60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1228 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1135  HemY domain-containing protein  96.93 
 
 		 389 aa  701    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1228  porphyrin biosynthesis protein  100 
 
 		 391 aa  791    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04231  porphyrin biosynthesis protein  55 
 
 		 418 aa  382  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0129  HemY domain protein  42.6 
 
 		 431 aa  266  5.999999999999999e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116978 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0115  HemY-like  26.17 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0505  HemY-like  29.37 
 
 		 427 aa  99.4  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.331612  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0026  HemY-like protein  27.94 
 
 		 390 aa  92  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3664  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 403 aa  89.7  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0059  HemY, N-terminal  27.67 
 
 		 414 aa  87  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0131  hemY protein, putative  27.99 
 
 		 414 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6003  HemY protein  29.14 
 
 		 412 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69420  putative enzyme of heme biosynthesis  28.83 
 
 		 412 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3062  hemY protein, putative  25.21 
 
 		 424 aa  80.9  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0032  HemY-like protein  24.67 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1028  HemY domain-containing protein  24.54 
 
 		 441 aa  77  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.791332  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2663  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  25.58 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2794  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  25.32 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2177  HemY  27.78 
 
 		 392 aa  70.1  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2204  hemY protein  27.78 
 
 		 392 aa  70.1  0.00000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.103218  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5484  HemY-like  25.79 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47570  HemY-like protein  26.98 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.825409  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0871  HemY domain-containing protein  31.78 
 
 		 395 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.724762 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3106  HemY-like protein  24.1 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.417009  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2466  HemY domain-containing protein  29.17 
 
 		 395 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.618862  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2565  putative protein porphyrin biosynthesis  30.97 
 
 		 390 aa  62.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2427  HemY domain-containing protein  29.58 
 
 		 395 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399788  normal  0.263655 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1811  HemY-like  29.58 
 
 		 395 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2687  HemY-like  27.41 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5750  HemY-like protein  31.01 
 
 		 395 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2332  HemY domain-containing protein  29.17 
 
 		 395 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.30446  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2423  HemY domain-containing protein  29.58 
 
 		 395 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0160079  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3409  hypothetical protein  27.66 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1071  HemY domain protein  22.99 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.62835 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2667  HemY domain-containing protein  23.12 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000205656 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0283  HemY domain-containing protein  27.96 
 
 		 415 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0189  HemY domain protein  28.16 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1080  putative hemY protein  31.11 
 
 		 396 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0211  HemY domain-containing protein  27.63 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1232  putative porphyrin biosynthesis related protein  31.11 
 
 		 396 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0214  HemY domain-containing protein  28.68 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2177  HemY domain-containing protein  29.01 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.000141397 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3003  hypothetical protein  30.37 
 
 		 396 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1074  HemY protein N-terminus family protein  30.37 
 
 		 396 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1594  hypothetical protein  30.37 
 
 		 396 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.672545  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2281  hypothetical protein  30.37 
 
 		 396 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0732  hypothetical protein  30.37 
 
 		 396 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3671  HemY, N-terminal  31.19 
 
 		 394 aa  55.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0874  HemY protein N-terminus family protein  30.37 
 
 		 396 aa  55.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0259  HemY domain-containing protein  27.23 
 
 		 412 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0339  HemY-like  25.81 
 
 		 393 aa  54.3  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3594  HemY domain-containing protein  20.62 
 
 		 409 aa  52.8  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2355  putative protein porphyrin biosynthesis  29.01 
 
 		 397 aa  49.7  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.354187  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  27.31 
 
 		 586 aa  49.3  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2569  HemY domain protein  29.77 
 
 		 397 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.538959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2164  HemY domain protein  29.77 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.757442  normal  0.301743 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0702  HemY, N-terminal:tetratricopeptide TPR_4  27.21 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  26.43 
 
 		 575 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2747  HemY-like protein  28.24 
 
 		 396 aa  43.9  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1440  HemY domain protein  20.43 
 
 		 397 aa  43.9  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.264703  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 		 556 aa  42.7  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>