206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2493 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2493  dithiol-disulfide isomerase  100 
 
 
242 aa  508  1e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5000  DSBA oxidoreductase  55.56 
 
 
233 aa  279  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324442  normal  0.0420894 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2694  DSBA oxidoreductase  52.74 
 
 
235 aa  263  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  59.24 
 
 
209 aa  255  4e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1488  DSBA oxidoreductase  50.22 
 
 
234 aa  247  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0704  DSBA oxidoreductase  45.96 
 
 
235 aa  228  8e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2343  DSBA oxidoreductase  45.11 
 
 
234 aa  223  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590857  normal  0.036783 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1261  DSBA oxidoreductase  46.44 
 
 
235 aa  218  7.999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0567  DSBA oxidoreductase  43.32 
 
 
244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2073  DSBA oxidoreductase  42.44 
 
 
256 aa  208  6e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.232317  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1267  frnE protein  44.8 
 
 
223 aa  207  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.454512  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2136  DSBA oxidoreductase  46.15 
 
 
213 aa  205  4e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.883465  normal  0.0421817 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  40.85 
 
 
236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3550  DSBA oxidoreductase  43.69 
 
 
220 aa  194  8.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.916573  normal  0.901837 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1057  DSBA oxidoreductase  43.04 
 
 
235 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4882  DSBA oxidoreductase  42.33 
 
 
229 aa  188  5.999999999999999e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4436  DSBA oxidoreductase  38.75 
 
 
239 aa  182  4.0000000000000006e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2594  DSBA oxidoreductase  41.51 
 
 
212 aa  180  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0941  DSBA oxidoreductase  37.87 
 
 
240 aa  177  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.203124  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5431  DSBA oxidoreductase  41.31 
 
 
213 aa  177  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2174  DSBA oxidoreductase  39.05 
 
 
209 aa  176  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132146  hitchhiker  0.0000045366 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0550  polyketide biosynthesis associated protein  36.6 
 
 
233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  41.74 
 
 
230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18220  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  43.26 
 
 
218 aa  172  5e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  37.5 
 
 
235 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  38.17 
 
 
243 aa  168  8e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1639  DSBA oxidoreductase  40.16 
 
 
250 aa  168  8e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  38.3 
 
 
243 aa  167  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  37.76 
 
 
243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1893  DSBA oxidoreductase  39.42 
 
 
238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  37.34 
 
 
243 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3441  DSBA oxidoreductase  36.79 
 
 
215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  37.34 
 
 
243 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0308  FrnE protein  37.34 
 
 
243 aa  162  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00686429  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0363  DSBA oxidoreductase  35 
 
 
243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0846  DSBA oxidoreductase  35 
 
 
243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96876  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1200  DSBA oxidoreductase  38.46 
 
 
237 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153386  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0818  DSBA oxidoreductase  35 
 
 
243 aa  161  9e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0252  DSBA oxidoreductase  37.34 
 
 
243 aa  160  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0738  DSBA oxidoreductase  34.17 
 
 
244 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.122622 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0721  DSBA oxidoreductase  34.3 
 
 
244 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874736  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0258  DSBA oxidoreductase  38.76 
 
 
208 aa  157  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1174  DSBA oxidoreductase  37.32 
 
 
239 aa  155  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.196548 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3936  DSBA oxidoreductase  33.89 
 
 
270 aa  156  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.763999  hitchhiker  0.00370443 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1398  DSBA oxidoreductase  38.21 
 
 
237 aa  154  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394424  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2541  DSBA oxidoreductase  34.31 
 
 
247 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  38.94 
 
 
225 aa  150  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22550  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  39.81 
 
 
227 aa  150  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1148  DSBA oxidoreductase  34.44 
 
 
237 aa  150  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0326  DSBA oxidoreductase  37.26 
 
 
237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0591  DSBA oxidoreductase  36.07 
 
 
238 aa  146  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.699138  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  34.18 
 
 
231 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4148  DSBA oxidoreductase  34.58 
 
 
241 aa  143  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6638  DsbA oxidoreductase  34.19 
 
 
231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4753  DSBA oxidoreductase  37.81 
 
 
219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1700  DSBA oxidoreductase  35.68 
 
 
227 aa  139  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2368  DSBA oxidoreductase  36.32 
 
 
203 aa  136  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.919583  normal  0.0250813 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  32.58 
 
 
223 aa  135  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.474005 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  32.58 
 
 
223 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22650  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  30.51 
 
 
228 aa  133  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.483834 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2720  thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.92 
 
 
219 aa  132  6e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.162153 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1717  DSBA oxidoreductase  35.16 
 
 
221 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  31.65 
 
 
223 aa  128  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4177  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  30.23 
 
 
215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.743231  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1583  DSBA oxidoreductase  31.73 
 
 
210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  31.03 
 
 
221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3756  DSBA oxidoreductase  34.08 
 
 
221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.734213  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2795  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
207 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  30.95 
 
 
217 aa  125  5e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0416  putative dithiol-disulfide isomerase  28.77 
 
 
221 aa  125  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1083  DSBA oxidoreductase  32.58 
 
 
216 aa  125  5e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.979731  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0577  frnE protein, putative  31.78 
 
 
224 aa  124  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4106  DSBA oxidoreductase  35.27 
 
 
229 aa  124  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0543  dsba oxidoreductase  31.78 
 
 
224 aa  124  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1278  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 
222 aa  124  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000336164  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1605  DSBA oxidoreductase  30.23 
 
 
215 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  30.09 
 
 
224 aa  123  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1937  DSBA oxidoreductase  29.67 
 
 
222 aa  122  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0746  DSBA oxidoreductase  30.48 
 
 
215 aa  122  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3914  DSBA oxidoreductase  29.3 
 
 
215 aa  121  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0024  DSBA oxidoreductase  29.03 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01056  probable DSBA oxidoreductase  30.84 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5788  DSBA oxidoreductase  31.19 
 
 
215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0487063 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0020  DSBA oxidoreductase  31.43 
 
 
211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0979  DSBA oxidoreductase  28.91 
 
 
215 aa  119  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00033798  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7204  DSBA oxidoreductase  27.4 
 
 
221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1347  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
233 aa  119  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5468  hypothetical protein  35.29 
 
 
221 aa  118  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  30.59 
 
 
220 aa  118  9e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4389  DSBA oxidoreductase  30.49 
 
 
221 aa  118  9e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0887682  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0515  DSBA oxidoreductase  29.28 
 
 
221 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2709  DSBA oxidoreductase  29.17 
 
 
214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.111017  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2832  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 
213 aa  115  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84064  normal  0.0678708 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01724  polyketide synthase  34.62 
 
 
213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6424  DSBA oxidoreductase  27.91 
 
 
217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.450496 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  27.83 
 
 
214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2061  DSBA oxidoreductase  30.56 
 
 
215 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0728  DSBA oxidoreductase  28.51 
 
 
230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3082  DSBA oxidoreductase  29.19 
 
 
216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  0.192023 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0654  DSBA oxidoreductase  28.44 
 
 
220 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>