192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1267 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1267  frnE protein  100 
 
 		 223 aa  450  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.454512  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3550  DSBA oxidoreductase  62.62 
 
 		 220 aa  275  4e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.916573  normal  0.901837 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2594  DSBA oxidoreductase  61.61 
 
 		 212 aa  258  7e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5431  DSBA oxidoreductase  59.42 
 
 		 213 aa  244  6.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2174  DSBA oxidoreductase  58.17 
 
 		 209 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132146  hitchhiker  0.0000045366 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5000  DSBA oxidoreductase  50.98 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324442  normal  0.0420894 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1488  DSBA oxidoreductase  47.66 
 
 		 234 aa  211  4.9999999999999996e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0704  DSBA oxidoreductase  47.2 
 
 		 235 aa  211  7.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2694  DSBA oxidoreductase  46.33 
 
 		 235 aa  207  9e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2493  dithiol-disulfide isomerase  44.8 
 
 		 242 aa  207  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2073  DSBA oxidoreductase  48.87 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.232317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2343  DSBA oxidoreductase  46.7 
 
 		 234 aa  202  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590857  normal  0.036783 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  45.67 
 
 		 236 aa  199  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0567  DSBA oxidoreductase  46.01 
 
 		 244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  47.69 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  43.52 
 
 		 243 aa  193  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4882  DSBA oxidoreductase  48.37 
 
 		 229 aa  190  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  43.06 
 
 		 243 aa  189  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4436  DSBA oxidoreductase  49.09 
 
 		 239 aa  188  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1261  DSBA oxidoreductase  45.66 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0308  FrnE protein  42.59 
 
 		 243 aa  187  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00686429  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0252  DSBA oxidoreductase  43.06 
 
 		 243 aa  186  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  42.59 
 
 		 243 aa  185  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  42.59 
 
 		 243 aa  185  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  42.59 
 
 		 243 aa  185  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0258  DSBA oxidoreductase  44.17 
 
 		 208 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0941  DSBA oxidoreductase  43.06 
 
 		 240 aa  181  6e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.203124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  42.72 
 
 		 209 aa  180  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1057  DSBA oxidoreductase  44.86 
 
 		 235 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1639  DSBA oxidoreductase  48.68 
 
 		 250 aa  175  6e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1893  DSBA oxidoreductase  47.42 
 
 		 238 aa  174  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3441  DSBA oxidoreductase  42.31 
 
 		 215 aa  172  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0550  polyketide biosynthesis associated protein  38.79 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0738  DSBA oxidoreductase  45.67 
 
 		 244 aa  168  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122622 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0721  DSBA oxidoreductase  45.19 
 
 		 244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874736  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  47.89 
 
 		 225 aa  165  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0363  DSBA oxidoreductase  44.71 
 
 		 243 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0846  DSBA oxidoreductase  44.71 
 
 		 243 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96876  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0818  DSBA oxidoreductase  44.71 
 
 		 243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2541  DSBA oxidoreductase  44.71 
 
 		 247 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3936  DSBA oxidoreductase  44.71 
 
 		 270 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.763999  hitchhiker  0.00370443 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22550  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  43.69 
 
 		 227 aa  156  2e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4148  DSBA oxidoreductase  43.13 
 
 		 241 aa  156  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18220  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  43.46 
 
 		 218 aa  155  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  41.18 
 
 		 230 aa  155  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1278  DSBA oxidoreductase  38.86 
 
 		 222 aa  152  4e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000336164  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1200  DSBA oxidoreductase  40.49 
 
 		 237 aa  151  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2136  DSBA oxidoreductase  36.27 
 
 		 213 aa  149  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.883465  normal  0.0421817 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1398  DSBA oxidoreductase  39.07 
 
 		 237 aa  149  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394424  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1174  DSBA oxidoreductase  38.35 
 
 		 239 aa  149  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.196548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4753  DSBA oxidoreductase  44.39 
 
 		 219 aa  148  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6638  DsbA oxidoreductase  42.44 
 
 		 231 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4106  DSBA oxidoreductase  42.51 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0591  DSBA oxidoreductase  39.63 
 
 		 238 aa  139  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.699138  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22650  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  33.33 
 
 		 228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.483834 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  38.76 
 
 		 223 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.474005 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  37.32 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  38.28 
 
 		 223 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2368  DSBA oxidoreductase  40.7 
 
 		 203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.919583  normal  0.0250813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0024  DSBA oxidoreductase  38.73 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1148  DSBA oxidoreductase  34.12 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  38.64 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0326  DSBA oxidoreductase  37.31 
 
 		 237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3914  DSBA oxidoreductase  34.47 
 
 		 215 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3756  DSBA oxidoreductase  38.28 
 
 		 221 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.734213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0020  DSBA oxidoreductase  39.71 
 
 		 211 aa  128  9.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4177  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  33.33 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.743231  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4389  DSBA oxidoreductase  37.32 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0887682  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0979  DSBA oxidoreductase  30.58 
 
 		 215 aa  125  5e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00033798  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  37.38 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2795  DSBA oxidoreductase  36.84 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1583  DSBA oxidoreductase  36.23 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1717  DSBA oxidoreductase  36.84 
 
 		 221 aa  121  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1642  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.420211  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  32.86 
 
 		 217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5468  hypothetical protein  37.26 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  33.48 
 
 		 224 aa  118  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7204  DSBA oxidoreductase  34.62 
 
 		 221 aa  117  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3008  DSBA oxidoreductase  32.09 
 
 		 248 aa  116  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  35.89 
 
 		 221 aa  116  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1026  DSBA oxidoreductase  35.1 
 
 		 225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834563 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0515  DSBA oxidoreductase  29.44 
 
 		 221 aa  115  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0577  frnE protein, putative  34.43 
 
 		 224 aa  115  7.999999999999999e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0543  dsba oxidoreductase  34.43 
 
 		 224 aa  115  7.999999999999999e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0416  putative dithiol-disulfide isomerase  32.56 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1083  DSBA oxidoreductase  31.84 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.979731  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2720  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.69 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.162153 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1034  DSBA oxidoreductase  37.62 
 
 		 215 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0746  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 		 215 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  35.07 
 
 		 220 aa  112  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  31.25 
 
 		 214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0115  DSBA oxidoreductase  33.18 
 
 		 232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.133072  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6424  DSBA oxidoreductase  33.65 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.450496 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0654  DSBA oxidoreductase  32.7 
 
 		 220 aa  109  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4261  isomerase, putative  30.67 
 
 		 232 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01724  polyketide synthase  38.05 
 
 		 213 aa  108  7.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0904  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  36.45 
 
 		 334 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1542  DSBA oxidoreductase  38.7 
 
 		 224 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1948  DSBA oxidoreductase  33.64 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01681  hypothetical protein  33.96 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.793044 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>