17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2124 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2124  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  377  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.352318  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1289  hypothetical protein  43.72 
 
 
206 aa  127  9.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5111  hypothetical protein  36.36 
 
 
204 aa  79.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0830  urease accessory protein  31.03 
 
 
202 aa  49.7  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.768034  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3578  HupE/UreJ protein  32.9 
 
 
192 aa  48.5  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.567629  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1210  HupE/UreJ protein  38.69 
 
 
186 aa  47  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3799  HupE/UreJ protein  34.85 
 
 
198 aa  46.2  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.414571  normal  0.346057 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5001  HupE/UreJ protein  33.09 
 
 
192 aa  45.8  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.66529  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3969  HupE/UreJ protein  33.08 
 
 
192 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4085  HupE/UreJ protein  33.08 
 
 
192 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00450512 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3892  HupE/UreJ protein  33.08 
 
 
192 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00430028 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4304  hypothetical protein  32 
 
 
191 aa  45.4  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3991  HupE/UreJ protein  32.33 
 
 
192 aa  45.1  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0395  HupE/UreJ protein  31.61 
 
 
192 aa  45.1  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347304  normal  0.406165 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0396  HupE/UreJ protein  31.61 
 
 
192 aa  45.1  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3629  HupE/UreJ protein  30.97 
 
 
192 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0223294  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5110  HupE/UreJ protein  33.55 
 
 
199 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.774333  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>