
 
427 aa  113  8.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.331612  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0026  HemY-like protein  31.58 
 
 
390 aa  91.3  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0115  HemY-like  26.09 
 
 
391 aa  90.1  6e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2204  hemY protein  27.36 
 
 
392 aa  84  0.000000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.103218  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2177  HemY  27.36 
 
 
392 aa  83.6  0.000000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2663  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  23.59 
 
 
395 aa  80.9  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2794  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  24.35 
 
 
395 aa  77.4  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1028  HemY domain-containing protein  24.77 
 
 
441 aa  75.1  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.791332  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3106  HemY-like protein  26.14 
 
 
409 aa  74.3  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.417009  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6003  HemY protein  29.01 
 
 
412 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3664  metal dependent phosphohydrolase  24.55 
 
 
403 aa  72.4  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69420  putative enzyme of heme biosynthesis  28.57 
 
 
412 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3062  hemY protein, putative  25.77 
 
 
424 aa  70.1  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2667  HemY domain-containing protein  27.12 
 
 
435 aa  68.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000205656 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0339  HemY-like  25.27 
 
 
393 aa  67.8  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3409  hypothetical protein  25.41 
 
 
396 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3594  HemY domain-containing protein  21.62 
 
 
409 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5484  HemY-like  26.18 
 
 
412 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2565  putative protein porphyrin biosynthesis  31.38 
 
 
390 aa  60.8  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1071  HemY domain protein  24.59 
 
 
396 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.62835 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0131  hemY protein, putative  25.74 
 
 
414 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0283  HemY domain-containing protein  27.33 
 
 
415 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0484  HemY domain-containing protein  24.76 
 
 
413 aa  56.2  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0871  HemY domain-containing protein  32.43 
 
 
395 aa  53.9  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.724762 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1232  putative porphyrin biosynthesis related protein  25.63 
 
 
396 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0059  HemY, N-terminal  24.5 
 
 
414 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1080  putative hemY protein  25.63 
 
 
396 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2687  HemY-like  28.16 
 
 
404 aa  53.1  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0214  HemY domain-containing protein  27.27 
 
 
412 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507923  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0189  HemY domain protein  27.18 
 
 
412 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3003  hypothetical protein  25.35 
 
 
396 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1074  HemY protein N-terminus family protein  25.35 
 
 
396 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0732  hypothetical protein  25.35 
 
 
396 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1594  hypothetical protein  25.35 
 
 
396 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.672545  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2281  hypothetical protein  25.35 
 
 
396 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2177  HemY domain-containing protein  32.31 
 
 
396 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.000141397 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2332  HemY domain-containing protein  31.76 
 
 
395 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.30446  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2466  HemY domain-containing protein  31.76 
 
 
395 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.618862  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1811  HemY-like  31.08 
 
 
395 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2423  HemY domain-containing protein  31.08 
 
 
395 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0160079  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2427  HemY domain-containing protein  31.08 
 
 
395 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399788  normal  0.263655 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2355  putative protein porphyrin biosynthesis  28.87 
 
 
397 aa  50.8  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.354187  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0874  HemY protein N-terminus family protein  31.76 
 
 
396 aa  51.2  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5750  HemY-like protein  31.08 
 
 
395 aa  50.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308333  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0047  porphyrin biosynthesis protein  20.8 
 
 
425 aa  50.1  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47570  HemY-like protein  25.43 
 
 
410 aa  49.7  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.825409  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3671  HemY, N-terminal  33.33 
 
 
394 aa  49.3  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0211  HemY domain-containing protein  26.51 
 
 
412 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0315  HemY domain-containing protein  24.75 
 
 
388 aa  48.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2569  HemY domain protein  28.92 
 
 
397 aa  47.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.538959  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1440  HemY domain protein  28.32 
 
 
397 aa  47.4  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.264703  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0032  HemY-like protein  22.32 
 
 
393 aa  46.6  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2164  HemY domain protein  28.87 
 
 
397 aa  46.6  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.757442  normal  0.301743 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0702  HemY, N-terminal:tetratricopeptide TPR_4  30.6 
 
 
396 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0286  HemY domain-containing protein  26.83 
 
 
641 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2092  lytic transglycosylase, catalytic  23.49 
 
 
720 aa  43.1  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>