170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1535 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1535  Tetratricopeptide domain protein  100 
 
 		 322 aa  667    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148756  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1567  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.49 
 
 		 339 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00816314  normal  0.0470804 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4054  sporulation domain-containing protein  25.94 
 
 		 538 aa  60.5  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  27.13 
 
 		 1013 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  30.63 
 
 		 661 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25 
 
 		 1676 aa  56.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30.87 
 
 		 4079 aa  56.2  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  29.45 
 
 		 647 aa  55.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  26.34 
 
 		 936 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 		 827 aa  55.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  25.66 
 
 		 436 aa  55.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  28.99 
 
 		 837 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 2262 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.79 
 
 		 689 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 		 3560 aa  53.5  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  27.22 
 
 		 884 aa  53.1  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  33.65 
 
 		 1979 aa  53.1  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1972  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 		 255 aa  52.8  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0360  tetratricopeptide TPR_2  39.18 
 
 		 160 aa  52.8  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 		 465 aa  52.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.73 
 
 		 810 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  29.75 
 
 		 581 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 		 503 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1897  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 		 598 aa  50.4  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00502769  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 505 aa  50.4  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 3145 aa  50.4  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  23.67 
 
 		 730 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  31.9 
 
 		 266 aa  50.1  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 245 aa  50.1  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 620 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  19.89 
 
 		 1213 aa  50.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4604  protein kinase  29.1 
 
 		 545 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.82 
 
 		 917 aa  50.1  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0509436 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 543 aa  49.7  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 		 634 aa  49.7  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  25.11 
 
 		 714 aa  50.1  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 		 878 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  30 
 
 		 1694 aa  49.7  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 		 366 aa  49.7  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.64 
 
 		 557 aa  49.7  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  23.05 
 
 		 733 aa  49.7  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4174  serine/threonine protein kinase  27.06 
 
 		 990 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.957673  normal  0.29957 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.92 
 
 		 397 aa  49.3  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  26.59 
 
 		 374 aa  49.3  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 362 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  27.46 
 
 		 1138 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  22.83 
 
 		 614 aa  48.9  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 448 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  26.54 
 
 		 586 aa  48.1  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0786  TPR repeat-containing protein  31 
 
 		 364 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.300568  hitchhiker  0.00289108 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 739 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 		 685 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.18 
 
 		 1034 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0006  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.437171  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  23.57 
 
 		 243 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  28.39 
 
 		 620 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 		 4489 aa  47.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  29.68 
 
 		 639 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0699  TPR repeat-containing protein  22.46 
 
 		 563 aa  48.5  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000888687 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1428  TPR repeat-containing protein  33.86 
 
 		 413 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 		 767 aa  47.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.44 
 
 		 2240 aa  47.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  23.3 
 
 		 1077 aa  47.8  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 		 3035 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 		 1276 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  24.38 
 
 		 1005 aa  47.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 		 740 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  27.35 
 
 		 968 aa  47  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.78 
 
 		 265 aa  47.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  24.69 
 
 		 615 aa  47  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 202 aa  47.4  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 935 aa  47  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  25.78 
 
 		 265 aa  46.6  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  24.24 
 
 		 311 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  27.33 
 
 		 252 aa  46.6  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 		 715 aa  46.6  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 636 aa  46.6  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 593 aa  46.6  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 265 aa  46.2  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2282  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.26 
 
 		 433 aa  46.2  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.883499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 		 734 aa  46.2  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 		 1450 aa  46.2  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  25.78 
 
 		 2262 aa  46.2  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  24.69 
 
 		 591 aa  46.2  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2074  TPR repeat-containing protein  36.05 
 
 		 163 aa  45.8  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 776 aa  45.8  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0008  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 		 197 aa  45.8  0.0009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.508518  hitchhiker  0.000270685 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 		 605 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 		 612 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  34.52 
 
 		 503 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0823  TPR repeat-containing protein  23.6 
 
 		 502 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1144  tetratricopeptide TPR_2  36.59 
 
 		 282 aa  45.8  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.108694  normal  0.0543411 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2445  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 		 351 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0758357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2356  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.09 
 
 		 359 aa  45.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.337618  normal  0.0354802 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  22.54 
 
 		 1056 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  24.36 
 
 		 618 aa  45.4  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>