33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0366 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0366  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  238  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0436  tetratricopeptide domain-containing protein  87.5 
 
 		 120 aa  205  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.122916  hitchhiker  0.0000856563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0904  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  54.95 
 
 		 334 aa  104  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3081  hypothetical protein  48.11 
 
 		 107 aa  97.1  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298167  normal  0.458032 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2133  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  93.6  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.420216  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0578  hypothetical protein  50.98 
 
 		 106 aa  92.8  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.67116  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32270  hypothetical protein  50 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.265116  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0670  TPR repeat-containing protein  43.75 
 
 		 127 aa  85.5  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2037  hypothetical protein  43.36 
 
 		 154 aa  84.7  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0732088  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3305  hypothetical protein  45 
 
 		 108 aa  85.1  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4164  hypothetical protein  49.46 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0854  Tetratricopeptide domain protein  45.95 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.679313  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3982  DSBA oxidoreductase  44.68 
 
 		 328 aa  68.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5189  DSBA oxidoreductase  45.78 
 
 		 265 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6063  hypothetical protein  35.65 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1748  tetratricopeptide domain-containing protein  35.96 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00737181  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3151  hypothetical protein  40.7 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.876304 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2017  hypothetical protein  39.09 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.137477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5440  TPR repeat-containing protein  35.58 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3164  hypothetical protein  37.23 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0427407  normal  0.28931 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03140  hypothetical protein  43.96 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2165  TPR repeat-containing protein  34.82 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00018031  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1251  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.365631 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3016  tetratricopeptide domain-containing protein  35.59 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0349866  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1194  Tetratricopeptide domain protein  30.85 
 
 		 208 aa  45.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3215  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.11 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.17261 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.7 
 
 		 2240 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0823  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 		 502 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1578  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.47 
 
 		 602 aa  41.2  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000346283  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  27.66 
 
 		 883 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2973  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.17 
 
 		 493 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000338654  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11133  TPR repeat protein  23.91 
 
 		 417 aa  40.4  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.474145  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.67 
 
 		 264 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0224916  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>