215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1502 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1502  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
214 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0283596 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1441  DSBA oxidoreductase  89.25 
 
 
214 aa  360  9e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0402577 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2852  polyketide biosynthesis associated protein  88.79 
 
 
214 aa  358  3e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1347  DSBA oxidoreductase  64.42 
 
 
233 aa  293  2e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1557  putative DSBA oxidoreductase  65.55 
 
 
222 aa  287  8e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2316  DSBA oxidoreductase  63.64 
 
 
221 aa  280  1e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0952  DSBA oxidoreductase  56.04 
 
 
219 aa  244  6e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.440606  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  41.51 
 
 
223 aa  177  8e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  41.63 
 
 
223 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3082  DSBA oxidoreductase  41.46 
 
 
216 aa  174  7e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  0.192023 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  41.63 
 
 
223 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.474005 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  39.23 
 
 
221 aa  171  6.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0577  frnE protein, putative  41.35 
 
 
224 aa  171  9e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0543  dsba oxidoreductase  41.35 
 
 
224 aa  171  9e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  40.87 
 
 
224 aa  169  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5468  hypothetical protein  39.44 
 
 
221 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4389  DSBA oxidoreductase  39.91 
 
 
221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0887682  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1717  DSBA oxidoreductase  41.58 
 
 
221 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1700  DSBA oxidoreductase  40.82 
 
 
227 aa  157  8e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1564  DsbA oxidoreductase  39.81 
 
 
212 aa  157  9e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0406976  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1542  DSBA oxidoreductase  43.72 
 
 
224 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1583  DSBA oxidoreductase  42.36 
 
 
210 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0261  DSBA oxidoreductase  39.34 
 
 
213 aa  153  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0132035 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1034  DSBA oxidoreductase  38.6 
 
 
215 aa  151  7e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  37.02 
 
 
217 aa  150  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1937  DSBA oxidoreductase  37.44 
 
 
222 aa  149  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2709  DSBA oxidoreductase  39.6 
 
 
214 aa  149  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.111017  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3756  DSBA oxidoreductase  38.5 
 
 
221 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.734213  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1922  DSBA oxidoreductase  38.81 
 
 
218 aa  147  9e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0970  DSBA oxidoreductase  35.75 
 
 
216 aa  147  9e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227612 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2795  DSBA oxidoreductase  40.98 
 
 
207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01681  hypothetical protein  41.87 
 
 
222 aa  146  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  38.78 
 
 
220 aa  144  7.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2832  DSBA oxidoreductase  34.29 
 
 
213 aa  141  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84064  normal  0.0678708 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2061  DSBA oxidoreductase  34.76 
 
 
215 aa  140  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3008  DSBA oxidoreductase  37.61 
 
 
248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7204  DSBA oxidoreductase  37.8 
 
 
221 aa  139  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0024  DSBA oxidoreductase  42.13 
 
 
211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  38.76 
 
 
209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0416  putative dithiol-disulfide isomerase  36.74 
 
 
221 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2296  DSBA oxidoreductase  34.26 
 
 
221 aa  136  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00720993  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6424  DSBA oxidoreductase  37.04 
 
 
217 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.450496 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3751  DSBA oxidoreductase  34.45 
 
 
222 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3914  DSBA oxidoreductase  34.91 
 
 
215 aa  134  8e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4177  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  36.36 
 
 
215 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.743231  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0515  DSBA oxidoreductase  29.25 
 
 
221 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  34.13 
 
 
214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0728  DSBA oxidoreductase  35.94 
 
 
230 aa  132  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0210  DSBA oxidoreductase  35.58 
 
 
213 aa  132  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  35.35 
 
 
231 aa  132  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2195  DSBA oxidoreductase  37.37 
 
 
215 aa  132  6e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0115  DSBA oxidoreductase  36.07 
 
 
232 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.133072  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3318  DSBA oxidoreductase  35.07 
 
 
227 aa  131  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6638  DsbA oxidoreductase  38.97 
 
 
231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0654  DSBA oxidoreductase  35.81 
 
 
220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3598  DSBA oxidoreductase  37.85 
 
 
220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.432657 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5788  DSBA oxidoreductase  37.68 
 
 
215 aa  129  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0487063 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1083  DSBA oxidoreductase  35.1 
 
 
216 aa  128  6e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.979731  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3961  DSBA oxidoreductase  40.59 
 
 
222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0746  DSBA oxidoreductase  33.81 
 
 
215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0967  DSBA oxidoreductase  36.97 
 
 
220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.431519  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0633  DSBA oxidoreductase  35.35 
 
 
220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218426  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1948  DSBA oxidoreductase  38.28 
 
 
216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0020  DSBA oxidoreductase  40.1 
 
 
211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01056  probable DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 
211 aa  125  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3825  DSBA oxidoreductase  35.2 
 
 
217 aa  125  5e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0328358 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  36.54 
 
 
225 aa  125  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4948  DSBA oxidoreductase  36.74 
 
 
221 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.576797 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0963  DSBA oxidoreductase  35.59 
 
 
230 aa  124  8.000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0391729  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1100  hypothetical protein  31.1 
 
 
217 aa  124  8.000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  30.92 
 
 
214 aa  123  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  32.72 
 
 
236 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2720  thiol:disulfide interchange protein DsbA  33.97 
 
 
219 aa  123  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.162153 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1605  DSBA oxidoreductase  34.78 
 
 
215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0796  DSBA oxidoreductase  35.51 
 
 
221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5000  DSBA oxidoreductase  32.7 
 
 
233 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324442  normal  0.0420894 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22550  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  36.45 
 
 
227 aa  118  4.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1174  DSBA oxidoreductase  36.36 
 
 
239 aa  115  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.196548 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  30.13 
 
 
243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4436  DSBA oxidoreductase  37.33 
 
 
239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3987  DSBA oxidoreductase  36.45 
 
 
228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1642  DSBA oxidoreductase  29.05 
 
 
218 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.420211  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1200  DSBA oxidoreductase  36.97 
 
 
237 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153386  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1917  DSBA oxidoreductase  33.65 
 
 
217 aa  112  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  30.66 
 
 
243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5500  DSBA oxidoreductase  37.62 
 
 
217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.790496  normal  0.0537626 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4882  DSBA oxidoreductase  37.68 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  30.13 
 
 
243 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2391  putative DSBA oxidoreductase  37.5 
 
 
217 aa  109  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  29.69 
 
 
243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  29.69 
 
 
243 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1057  DSBA oxidoreductase  33.97 
 
 
235 aa  108  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0258  DSBA oxidoreductase  30.14 
 
 
208 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0308  FrnE protein  29.26 
 
 
243 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00686429  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01724  polyketide synthase  36.68 
 
 
213 aa  107  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2694  DSBA oxidoreductase  32.84 
 
 
235 aa  107  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2073  DSBA oxidoreductase  32.69 
 
 
256 aa  107  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.232317  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0567  DSBA oxidoreductase  31.73 
 
 
244 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1488  DSBA oxidoreductase  36.87 
 
 
234 aa  106  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0252  DSBA oxidoreductase  29.26 
 
 
243 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>