More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4146 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4146  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 203 aa  414  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631366  normal  0.0399426 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1523  Tfp pilus assembly protein PilF-like protein  54.89 
 
 		 202 aa  204  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.546002  normal  0.0791762 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2398  TPR repeat-containing protein  44.69 
 
 		 287 aa  143  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  33.76 
 
 		 314 aa  81.6  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 		 878 aa  72  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3556  TPR repeat-containing protein  36.28 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  27.38 
 
 		 363 aa  68.9  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  30.46 
 
 		 465 aa  67.8  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  34.18 
 
 		 864 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.75 
 
 		 810 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 927 aa  67  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.88 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.104926  normal  0.485023 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 		 968 aa  65.5  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 685 aa  65.5  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  31.34 
 
 		 620 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  33.65 
 
 		 3145 aa  65.1  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 		 290 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 265 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  23.91 
 
 		 3172 aa  64.3  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 4079 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 520 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 750 aa  62.4  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  28.95 
 
 		 623 aa  62.4  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.06 
 
 		 2240 aa  62  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  32.48 
 
 		 681 aa  61.6  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 		 620 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  28.25 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 1276 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  30.34 
 
 		 436 aa  61.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  32.48 
 
 		 909 aa  60.1  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  25.33 
 
 		 1979 aa  60.1  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  28.34 
 
 		 3560 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  28.12 
 
 		 745 aa  60.5  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.12 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  30.57 
 
 		 560 aa  59.7  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 		 1192 aa  59.3  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  23.35 
 
 		 725 aa  59.7  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 		 612 aa  59.3  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  25.6 
 
 		 391 aa  59.3  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.62 
 
 		 836 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 716 aa  59.3  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 		 1827 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  24.67 
 
 		 562 aa  59.3  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  29.5 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.5 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 		 292 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 739 aa  58.2  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 1276 aa  58.2  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 1094 aa  58.2  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 		 523 aa  58.2  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.33 
 
 		 286 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  32.58 
 
 		 585 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.34 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 		 608 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 1069 aa  57.8  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  28.03 
 
 		 576 aa  57.8  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 		 714 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.63 
 
 		 1737 aa  57.4  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.15 
 
 		 880 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  35.35 
 
 		 780 aa  57.4  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.67 
 
 		 632 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 		 356 aa  57  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.31 
 
 		 466 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  26.57 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 		 466 aa  57  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.78 
 
 		 296 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  33.33 
 
 		 865 aa  56.6  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.86 
 
 		 465 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  29.82 
 
 		 816 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 935 aa  57  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.6 
 
 		 730 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 581 aa  56.2  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  29.33 
 
 		 626 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3333  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34116  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1509  tetratricopeptide TPR_2  27.87 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.78 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0115  Tetratricopeptide domain protein  33.33 
 
 		 409 aa  56.2  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  23.78 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  28.16 
 
 		 795 aa  55.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.2 
 
 		 689 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 		 435 aa  55.5  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1606  tetratricopeptide TPR_2  26.75 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1387  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 333 aa  55.5  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.316988  normal  0.93517 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2697  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000108911  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  31.87 
 
 		 603 aa  55.5  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  25.33 
 
 		 1013 aa  55.1  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  28.24 
 
 		 1077 aa  55.1  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 612 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 740 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3398  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 		 274 aa  54.7  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0527752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  22.88 
 
 		 635 aa  54.7  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  31.25 
 
 		 714 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 		 583 aa  54.7  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  31.96 
 
 		 417 aa  54.3  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  31.2 
 
 		 875 aa  54.3  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>