205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2852 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2852  polyketide biosynthesis associated protein  100 
 
 		 214 aa  433  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1441  DSBA oxidoreductase  97.2 
 
 		 214 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0402577 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1502  DSBA oxidoreductase  88.79 
 
 		 214 aa  373  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0283596 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1347  DSBA oxidoreductase  66.67 
 
 		 233 aa  302  2.0000000000000002e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1557  putative DSBA oxidoreductase  66.99 
 
 		 222 aa  291  4e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2316  DSBA oxidoreductase  62.98 
 
 		 221 aa  278  4e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0952  DSBA oxidoreductase  54.07 
 
 		 219 aa  236  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.440606  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  44.6 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3082  DSBA oxidoreductase  43.9 
 
 		 216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  0.192023 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  42.45 
 
 		 223 aa  178  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  42.45 
 
 		 223 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.474005 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  40.57 
 
 		 221 aa  174  7e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0577  frnE protein, putative  43.27 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0543  dsba oxidoreductase  43.27 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  41.83 
 
 		 224 aa  171  7.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5468  hypothetical protein  39.13 
 
 		 221 aa  159  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4389  DSBA oxidoreductase  38.5 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0887682  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1034  DSBA oxidoreductase  40.47 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1717  DSBA oxidoreductase  40.59 
 
 		 221 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1700  DSBA oxidoreductase  38.39 
 
 		 227 aa  155  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1542  DSBA oxidoreductase  43.72 
 
 		 224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2709  DSBA oxidoreductase  42.08 
 
 		 214 aa  154  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.111017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1583  DSBA oxidoreductase  42.36 
 
 		 210 aa  152  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0261  DSBA oxidoreductase  39.34 
 
 		 213 aa  152  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0132035 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  40.82 
 
 		 220 aa  151  7e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2795  DSBA oxidoreductase  40.2 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1922  DSBA oxidoreductase  38.81 
 
 		 218 aa  149  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1564  DsbA oxidoreductase  39.05 
 
 		 212 aa  148  8e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0406976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0024  DSBA oxidoreductase  43.01 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0970  DSBA oxidoreductase  36.71 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227612 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  36.54 
 
 		 217 aa  145  6e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3756  DSBA oxidoreductase  39.11 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.734213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1937  DSBA oxidoreductase  34.6 
 
 		 222 aa  142  6e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7204  DSBA oxidoreductase  39.05 
 
 		 221 aa  141  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0416  putative dithiol-disulfide isomerase  38.43 
 
 		 221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  37.21 
 
 		 231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2832  DSBA oxidoreductase  35.27 
 
 		 213 aa  138  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84064  normal  0.0678708 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4177  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  35.89 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.743231  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0020  DSBA oxidoreductase  41.97 
 
 		 211 aa  135  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2061  DSBA oxidoreductase  34.43 
 
 		 215 aa  135  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01681  hypothetical protein  38.42 
 
 		 222 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3961  DSBA oxidoreductase  43.07 
 
 		 222 aa  134  9e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3008  DSBA oxidoreductase  36.07 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2296  DSBA oxidoreductase  33.94 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00720993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  37.2 
 
 		 209 aa  134  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0515  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6424  DSBA oxidoreductase  36.57 
 
 		 217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.450496 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  34.76 
 
 		 214 aa  132  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3751  DSBA oxidoreductase  33.96 
 
 		 222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6638  DsbA oxidoreductase  39.44 
 
 		 231 aa  131  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0746  DSBA oxidoreductase  35.07 
 
 		 215 aa  131  9e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3914  DSBA oxidoreductase  34.93 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5788  DSBA oxidoreductase  37.09 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487063 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4948  DSBA oxidoreductase  37.25 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.576797 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0115  DSBA oxidoreductase  35.45 
 
 		 232 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.133072  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01056  probable DSBA oxidoreductase  31.82 
 
 		 211 aa  126  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2720  thiol:disulfide interchange protein DsbA  34.93 
 
 		 219 aa  126  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.162153 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2195  DSBA oxidoreductase  36.87 
 
 		 215 aa  125  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0728  DSBA oxidoreductase  36.65 
 
 		 230 aa  125  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1948  DSBA oxidoreductase  38.1 
 
 		 216 aa  125  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0967  DSBA oxidoreductase  37.98 
 
 		 220 aa  125  6e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.431519  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0654  DSBA oxidoreductase  35.35 
 
 		 220 aa  124  8.000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3598  DSBA oxidoreductase  36.74 
 
 		 220 aa  124  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.432657 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0796  DSBA oxidoreductase  37.38 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  37.8 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0210  DSBA oxidoreductase  34.13 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  34.45 
 
 		 236 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1605  DSBA oxidoreductase  35.07 
 
 		 215 aa  122  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3318  DSBA oxidoreductase  33.96 
 
 		 227 aa  122  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1083  DSBA oxidoreductase  34.6 
 
 		 216 aa  121  6e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.979731  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  32.23 
 
 		 214 aa  121  8e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0633  DSBA oxidoreductase  34.88 
 
 		 220 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218426  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01724  polyketide synthase  40.2 
 
 		 213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0963  DSBA oxidoreductase  35.32 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0391729  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3825  DSBA oxidoreductase  33.67 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0328358 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1642  DSBA oxidoreductase  30.95 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.420211  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2391  putative DSBA oxidoreductase  38.89 
 
 		 217 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1917  DSBA oxidoreductase  35.03 
 
 		 217 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3987  DSBA oxidoreductase  38.25 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1100  hypothetical protein  29.81 
 
 		 217 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5500  DSBA oxidoreductase  39.9 
 
 		 217 aa  115  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.790496  normal  0.0537626 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22550  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  37.56 
 
 		 227 aa  115  6.9999999999999995e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0567  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 		 244 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1174  DSBA oxidoreductase  35.89 
 
 		 239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.196548 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  33.8 
 
 		 230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  31 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4436  DSBA oxidoreductase  36.74 
 
 		 239 aa  112  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1200  DSBA oxidoreductase  36.02 
 
 		 237 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5000  DSBA oxidoreductase  32.68 
 
 		 233 aa  111  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324442  normal  0.0420894 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  31 
 
 		 243 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0704  DSBA oxidoreductase  32.21 
 
 		 235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3441  DSBA oxidoreductase  37.5 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  31 
 
 		 243 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  30.57 
 
 		 243 aa  108  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0308  FrnE protein  30.57 
 
 		 243 aa  108  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00686429  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  30.57 
 
 		 243 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0258  DSBA oxidoreductase  32.18 
 
 		 208 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1398  DSBA oxidoreductase  33.49 
 
 		 237 aa  108  8.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394424  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2816  DSBA oxidoreductase  34.26 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610355 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18220  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  36.36 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>