210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4882 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4882  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 229 aa  455  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1261  DSBA oxidoreductase  54.63 
 
 		 235 aa  228  7e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4436  DSBA oxidoreductase  53.88 
 
 		 239 aa  216  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0704  DSBA oxidoreductase  49.76 
 
 		 235 aa  211  5.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0567  DSBA oxidoreductase  49.52 
 
 		 244 aa  210  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3550  DSBA oxidoreductase  52.94 
 
 		 220 aa  206  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.916573  normal  0.901837 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2073  DSBA oxidoreductase  49.53 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.232317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  48.43 
 
 		 235 aa  201  6e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5431  DSBA oxidoreductase  50.72 
 
 		 213 aa  198  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2174  DSBA oxidoreductase  50.25 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132146  hitchhiker  0.0000045366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1893  DSBA oxidoreductase  47.87 
 
 		 238 aa  191  9e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1267  frnE protein  48.37 
 
 		 223 aa  190  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.454512  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2493  dithiol-disulfide isomerase  42.33 
 
 		 242 aa  188  5e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5000  DSBA oxidoreductase  41.18 
 
 		 233 aa  184  8e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324442  normal  0.0420894 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1639  DSBA oxidoreductase  49.77 
 
 		 250 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2594  DSBA oxidoreductase  46.67 
 
 		 212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  42.79 
 
 		 236 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3441  DSBA oxidoreductase  45.28 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1488  DSBA oxidoreductase  41.35 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  43.75 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  44.23 
 
 		 209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2343  DSBA oxidoreductase  42.92 
 
 		 234 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590857  normal  0.036783 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  38.68 
 
 		 243 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  38.21 
 
 		 243 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  38.68 
 
 		 243 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  38.21 
 
 		 243 aa  170  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2694  DSBA oxidoreductase  39.52 
 
 		 235 aa  169  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  37.74 
 
 		 243 aa  168  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0308  FrnE protein  38.28 
 
 		 243 aa  168  8e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00686429  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18220  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  45.58 
 
 		 218 aa  168  8e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0738  DSBA oxidoreductase  43.19 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122622 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0252  DSBA oxidoreductase  37.26 
 
 		 243 aa  166  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0363  DSBA oxidoreductase  42.65 
 
 		 243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0846  DSBA oxidoreductase  42.65 
 
 		 243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96876  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2541  DSBA oxidoreductase  43.6 
 
 		 247 aa  166  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1057  DSBA oxidoreductase  44.08 
 
 		 235 aa  165  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0326  DSBA oxidoreductase  45.89 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0818  DSBA oxidoreductase  42.18 
 
 		 243 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0721  DSBA oxidoreductase  42.25 
 
 		 244 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874736  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0258  DSBA oxidoreductase  38.1 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3936  DSBA oxidoreductase  41.71 
 
 		 270 aa  159  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.763999  hitchhiker  0.00370443 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1278  DSBA oxidoreductase  40.09 
 
 		 222 aa  156  3e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000336164  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0941  DSBA oxidoreductase  39.25 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.203124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1398  DSBA oxidoreductase  41.9 
 
 		 237 aa  149  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394424  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0591  DSBA oxidoreductase  39.15 
 
 		 238 aa  148  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.699138  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2136  DSBA oxidoreductase  37.38 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.883465  normal  0.0421817 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4148  DSBA oxidoreductase  39.44 
 
 		 241 aa  143  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1200  DSBA oxidoreductase  39.51 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  42.16 
 
 		 225 aa  136  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1174  DSBA oxidoreductase  39.62 
 
 		 239 aa  136  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.196548 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0550  polyketide biosynthesis associated protein  35.41 
 
 		 233 aa  135  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  36.53 
 
 		 223 aa  131  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4753  DSBA oxidoreductase  40.1 
 
 		 219 aa  131  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22550  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  40.78 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6638  DsbA oxidoreductase  41.1 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0024  DSBA oxidoreductase  41.35 
 
 		 211 aa  129  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2795  DSBA oxidoreductase  38.35 
 
 		 207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4106  DSBA oxidoreductase  42.42 
 
 		 229 aa  125  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4261  isomerase, putative  34.82 
 
 		 232 aa  125  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1148  DSBA oxidoreductase  33.5 
 
 		 237 aa  125  8.000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  38.03 
 
 		 221 aa  125  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1083  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.979731  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  37.05 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  37.84 
 
 		 223 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.474005 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  37.32 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  36.54 
 
 		 231 aa  122  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4389  DSBA oxidoreductase  36.45 
 
 		 221 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0887682  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0020  DSBA oxidoreductase  42.03 
 
 		 211 aa  122  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2368  DSBA oxidoreductase  40.96 
 
 		 203 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.919583  normal  0.0250813 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1717  DSBA oxidoreductase  40.2 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2107  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3756  DSBA oxidoreductase  38.69 
 
 		 221 aa  118  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.734213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1583  DSBA oxidoreductase  35.41 
 
 		 210 aa  118  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22650  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  32.23 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.483834 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0577  frnE protein, putative  35.68 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0543  dsba oxidoreductase  35.68 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1557  putative DSBA oxidoreductase  37.56 
 
 		 222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1937  DSBA oxidoreductase  32.21 
 
 		 222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7204  DSBA oxidoreductase  31.98 
 
 		 221 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3082  DSBA oxidoreductase  34.78 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  0.192023 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0416  putative dithiol-disulfide isomerase  32.43 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0979  DSBA oxidoreductase  29.05 
 
 		 215 aa  113  3e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00033798  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3914  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0746  DSBA oxidoreductase  32.71 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5468  hypothetical protein  36.41 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01681  hypothetical protein  36.7 
 
 		 222 aa  112  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1700  DSBA oxidoreductase  36.82 
 
 		 227 aa  111  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 220 aa  111  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1502  DSBA oxidoreductase  37.68 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0283596 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  29.52 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2720  thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.73 
 
 		 219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.162153 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  30.23 
 
 		 217 aa  108  5e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1542  DSBA oxidoreductase  39.13 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0970  DSBA oxidoreductase  29.58 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227612 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2061  DSBA oxidoreductase  32.87 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6424  DSBA oxidoreductase  33.49 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.450496 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01724  polyketide synthase  39.81 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2709  DSBA oxidoreductase  32.04 
 
 		 214 aa  105  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.111017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  32.08 
 
 		 214 aa  104  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4177  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  28.37 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.743231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>