204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5788 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5788  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 215 aa  444  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487063 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1605  DSBA oxidoreductase  74.3 
 
 		 215 aa  343  8e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6424  DSBA oxidoreductase  69.52 
 
 		 217 aa  317  7e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.450496 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0416  putative dithiol-disulfide isomerase  67.14 
 
 		 221 aa  309  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7204  DSBA oxidoreductase  67.62 
 
 		 221 aa  309  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1948  DSBA oxidoreductase  68.1 
 
 		 216 aa  287  9e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4177  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  51.63 
 
 		 215 aa  229  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.743231  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2061  DSBA oxidoreductase  51.18 
 
 		 215 aa  227  9e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3008  DSBA oxidoreductase  51.38 
 
 		 248 aa  227  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2296  DSBA oxidoreductase  50.46 
 
 		 221 aa  226  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00720993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3914  DSBA oxidoreductase  51.63 
 
 		 215 aa  225  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0115  DSBA oxidoreductase  53.05 
 
 		 232 aa  225  3e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.133072  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1564  DsbA oxidoreductase  51.71 
 
 		 212 aa  222  3e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0406976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3598  DSBA oxidoreductase  50.69 
 
 		 220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.432657 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  47.17 
 
 		 214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3318  DSBA oxidoreductase  51.17 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3751  DSBA oxidoreductase  46.73 
 
 		 222 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3987  DSBA oxidoreductase  54.03 
 
 		 228 aa  208  5e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0515  DSBA oxidoreductase  44.24 
 
 		 221 aa  206  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0261  DSBA oxidoreductase  51.42 
 
 		 213 aa  205  4e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0132035 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0654  DSBA oxidoreductase  47.2 
 
 		 220 aa  199  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0633  DSBA oxidoreductase  46.73 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218426  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1642  DSBA oxidoreductase  43.93 
 
 		 218 aa  194  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.420211  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1083  DSBA oxidoreductase  40.28 
 
 		 216 aa  178  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.979731  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2720  thiol:disulfide interchange protein DsbA  40.57 
 
 		 219 aa  178  4.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.162153 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  37.09 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0746  DSBA oxidoreductase  38.6 
 
 		 215 aa  167  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0970  DSBA oxidoreductase  40.57 
 
 		 216 aa  161  9e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227612 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1937  DSBA oxidoreductase  38.76 
 
 		 222 aa  161  9e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  38.68 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01056  probable DSBA oxidoreductase  38.94 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1557  putative DSBA oxidoreductase  40 
 
 		 222 aa  159  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0728  DSBA oxidoreductase  39.35 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0210  DSBA oxidoreductase  38.76 
 
 		 213 aa  155  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1100  hypothetical protein  39.15 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0577  frnE protein, putative  37.5 
 
 		 224 aa  145  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0543  dsba oxidoreductase  37.5 
 
 		 224 aa  145  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1347  DSBA oxidoreductase  38.32 
 
 		 233 aa  144  9e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1700  DSBA oxidoreductase  36.74 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0963  DSBA oxidoreductase  36.87 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0391729  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  36.62 
 
 		 236 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2316  DSBA oxidoreductase  36.57 
 
 		 221 aa  138  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1502  DSBA oxidoreductase  37.68 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0283596 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  35.19 
 
 		 223 aa  135  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  34.86 
 
 		 223 aa  135  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.474005 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  35.24 
 
 		 209 aa  135  7.000000000000001e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  35.02 
 
 		 224 aa  134  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  33.94 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2832  DSBA oxidoreductase  35.24 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84064  normal  0.0678708 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4389  DSBA oxidoreductase  36.23 
 
 		 221 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0887682  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  31.65 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1441  DSBA oxidoreductase  36.45 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0402577 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  35.1 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  31.78 
 
 		 221 aa  129  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3082  DSBA oxidoreductase  35.58 
 
 		 216 aa  129  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  0.192023 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  35.24 
 
 		 235 aa  128  8.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2852  polyketide biosynthesis associated protein  36.92 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3441  DSBA oxidoreductase  34.42 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0952  DSBA oxidoreductase  34.78 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.440606  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  33.65 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  33.33 
 
 		 243 aa  125  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1057  DSBA oxidoreductase  35.38 
 
 		 235 aa  125  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22650  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  36.15 
 
 		 228 aa  125  7e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.483834 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5468  hypothetical protein  34.93 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2694  DSBA oxidoreductase  32.5 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2493  dithiol-disulfide isomerase  31.19 
 
 		 242 aa  122  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  33.18 
 
 		 243 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0308  FrnE protein  32.86 
 
 		 243 aa  122  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00686429  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1717  DSBA oxidoreductase  34.3 
 
 		 221 aa  121  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  32.7 
 
 		 243 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  32.7 
 
 		 243 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0252  DSBA oxidoreductase  32.23 
 
 		 243 aa  119  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  31.55 
 
 		 225 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2073  DSBA oxidoreductase  33.96 
 
 		 256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.232317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0567  DSBA oxidoreductase  29.58 
 
 		 244 aa  118  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  35.98 
 
 		 230 aa  118  6e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1893  DSBA oxidoreductase  34.45 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3756  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.734213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1261  DSBA oxidoreductase  32.88 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5000  DSBA oxidoreductase  30.05 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324442  normal  0.0420894 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18220  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  33.18 
 
 		 218 aa  115  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0550  polyketide biosynthesis associated protein  33.8 
 
 		 233 aa  115  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0941  DSBA oxidoreductase  33.01 
 
 		 240 aa  114  7.999999999999999e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.203124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6638  DsbA oxidoreductase  33.33 
 
 		 231 aa  114  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1922  DSBA oxidoreductase  37.44 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22550  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  37 
 
 		 227 aa  113  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1488  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4753  DSBA oxidoreductase  34.62 
 
 		 219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1034  DSBA oxidoreductase  35.05 
 
 		 215 aa  112  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0024  DSBA oxidoreductase  33.96 
 
 		 211 aa  112  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2136  DSBA oxidoreductase  30.33 
 
 		 213 aa  111  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.883465  normal  0.0421817 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0704  DSBA oxidoreductase  28.1 
 
 		 235 aa  111  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1583  DSBA oxidoreductase  34.15 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0258  DSBA oxidoreductase  30.77 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1542  DSBA oxidoreductase  34.42 
 
 		 224 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2594  DSBA oxidoreductase  33.65 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0326  DSBA oxidoreductase  34.3 
 
 		 237 aa  108  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0738  DSBA oxidoreductase  29.76 
 
 		 244 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122622 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0591  DSBA oxidoreductase  31.16 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.699138  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1174  DSBA oxidoreductase  34.78 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.196548 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>