204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0210 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0210  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 213 aa  438  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1937  DSBA oxidoreductase  55.34 
 
 		 222 aa  257  1e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  52.88 
 
 		 217 aa  245  4e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0970  DSBA oxidoreductase  51.69 
 
 		 216 aa  221  9e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227612 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1083  DSBA oxidoreductase  48.31 
 
 		 216 aa  218  6e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.979731  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2720  thiol:disulfide interchange protein DsbA  46.01 
 
 		 219 aa  202  3e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.162153 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0746  DSBA oxidoreductase  45.41 
 
 		 215 aa  201  5e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4177  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  46.45 
 
 		 215 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.743231  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3914  DSBA oxidoreductase  46.38 
 
 		 215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1100  hypothetical protein  45.71 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01056  probable DSBA oxidoreductase  47.57 
 
 		 211 aa  194  7e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  40.67 
 
 		 214 aa  186  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3598  DSBA oxidoreductase  43.52 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.432657 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3008  DSBA oxidoreductase  44.44 
 
 		 248 aa  184  8e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0728  DSBA oxidoreductase  46.48 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0515  DSBA oxidoreductase  40.38 
 
 		 221 aa  181  9.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0654  DSBA oxidoreductase  42.52 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0633  DSBA oxidoreductase  42.06 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218426  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3751  DSBA oxidoreductase  39.44 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2061  DSBA oxidoreductase  41.35 
 
 		 215 aa  169  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1564  DsbA oxidoreductase  43.87 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0406976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1948  DSBA oxidoreductase  46.45 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7204  DSBA oxidoreductase  41.55 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2296  DSBA oxidoreductase  39.53 
 
 		 221 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00720993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3987  DSBA oxidoreductase  43.13 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0416  putative dithiol-disulfide isomerase  40.58 
 
 		 221 aa  159  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3318  DSBA oxidoreductase  40.47 
 
 		 227 aa  158  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6424  DSBA oxidoreductase  40.1 
 
 		 217 aa  157  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.450496 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0115  DSBA oxidoreductase  37.85 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.133072  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  39.71 
 
 		 214 aa  155  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0261  DSBA oxidoreductase  36.49 
 
 		 213 aa  152  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0132035 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0963  DSBA oxidoreductase  42.06 
 
 		 230 aa  151  8.999999999999999e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0391729  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  39.15 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1605  DSBA oxidoreductase  40.87 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1642  DSBA oxidoreductase  36.45 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.420211  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5788  DSBA oxidoreductase  38.76 
 
 		 215 aa  145  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487063 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1557  putative DSBA oxidoreductase  33.65 
 
 		 222 aa  138  7.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1347  DSBA oxidoreductase  33.5 
 
 		 233 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02591  hypothetical protein  41.07 
 
 		 355 aa  134  9e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  35.24 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  35.71 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  35.85 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.474005 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  35.71 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  35.71 
 
 		 243 aa  132  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  36.67 
 
 		 223 aa  132  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2316  DSBA oxidoreductase  34.3 
 
 		 221 aa  132  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0252  DSBA oxidoreductase  35.02 
 
 		 243 aa  132  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  34.26 
 
 		 243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1502  DSBA oxidoreductase  35.58 
 
 		 214 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0283596 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0308  FrnE protein  35.24 
 
 		 243 aa  132  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00686429  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2709  DSBA oxidoreductase  34.45 
 
 		 214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.111017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1398  DSBA oxidoreductase  36.45 
 
 		 237 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394424  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  34.12 
 
 		 223 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  36.55 
 
 		 220 aa  128  6e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0258  DSBA oxidoreductase  34.76 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01681  hypothetical protein  40.1 
 
 		 222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2832  DSBA oxidoreductase  32.54 
 
 		 213 aa  125  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84064  normal  0.0678708 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3756  DSBA oxidoreductase  35.27 
 
 		 221 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.734213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5468  hypothetical protein  36.23 
 
 		 221 aa  125  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  32.86 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1441  DSBA oxidoreductase  35.89 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0402577 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0577  frnE protein, putative  31.9 
 
 		 224 aa  122  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1717  DSBA oxidoreductase  34.78 
 
 		 221 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2073  DSBA oxidoreductase  38.6 
 
 		 256 aa  122  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.232317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4389  DSBA oxidoreductase  36.71 
 
 		 221 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0887682  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6638  DsbA oxidoreductase  39.72 
 
 		 231 aa  122  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0543  dsba oxidoreductase  31.9 
 
 		 224 aa  122  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2852  polyketide biosynthesis associated protein  34.13 
 
 		 214 aa  121  7e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  33.18 
 
 		 236 aa  121  9e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  31.75 
 
 		 209 aa  121  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2795  DSBA oxidoreductase  35.89 
 
 		 207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2694  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 235 aa  118  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3082  DSBA oxidoreductase  32.37 
 
 		 216 aa  116  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  0.192023 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1583  DSBA oxidoreductase  35.58 
 
 		 210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1034  DSBA oxidoreductase  34.63 
 
 		 215 aa  115  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0024  DSBA oxidoreductase  35.61 
 
 		 211 aa  114  8.999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1700  DSBA oxidoreductase  32.38 
 
 		 227 aa  114  8.999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0941  DSBA oxidoreductase  34.18 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.203124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5000  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 		 233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324442  normal  0.0420894 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  34.56 
 
 		 235 aa  112  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1057  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 235 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  36.67 
 
 		 225 aa  111  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0550  polyketide biosynthesis associated protein  34.69 
 
 		 233 aa  108  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  31.73 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3550  DSBA oxidoreductase  35.92 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.916573  normal  0.901837 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4753  DSBA oxidoreductase  35.2 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1542  DSBA oxidoreductase  37.14 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1261  DSBA oxidoreductase  35.45 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4436  DSBA oxidoreductase  35.68 
 
 		 239 aa  105  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2174  DSBA oxidoreductase  34.63 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132146  hitchhiker  0.0000045366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2368  DSBA oxidoreductase  32.35 
 
 		 203 aa  105  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.919583  normal  0.0250813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2594  DSBA oxidoreductase  32.54 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2136  DSBA oxidoreductase  31.1 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.883465  normal  0.0421817 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3961  DSBA oxidoreductase  35.16 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1174  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.196548 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1200  DSBA oxidoreductase  33.5 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1922  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1148  DSBA oxidoreductase  30.28 
 
 		 237 aa  102  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0020  DSBA oxidoreductase  34.8 
 
 		 211 aa  101  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01724  polyketide synthase  34.95 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>