90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5110 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5110  HupE/UreJ protein  100 
 
 
199 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.774333  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3799  HupE/UreJ protein  57.63 
 
 
198 aa  187  8e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.414571  normal  0.346057 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2123  HupE/UreJ protein  54.77 
 
 
203 aa  176  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.150292  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0830  urease accessory protein  53.49 
 
 
202 aa  166  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.768034  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1290  hypothetical protein  55.43 
 
 
197 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0362901  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5001  HupE/UreJ protein  48.04 
 
 
192 aa  137  8.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.66529  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3578  HupE/UreJ protein  47.16 
 
 
192 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.567629  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4125  urease accessory protein UreJ  42.31 
 
 
192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.4167 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0396  HupE/UreJ protein  46.02 
 
 
192 aa  135  5e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4304  hypothetical protein  45.45 
 
 
191 aa  135  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0395  HupE/UreJ protein  46.02 
 
 
192 aa  134  9e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347304  normal  0.406165 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3629  HupE/UreJ protein  45.45 
 
 
192 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0223294  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4085  HupE/UreJ protein  46.02 
 
 
192 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00450512 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3892  HupE/UreJ protein  46.02 
 
 
192 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00430028 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3969  HupE/UreJ protein  46.02 
 
 
192 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3991  HupE/UreJ protein  45.45 
 
 
192 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6126  HupE/UreJ protein  48.15 
 
 
199 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.549865  normal  0.331316 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3747  HupE/UreJ protein  50.6 
 
 
199 aa  124  9e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0479  hydrogenase/urease accessory protein  51.15 
 
 
166 aa  124  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230165  normal  0.16849 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6538  HupE/UreJ protein  50 
 
 
199 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436397  normal  0.193844 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0960  HupE/UreJ protein  41.9 
 
 
194 aa  124  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0164  nickel-iron hydrogenase, accessory protein  43.01 
 
 
192 aa  120  9e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1164  HupE/UreJ protein  41.04 
 
 
194 aa  118  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5085  HupE/UreJ protein  53.06 
 
 
202 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.893105  normal  0.0304442 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0327  HupE/UreJ protein  43.68 
 
 
191 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.994931  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0829  urease accessory protein  43.5 
 
 
222 aa  116  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0560  HupE/UreJ protein  46.45 
 
 
190 aa  115  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180214  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0663  HupE/UreJ protein  42.41 
 
 
190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.32608  normal  0.0353183 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3272  urease accessory protein UreJ  40.25 
 
 
194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1158  HupE/UreJ protein  47.62 
 
 
197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160824  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1763  HupE/UreJ protein  44.12 
 
 
188 aa  106  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.353058  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3268  urease accessory protein  46.85 
 
 
192 aa  105  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.232463  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2034  urease accessory UREJ transmembrane protein  44.51 
 
 
205 aa  105  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.357302 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4241  HupE/UreJ protein  41.58 
 
 
199 aa  105  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1166  HupE/UreJ protein  48.05 
 
 
194 aa  104  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.232797  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2188  HupE/UreJ protein  47.95 
 
 
199 aa  104  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3245  urease accessory protein UreJ  41.67 
 
 
195 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2281  HupE/UreJ protein  41.07 
 
 
203 aa  99  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2438  HupE/UreJ protein  43.72 
 
 
195 aa  99  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4912  urease accessory protein, putative  48.78 
 
 
190 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2290  HupE/UreJ protein  42.19 
 
 
192 aa  97.8  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202641  normal  0.223499 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0333  HupE/UreJ protein  42.93 
 
 
195 aa  97.4  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.836087  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5617  hypothetical protein  47.15 
 
 
190 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3527  HupE/UreJ protein  47.2 
 
 
197 aa  97.1  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.162722 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1863  HupE/UreJ protein  44.7 
 
 
205 aa  96.3  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.867351  normal  0.454948 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2876  HupE/UreJ protein  46.56 
 
 
194 aa  95.1  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2825  HupE/UreJ protein  39.69 
 
 
196 aa  94  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.324254  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5823  HupE/UreJ protein  47.97 
 
 
192 aa  92  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1973  HupE/UreJ protein  39.19 
 
 
196 aa  91.3  9e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.374971  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1210  HupE/UreJ protein  41.21 
 
 
186 aa  90.9  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2682  HupE/UreJ protein  41.04 
 
 
194 aa  90.5  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.669277  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64680  hypothetical protein  47.15 
 
 
190 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0396536  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0993  HupE/UreJ protein  42.59 
 
 
203 aa  89.4  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614894  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2301  HupE/UreJ protein  37.41 
 
 
201 aa  88.6  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4454  HupE/UreJ protein  48.53 
 
 
190 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0959  HupE/UreJ protein  38.67 
 
 
211 aa  87.4  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.355166  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1184  HupE/UreJ protein  39.47 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2186  HupE/UreJ protein  44.36 
 
 
205 aa  86.3  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.114509 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0886  HupE/UreJ protein  35.03 
 
 
194 aa  85.9  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.219262  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50400  HupE/UreJ protein  45.74 
 
 
187 aa  84.7  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0976  HupE/UreJ protein  43.67 
 
 
197 aa  84.7  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3803  HupE/UreJ protein  49.64 
 
 
192 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0577478  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2989  HupE/UreJ protein  39.84 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.231706  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3099  HupE/UreJ protein  36.59 
 
 
194 aa  79.3  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1195  HupE/UreJ protein  35.53 
 
 
210 aa  78.2  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.108904  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3100  HupE/UreJ protein  38.51 
 
 
199 aa  73.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1296  HupE/UreJ protein  38.82 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00297181  normal  0.49975 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4087  HupE/UreJ protein  37.18 
 
 
200 aa  69.7  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.248426  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1218  hypothetical protein  30.81 
 
 
208 aa  68.6  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0180  HupE/UreJ protein  42.5 
 
 
200 aa  67.8  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.683623  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3943  HupE/UreJ protein  47.46 
 
 
193 aa  67.4  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.788882  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2847  HupE/UreJ protein  38.73 
 
 
181 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.16808  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2842  HupE/UreJ protein  38.73 
 
 
181 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1265  urease accessory protein UreJ  35.95 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2419  HupE/UreJ protein  39.55 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00415524  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2933  HupE/UreJ protein  38.73 
 
 
181 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.629521  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2148  HupE/UreJ protein  36.05 
 
 
191 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.140678  normal  0.213077 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1374  membrane-bound hydrogenase component hupE  38.14 
 
 
194 aa  62.8  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00671086  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0497  HupE/UreJ accessory protein  36.05 
 
 
191 aa  62.8  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3374  hypothetical protein  31.95 
 
 
193 aa  62  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.215673  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2095  HupE/UreJ protein  31.53 
 
 
221 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2139  HupE/UreJ protein  31.03 
 
 
221 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4228  HupE/UreJ protein  32.73 
 
 
217 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2580  HupE/UreJ protein  38.1 
 
 
195 aa  55.1  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5052  HupE/UreJ protein  39.06 
 
 
211 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.864731  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1026  HupE/UreJ protein  31.82 
 
 
226 aa  49.7  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2124  hypothetical protein  34.94 
 
 
204 aa  47.8  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.352318  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3141  hypothetical protein  31.86 
 
 
210 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04450  nickel transporter for carbon monoxide dehydrogenase, HupE/UreJ family  42.86 
 
 
187 aa  44.3  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0761175  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1289  hypothetical protein  28.98 
 
 
206 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>