53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2017 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2017  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  283  5e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.137477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6063  hypothetical protein  76.06 
 
 		 143 aa  215  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2165  TPR repeat-containing protein  69.17 
 
 		 137 aa  160  8.000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00018031  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1251  TPR repeat-containing protein  60.87 
 
 		 156 aa  137  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.365631 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1748  tetratricopeptide domain-containing protein  54.55 
 
 		 162 aa  123  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00737181  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3016  tetratricopeptide domain-containing protein  57.38 
 
 		 131 aa  120  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0349866  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5440  TPR repeat-containing protein  47.15 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3164  hypothetical protein  53.21 
 
 		 233 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0427407  normal  0.28931 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3151  hypothetical protein  53.38 
 
 		 146 aa  103  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.876304 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0366  hypothetical protein  39.09 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0436  tetratricopeptide domain-containing protein  38.89 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.122916  hitchhiker  0.0000856563 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3215  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.17261 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3305  hypothetical protein  37.08 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2133  hypothetical protein  36.25 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.420216  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2188  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.26 
 
 		 442 aa  54.3  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32270  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.265116  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3630  protein of unknown function DUF124  33.68 
 
 		 428 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3081  hypothetical protein  34.04 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298167  normal  0.458032 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3564  hypothetical protein  33.68 
 
 		 433 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3704  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.68 
 
 		 426 aa  48.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  28 
 
 		 1979 aa  47.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0854  Tetratricopeptide domain protein  32.67 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.679313  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 		 465 aa  47  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3982  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 328 aa  45.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  29.81 
 
 		 725 aa  45.4  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  36.67 
 
 		 326 aa  44.7  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2321  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 		 475 aa  45.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.084712  decreased coverage  0.00212856 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  36.17 
 
 		 739 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3097  hypothetical protein  32.26 
 
 		 933 aa  43.9  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.681672  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 280 aa  43.9  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2037  hypothetical protein  28.83 
 
 		 154 aa  43.5  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0732088  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 565 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 632 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00490  Pol II transcription elongation factor, putative  29.59 
 
 		 1186 aa  43.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.84309  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0666  Tetratricopeptide TPR_4  40.7 
 
 		 566 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 		 4079 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4146  tetratricopeptide TPR_2  31.96 
 
 		 203 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631366  normal  0.0399426 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4434  Tetratricopeptide domain protein  31.71 
 
 		 282 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0632  tetratricopeptide protein)  39.53 
 
 		 566 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1953  lytic transglycosylase catalytic  36.84 
 
 		 756 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2410  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 		 648 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2954  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 		 1104 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0678  extracellular ligand-binding receptor  27.35 
 
 		 1073 aa  41.6  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3685  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 495 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 1069 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  42.31 
 
 		 448 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.29 
 
 		 466 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  27.55 
 
 		 564 aa  40.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4690  transcriptional regulator domain protein  26.96 
 
 		 521 aa  40.4  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.347611  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1019  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 273 aa  40.8  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 1192 aa  40.8  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 		 1212 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 		 486 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>