284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0739 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0739  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
75 aa  156  1e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.725007 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  44.07 
 
 
397 aa  64.3  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 
927 aa  61.2  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  45.9 
 
 
543 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  40.3 
 
 
1276 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  40.85 
 
 
245 aa  58.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2934  tetratricopeptide TPR_2  43.55 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000970662  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.55 
 
 
836 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0504  TPR repeat-containing protein  38.24 
 
 
169 aa  57.8  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  36.07 
 
 
565 aa  56.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0535  TPR repeat-containing protein  36.51 
 
 
596 aa  56.6  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0120015  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  40 
 
 
623 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 
602 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1358  putative PAS/PAC sensor protein  36.84 
 
 
404 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.873442  normal  0.0258422 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1387  TPR repeat-containing protein  44.23 
 
 
333 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.316988  normal  0.93517 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  38.98 
 
 
562 aa  56.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  43.55 
 
 
589 aa  56.2  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  34.92 
 
 
329 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1622  TPR repeat-containing protein  36.92 
 
 
254 aa  55.1  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  38.71 
 
 
213 aa  54.3  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  44.23 
 
 
202 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  42.37 
 
 
560 aa  54.3  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4410  TPR repeat-containing protein  40 
 
 
360 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.204971  normal  0.0658159 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  38.46 
 
 
1067 aa  53.9  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 
344 aa  53.5  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  37.29 
 
 
713 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  38.98 
 
 
715 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  37.29 
 
 
162 aa  53.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2791  TPR repeat-containing protein  41.18 
 
 
243 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.185879 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3132  tetratricopeptide TPR_2  36.23 
 
 
134 aa  52.8  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.112593  hitchhiker  0.000898611 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  40.68 
 
 
1049 aa  53.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  38.81 
 
 
745 aa  53.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  42.37 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0124  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.25 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  38.98 
 
 
465 aa  52.4  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  37.29 
 
 
512 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  36.84 
 
 
635 aa  52.4  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1606  tetratricopeptide TPR_2  30.77 
 
 
240 aa  52.4  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  40.62 
 
 
1069 aa  52.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  38.98 
 
 
573 aa  52.4  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0990  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.140527 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  42.37 
 
 
244 aa  52.8  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.82 
 
 
632 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3449  TPR repeat-containing protein  38.33 
 
 
357 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.395031  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1850  TPR repeat-containing protein  38.89 
 
 
123 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  36.76 
 
 
213 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  34.43 
 
 
292 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1876  TPR repeat-containing protein  38.89 
 
 
123 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  39.06 
 
 
366 aa  52  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 
414 aa  51.6  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  38.6 
 
 
279 aa  51.2  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0908  TPR repeat-containing protein  38.33 
 
 
388 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  37.1 
 
 
4079 aa  50.8  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  42.31 
 
 
1297 aa  50.8  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0882  TPR repeat-containing protein  38.33 
 
 
388 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  36.36 
 
 
1013 aa  50.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  33.9 
 
 
743 aa  50.4  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  40.62 
 
 
292 aa  50.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  42 
 
 
4489 aa  50.4  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2379  hypothetical protein  37.1 
 
 
283 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  39.34 
 
 
467 aa  50.1  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  40.68 
 
 
1276 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  38.33 
 
 
716 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  34.43 
 
 
1007 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.06 
 
 
784 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2796  TPR repeat-containing protein  32.86 
 
 
621 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  35.62 
 
 
615 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  34.38 
 
 
564 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  41.54 
 
 
1694 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  38.98 
 
 
3560 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 
292 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  34.85 
 
 
1138 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  35.62 
 
 
740 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  37.29 
 
 
243 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  36.51 
 
 
375 aa  49.3  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  37.04 
 
 
643 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 
250 aa  49.3  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  36 
 
 
363 aa  48.9  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  37.29 
 
 
576 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3047  tetratricopeptide TPR_2  38.33 
 
 
508 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0595686  hitchhiker  0.00892549 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  35.59 
 
 
875 aa  48.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1000  TPR repeat-containing protein  35.59 
 
 
486 aa  48.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.326539  normal  0.768066 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3161  tetratricopeptide TPR_2  41.54 
 
 
444 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 
711 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1019  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
273 aa  47.8  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  30.88 
 
 
436 aa  47.4  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.65 
 
 
758 aa  47.4  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  35.59 
 
 
878 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2255  hypothetical protein  42.31 
 
 
191 aa  47.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319682  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3949  TPR repeat-containing protein  40.35 
 
 
361 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1983  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.07 
 
 
142 aa  47.4  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.2 
 
 
810 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0216  TPR repeat-containing protein  39.29 
 
 
296 aa  47  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  41.27 
 
 
523 aa  47  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2391  tetratricopeptide TPR_2  34.78 
 
 
211 aa  47  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  35 
 
 
452 aa  47  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0523  TPR repeat-containing protein  42.31 
 
 
302 aa  47  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.15246  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  35.59 
 
 
725 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  34.43 
 
 
270 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  35.94 
 
 
1061 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>