176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3982 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3982  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
328 aa  630  1e-179  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0904  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  57.54 
 
 
334 aa  332  5e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924628  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5189  DSBA oxidoreductase  49.53 
 
 
265 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258155  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  38 
 
 
235 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1267  frnE protein  36.2 
 
 
223 aa  105  9e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.454512  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0567  DSBA oxidoreductase  35.5 
 
 
244 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  35.43 
 
 
225 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0704  DSBA oxidoreductase  34.5 
 
 
235 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1261  DSBA oxidoreductase  36.52 
 
 
235 aa  98.6  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5431  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
213 aa  96.7  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3550  DSBA oxidoreductase  34.91 
 
 
220 aa  96.3  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.916573  normal  0.901837 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2174  DSBA oxidoreductase  34.62 
 
 
209 aa  95.9  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132146  hitchhiker  0.0000045366 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
231 aa  92.8  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1639  DSBA oxidoreductase  37.28 
 
 
250 aa  92  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1174  DSBA oxidoreductase  33.64 
 
 
239 aa  92  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.196548 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32270  hypothetical protein  54 
 
 
138 aa  87.8  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.265116  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4753  DSBA oxidoreductase  38.12 
 
 
219 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0020  DSBA oxidoreductase  37.38 
 
 
211 aa  88.2  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1057  DSBA oxidoreductase  33.49 
 
 
235 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0024  DSBA oxidoreductase  33.98 
 
 
211 aa  88.2  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1200  DSBA oxidoreductase  33.8 
 
 
237 aa  87.4  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153386  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0258  DSBA oxidoreductase  32.5 
 
 
208 aa  87.4  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0941  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 
240 aa  86.3  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.203124  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5000  DSBA oxidoreductase  27.59 
 
 
233 aa  85.9  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324442  normal  0.0420894 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2594  DSBA oxidoreductase  34.67 
 
 
212 aa  85.9  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  30.63 
 
 
243 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2694  DSBA oxidoreductase  30.23 
 
 
235 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01724  polyketide synthase  34.74 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4882  DSBA oxidoreductase  38.51 
 
 
229 aa  83.6  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  30 
 
 
243 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  32.26 
 
 
220 aa  83.2  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0308  FrnE protein  30 
 
 
243 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00686429  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4436  DSBA oxidoreductase  37.13 
 
 
239 aa  83.2  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1488  DSBA oxidoreductase  28.7 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2073  DSBA oxidoreductase  32.26 
 
 
256 aa  82  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.232317  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1347  DSBA oxidoreductase  29.25 
 
 
233 aa  82  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  30 
 
 
243 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0252  DSBA oxidoreductase  29.38 
 
 
243 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  30.63 
 
 
243 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3441  DSBA oxidoreductase  32.26 
 
 
215 aa  80.5  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  30 
 
 
243 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 
236 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  30.63 
 
 
230 aa  79.7  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3987  DSBA oxidoreductase  30.04 
 
 
228 aa  79.7  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3082  DSBA oxidoreductase  31.16 
 
 
216 aa  79.3  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  0.192023 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2343  DSBA oxidoreductase  32.88 
 
 
234 aa  79.3  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590857  normal  0.036783 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  28.79 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6638  DsbA oxidoreductase  33.64 
 
 
231 aa  79.3  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10938  DSBA-like thioredoxin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G06250)  29.35 
 
 
262 aa  79  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.487418  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2316  DSBA oxidoreductase  30.19 
 
 
221 aa  77.8  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2136  DSBA oxidoreductase  26.41 
 
 
213 aa  78.6  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.883465  normal  0.0421817 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0818  DSBA oxidoreductase  33.02 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0363  DSBA oxidoreductase  33.02 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0846  DSBA oxidoreductase  33.02 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96876  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01056  probable DSBA oxidoreductase  24.89 
 
 
211 aa  78.6  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0952  DSBA oxidoreductase  29.67 
 
 
219 aa  77.8  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.440606  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  29.25 
 
 
209 aa  78.2  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3008  DSBA oxidoreductase  29.74 
 
 
248 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2720  thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.06 
 
 
219 aa  77.4  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.162153 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1564  DsbA oxidoreductase  32.14 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0406976  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1148  DSBA oxidoreductase  26.6 
 
 
237 aa  77.4  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0738  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
244 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.122622 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0577  frnE protein, putative  26.17 
 
 
224 aa  76.3  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4948  DSBA oxidoreductase  29.26 
 
 
221 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.576797 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4106  DSBA oxidoreductase  33.18 
 
 
229 aa  76.3  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0543  dsba oxidoreductase  26.17 
 
 
224 aa  76.3  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0436  tetratricopeptide domain-containing protein  47.87 
 
 
120 aa  76.6  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.122916  hitchhiker  0.0000856563 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2493  dithiol-disulfide isomerase  25.23 
 
 
242 aa  76.3  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2296  DSBA oxidoreductase  29.09 
 
 
221 aa  76.3  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00720993  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1398  DSBA oxidoreductase  29.05 
 
 
237 aa  75.9  0.0000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394424  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22650  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  27.63 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.483834 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2391  putative DSBA oxidoreductase  27.95 
 
 
217 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3751  DSBA oxidoreductase  26.76 
 
 
222 aa  75.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0746  DSBA oxidoreductase  28.44 
 
 
215 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0670  TPR repeat-containing protein  49 
 
 
127 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2368  DSBA oxidoreductase  33 
 
 
203 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.919583  normal  0.0250813 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1557  putative DSBA oxidoreductase  31.31 
 
 
222 aa  75.9  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  30.3 
 
 
223 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.474005 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0721  DSBA oxidoreductase  33.02 
 
 
244 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874736  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0654  DSBA oxidoreductase  29.47 
 
 
220 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5500  DSBA oxidoreductase  27.91 
 
 
217 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.790496  normal  0.0537626 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2709  DSBA oxidoreductase  31.19 
 
 
214 aa  74.7  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.111017  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  26.64 
 
 
224 aa  74.7  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3756  DSBA oxidoreductase  30.56 
 
 
221 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.734213  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1700  DSBA oxidoreductase  27.63 
 
 
227 aa  73.9  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1083  DSBA oxidoreductase  26.36 
 
 
216 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.979731  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  30.54 
 
 
214 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18220  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  29.72 
 
 
218 aa  73.6  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3936  DSBA oxidoreductase  32.56 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.763999  hitchhiker  0.00370443 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  29 
 
 
223 aa  73.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0550  polyketide biosynthesis associated protein  25.73 
 
 
233 aa  73.2  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0633  DSBA oxidoreductase  28.99 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218426  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01681  hypothetical protein  28.44 
 
 
222 aa  72  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2133  hypothetical protein  38.14 
 
 
108 aa  72.4  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.420216  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1502  DSBA oxidoreductase  32 
 
 
214 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0283596 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1160  dithiol-disulfide isomerase  23.32 
 
 
223 aa  71.2  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000467454  hitchhiker  3.85744e-21 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1922  DSBA oxidoreductase  33.49 
 
 
218 aa  70.9  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  27.23 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4389  DSBA oxidoreductase  29.03 
 
 
221 aa  70.5  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0887682  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  25.54 
 
 
214 aa  70.1  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>