192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5468 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5468  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  453  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1717  DSBA oxidoreductase  77.38 
 
 
221 aa  356  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3756  DSBA oxidoreductase  77.38 
 
 
221 aa  353  1e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.734213  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4389  DSBA oxidoreductase  76.47 
 
 
221 aa  352  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0887682  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1542  DSBA oxidoreductase  71.56 
 
 
224 aa  294  9e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  42.45 
 
 
224 aa  179  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  41.23 
 
 
220 aa  175  4e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1557  putative DSBA oxidoreductase  39.23 
 
 
222 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0577  frnE protein, putative  40.72 
 
 
224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0543  dsba oxidoreductase  40.72 
 
 
224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3082  DSBA oxidoreductase  40.49 
 
 
216 aa  170  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  0.192023 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1700  DSBA oxidoreductase  39.72 
 
 
227 aa  170  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1347  DSBA oxidoreductase  37.16 
 
 
233 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  40.09 
 
 
223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  40.09 
 
 
223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.474005 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1034  DSBA oxidoreductase  42.92 
 
 
215 aa  162  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1502  DSBA oxidoreductase  39.44 
 
 
214 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0283596 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  39.25 
 
 
223 aa  159  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2709  DSBA oxidoreductase  38.73 
 
 
214 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.111017  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  37.26 
 
 
221 aa  155  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1922  DSBA oxidoreductase  38.76 
 
 
218 aa  149  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2316  DSBA oxidoreductase  35.41 
 
 
221 aa  149  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  39.71 
 
 
225 aa  149  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1441  DSBA oxidoreductase  38.97 
 
 
214 aa  148  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0402577 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2852  polyketide biosynthesis associated protein  39.13 
 
 
214 aa  147  9e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01056  probable DSBA oxidoreductase  34.43 
 
 
211 aa  142  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0967  DSBA oxidoreductase  37.74 
 
 
220 aa  142  4e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.431519  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  37.96 
 
 
236 aa  141  9e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1083  DSBA oxidoreductase  35.89 
 
 
216 aa  138  6e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.979731  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0952  DSBA oxidoreductase  31.71 
 
 
219 aa  138  7e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.440606  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2061  DSBA oxidoreductase  37.74 
 
 
215 aa  138  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3914  DSBA oxidoreductase  38.1 
 
 
215 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1583  DSBA oxidoreductase  39.49 
 
 
210 aa  135  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  36.57 
 
 
231 aa  135  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  34.93 
 
 
217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0024  DSBA oxidoreductase  38.39 
 
 
211 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5431  DSBA oxidoreductase  40.85 
 
 
213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2795  DSBA oxidoreductase  38.38 
 
 
207 aa  132  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3550  DSBA oxidoreductase  40.09 
 
 
220 aa  132  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.916573  normal  0.901837 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4177  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  36.67 
 
 
215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.743231  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31619  predicted protein  34.26 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.947079  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01681  hypothetical protein  35.85 
 
 
222 aa  129  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1937  DSBA oxidoreductase  34 
 
 
222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  38.81 
 
 
243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  35.19 
 
 
214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3961  DSBA oxidoreductase  35.85 
 
 
222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3751  DSBA oxidoreductase  34.11 
 
 
222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0252  DSBA oxidoreductase  39.27 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  38.71 
 
 
243 aa  126  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0115  DSBA oxidoreductase  34.74 
 
 
232 aa  126  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.133072  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3598  DSBA oxidoreductase  33.8 
 
 
220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.432657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0020  DSBA oxidoreductase  39.44 
 
 
211 aa  125  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1642  DSBA oxidoreductase  33.03 
 
 
218 aa  125  6e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.420211  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6424  DSBA oxidoreductase  35.94 
 
 
217 aa  125  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.450496 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3318  DSBA oxidoreductase  34.4 
 
 
227 aa  125  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4948  DSBA oxidoreductase  35.59 
 
 
221 aa  125  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.576797 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0210  DSBA oxidoreductase  36.23 
 
 
213 aa  125  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7204  DSBA oxidoreductase  37.04 
 
 
221 aa  125  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  35.03 
 
 
214 aa  124  8.000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  38.71 
 
 
243 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  38.71 
 
 
243 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0308  FrnE protein  38.25 
 
 
243 aa  124  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00686429  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  38.71 
 
 
243 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0970  DSBA oxidoreductase  33.8 
 
 
216 aa  123  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227612 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1564  DsbA oxidoreductase  33.65 
 
 
212 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0406976  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2594  DSBA oxidoreductase  37.74 
 
 
212 aa  122  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4436  DSBA oxidoreductase  39.45 
 
 
239 aa  122  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0796  DSBA oxidoreductase  34.7 
 
 
221 aa  122  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1261  DSBA oxidoreductase  37.33 
 
 
235 aa  121  9e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0567  DSBA oxidoreductase  36.97 
 
 
244 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  36.82 
 
 
235 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3008  DSBA oxidoreductase  32.89 
 
 
248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  32.46 
 
 
230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0728  DSBA oxidoreductase  32.56 
 
 
230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6638  DsbA oxidoreductase  37.02 
 
 
231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0258  DSBA oxidoreductase  36.79 
 
 
208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0515  DSBA oxidoreductase  32.86 
 
 
221 aa  119  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1267  frnE protein  37.26 
 
 
223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.454512  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2493  dithiol-disulfide isomerase  35.29 
 
 
242 aa  118  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  34.6 
 
 
209 aa  118  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1200  DSBA oxidoreductase  34.62 
 
 
237 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153386  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2073  DSBA oxidoreductase  37.96 
 
 
256 aa  118  7.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.232317  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1100  hypothetical protein  31.31 
 
 
217 aa  118  7.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1398  DSBA oxidoreductase  36.11 
 
 
237 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394424  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5000  DSBA oxidoreductase  33.18 
 
 
233 aa  117  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324442  normal  0.0420894 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1605  DSBA oxidoreductase  35.05 
 
 
215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2343  DSBA oxidoreductase  34.58 
 
 
234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590857  normal  0.036783 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2720  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.41 
 
 
219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.162153 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0704  DSBA oxidoreductase  34.26 
 
 
235 aa  115  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0416  putative dithiol-disulfide isomerase  34.26 
 
 
221 aa  115  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5788  DSBA oxidoreductase  34.6 
 
 
215 aa  115  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0487063 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2832  DSBA oxidoreductase  30.92 
 
 
213 aa  115  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84064  normal  0.0678708 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1488  DSBA oxidoreductase  33.8 
 
 
234 aa  114  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1057  DSBA oxidoreductase  36.57 
 
 
235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0941  DSBA oxidoreductase  34.4 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.203124  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0261  DSBA oxidoreductase  33.02 
 
 
213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0132035 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2174  DSBA oxidoreductase  38 
 
 
209 aa  112  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132146  hitchhiker  0.0000045366 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2694  DSBA oxidoreductase  35.07 
 
 
235 aa  113  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0721  DSBA oxidoreductase  36.89 
 
 
244 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874736  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4882  DSBA oxidoreductase  36.41 
 
 
229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>