20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1289 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1289  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2124  hypothetical protein  44.26 
 
 		 204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.352318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2301  HupE/UreJ protein  35.57 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3799  HupE/UreJ protein  31.09 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.414571  normal  0.346057 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2438  HupE/UreJ protein  36.5 
 
 		 195 aa  51.6  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5001  HupE/UreJ protein  37.06 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.66529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2290  HupE/UreJ protein  35.51 
 
 		 192 aa  50.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202641  normal  0.223499 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1210  HupE/UreJ protein  35.29 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5111  hypothetical protein  27.72 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1158  HupE/UreJ protein  31.32 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160824  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5085  HupE/UreJ protein  41.07 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.893105  normal  0.0304442 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1763  HupE/UreJ protein  29.81 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.353058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2884  hypothetical protein  33.33 
 
 		 177 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.181441  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2682  HupE/UreJ protein  32.48 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.669277  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1184  HupE/UreJ protein  38 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0960  HupE/UreJ protein  31.98 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1164  HupE/UreJ protein  32.12 
 
 		 194 aa  42  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0333  HupE/UreJ protein  32 
 
 		 195 aa  42  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.836087  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1290  hypothetical protein  31.45 
 
 		 197 aa  42  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0362901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0830  urease accessory protein  31.58 
 
 		 202 aa  42  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.768034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>