203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3756 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3756  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 221 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.734213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1717  DSBA oxidoreductase  90.5 
 
 		 221 aa  411  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4389  DSBA oxidoreductase  79.19 
 
 		 221 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0887682  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5468  hypothetical protein  77.38 
 
 		 221 aa  353  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1542  DSBA oxidoreductase  72.2 
 
 		 224 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1557  putative DSBA oxidoreductase  44.02 
 
 		 222 aa  178  5.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  42.92 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1922  DSBA oxidoreductase  41.75 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  42.92 
 
 		 223 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.474005 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  42.01 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3082  DSBA oxidoreductase  40 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  0.192023 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0577  frnE protein, putative  41.9 
 
 		 224 aa  161  6e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1700  DSBA oxidoreductase  39.25 
 
 		 227 aa  161  6e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0543  dsba oxidoreductase  41.9 
 
 		 224 aa  161  6e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  39.82 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1347  DSBA oxidoreductase  37.85 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  38.86 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1034  DSBA oxidoreductase  41.04 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2709  DSBA oxidoreductase  38.24 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.111017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1083  DSBA oxidoreductase  37.09 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.979731  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2316  DSBA oxidoreductase  36.36 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3550  DSBA oxidoreductase  42.38 
 
 		 220 aa  148  6e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.916573  normal  0.901837 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3914  DSBA oxidoreductase  40.95 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1502  DSBA oxidoreductase  38.5 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0283596 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01056  probable DSBA oxidoreductase  35.85 
 
 		 211 aa  145  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  36.7 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5431  DSBA oxidoreductase  41.04 
 
 		 213 aa  142  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4177  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  39.05 
 
 		 215 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.743231  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  38.28 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0024  DSBA oxidoreductase  39.34 
 
 		 211 aa  138  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0115  DSBA oxidoreductase  37.85 
 
 		 232 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.133072  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1937  DSBA oxidoreductase  35.5 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31619  predicted protein  33.8 
 
 		 267 aa  137  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.947079  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  37.5 
 
 		 231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1441  DSBA oxidoreductase  38.03 
 
 		 214 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0402577 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0952  DSBA oxidoreductase  36.45 
 
 		 219 aa  135  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.440606  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1642  DSBA oxidoreductase  35.78 
 
 		 218 aa  135  4e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.420211  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2061  DSBA oxidoreductase  41.47 
 
 		 215 aa  135  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7204  DSBA oxidoreductase  36.99 
 
 		 221 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2852  polyketide biosynthesis associated protein  39.11 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0967  DSBA oxidoreductase  37.32 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.431519  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3008  DSBA oxidoreductase  36.65 
 
 		 248 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1583  DSBA oxidoreductase  37.5 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3598  DSBA oxidoreductase  37.09 
 
 		 220 aa  132  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.432657 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  35.24 
 
 		 217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  37.33 
 
 		 230 aa  132  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2795  DSBA oxidoreductase  38.19 
 
 		 207 aa  132  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2694  DSBA oxidoreductase  36.02 
 
 		 235 aa  132  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  37.5 
 
 		 236 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1398  DSBA oxidoreductase  37.74 
 
 		 237 aa  131  9e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394424  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0567  DSBA oxidoreductase  38.05 
 
 		 244 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0020  DSBA oxidoreductase  39.91 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01681  hypothetical protein  38.79 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6424  DSBA oxidoreductase  37.33 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.450496 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0970  DSBA oxidoreductase  35.5 
 
 		 216 aa  129  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227612 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1948  DSBA oxidoreductase  39.35 
 
 		 216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0704  DSBA oxidoreductase  37.56 
 
 		 235 aa  128  7.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1267  frnE protein  38.28 
 
 		 223 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.454512  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3318  DSBA oxidoreductase  37.73 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2343  DSBA oxidoreductase  35.35 
 
 		 234 aa  126  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590857  normal  0.036783 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1564  DsbA oxidoreductase  36.32 
 
 		 212 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0406976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0416  putative dithiol-disulfide isomerase  35.16 
 
 		 221 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  40 
 
 		 235 aa  126  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2493  dithiol-disulfide isomerase  34.08 
 
 		 242 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4948  DSBA oxidoreductase  36.04 
 
 		 221 aa  125  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.576797 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2073  DSBA oxidoreductase  37.56 
 
 		 256 aa  125  5e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.232317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5000  DSBA oxidoreductase  36.73 
 
 		 233 aa  125  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324442  normal  0.0420894 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2594  DSBA oxidoreductase  39.05 
 
 		 212 aa  125  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0210  DSBA oxidoreductase  35.27 
 
 		 213 aa  125  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  34.01 
 
 		 214 aa  124  9e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0941  DSBA oxidoreductase  36.7 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.203124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3961  DSBA oxidoreductase  36.67 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  35.75 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0633  DSBA oxidoreductase  35.16 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218426  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0796  DSBA oxidoreductase  35.11 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0654  DSBA oxidoreductase  35.16 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3751  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 222 aa  122  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1605  DSBA oxidoreductase  34.91 
 
 		 215 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3441  DSBA oxidoreductase  39.29 
 
 		 215 aa  122  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2832  DSBA oxidoreductase  31.88 
 
 		 213 aa  121  9e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84064  normal  0.0678708 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  35.81 
 
 		 243 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  33.49 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2720  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.41 
 
 		 219 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.162153 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2174  DSBA oxidoreductase  40.31 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132146  hitchhiker  0.0000045366 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  35.48 
 
 		 243 aa  119  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1200  DSBA oxidoreductase  36.1 
 
 		 237 aa  119  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6638  DsbA oxidoreductase  36.06 
 
 		 231 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0515  DSBA oxidoreductase  31.71 
 
 		 221 aa  119  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0728  DSBA oxidoreductase  34.22 
 
 		 230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4882  DSBA oxidoreductase  38.69 
 
 		 229 aa  118  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4436  DSBA oxidoreductase  38.21 
 
 		 239 aa  118  6e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1261  DSBA oxidoreductase  36.41 
 
 		 235 aa  118  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  35.48 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0308  FrnE protein  35.02 
 
 		 243 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00686429  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0261  DSBA oxidoreductase  35.38 
 
 		 213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0132035 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2391  putative DSBA oxidoreductase  34.76 
 
 		 217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1100  hypothetical protein  31.02 
 
 		 217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0363  DSBA oxidoreductase  37.14 
 
 		 243 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0721  DSBA oxidoreductase  36.84 
 
 		 244 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874736  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0738  DSBA oxidoreductase  36.84 
 
 		 244 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122622 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>