199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2594 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2594  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
212 aa  434  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1267  frnE protein  61.61 
 
 
223 aa  258  7e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.454512  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3550  DSBA oxidoreductase  61.46 
 
 
220 aa  251  6e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.916573  normal  0.901837 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2174  DSBA oxidoreductase  56.65 
 
 
209 aa  220  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132146  hitchhiker  0.0000045366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5431  DSBA oxidoreductase  52.4 
 
 
213 aa  206  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2694  DSBA oxidoreductase  46.86 
 
 
235 aa  194  8.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5000  DSBA oxidoreductase  45.89 
 
 
233 aa  193  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324442  normal  0.0420894 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  48.82 
 
 
230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  48.82 
 
 
235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0704  DSBA oxidoreductase  43.46 
 
 
235 aa  182  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0567  DSBA oxidoreductase  44.02 
 
 
244 aa  182  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4436  DSBA oxidoreductase  49.07 
 
 
239 aa  182  4.0000000000000006e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18220  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  49.76 
 
 
218 aa  179  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1488  DSBA oxidoreductase  45.85 
 
 
234 aa  180  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2493  dithiol-disulfide isomerase  41.51 
 
 
242 aa  180  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4882  DSBA oxidoreductase  46.67 
 
 
229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2073  DSBA oxidoreductase  47.37 
 
 
256 aa  176  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.232317  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  42.72 
 
 
209 aa  174  9e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2343  DSBA oxidoreductase  44.76 
 
 
234 aa  174  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590857  normal  0.036783 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  47.09 
 
 
225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  44.66 
 
 
236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0258  DSBA oxidoreductase  43 
 
 
208 aa  170  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1261  DSBA oxidoreductase  46.01 
 
 
235 aa  170  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  43 
 
 
243 aa  169  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  43 
 
 
243 aa  167  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  43 
 
 
243 aa  166  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  43 
 
 
243 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  42.51 
 
 
243 aa  164  8e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0308  FrnE protein  42.03 
 
 
243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00686429  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0252  DSBA oxidoreductase  42.03 
 
 
243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0721  DSBA oxidoreductase  45.85 
 
 
244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874736  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1398  DSBA oxidoreductase  43.07 
 
 
237 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394424  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1174  DSBA oxidoreductase  39.13 
 
 
239 aa  161  8.000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.196548 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0941  DSBA oxidoreductase  40.58 
 
 
240 aa  159  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.203124  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0738  DSBA oxidoreductase  45.37 
 
 
244 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.122622 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0326  DSBA oxidoreductase  44.23 
 
 
237 aa  159  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1200  DSBA oxidoreductase  37.75 
 
 
237 aa  159  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153386  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3441  DSBA oxidoreductase  41.55 
 
 
215 aa  159  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0818  DSBA oxidoreductase  44.88 
 
 
243 aa  157  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0363  DSBA oxidoreductase  44.88 
 
 
243 aa  157  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0846  DSBA oxidoreductase  44.88 
 
 
243 aa  157  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96876  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2541  DSBA oxidoreductase  44.88 
 
 
247 aa  157  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1893  DSBA oxidoreductase  45.19 
 
 
238 aa  156  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1639  DSBA oxidoreductase  47.69 
 
 
250 aa  155  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3936  DSBA oxidoreductase  44.39 
 
 
270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.763999  hitchhiker  0.00370443 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22550  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  43.43 
 
 
227 aa  154  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1057  DSBA oxidoreductase  43.69 
 
 
235 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6638  DsbA oxidoreductase  43.33 
 
 
231 aa  148  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0550  polyketide biosynthesis associated protein  39.02 
 
 
233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2136  DSBA oxidoreductase  35.71 
 
 
213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.883465  normal  0.0421817 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1278  DSBA oxidoreductase  37.26 
 
 
222 aa  144  9e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000336164  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22650  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  37.02 
 
 
228 aa  143  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.483834 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0024  DSBA oxidoreductase  38.24 
 
 
211 aa  142  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4148  DSBA oxidoreductase  41.9 
 
 
241 aa  142  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1148  DSBA oxidoreductase  35.35 
 
 
237 aa  141  7e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  38.1 
 
 
231 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2368  DSBA oxidoreductase  39.71 
 
 
203 aa  136  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.919583  normal  0.0250813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0020  DSBA oxidoreductase  39.9 
 
 
211 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0591  DSBA oxidoreductase  41.43 
 
 
238 aa  131  6e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.699138  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4106  DSBA oxidoreductase  39.9 
 
 
229 aa  131  7.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4753  DSBA oxidoreductase  37.62 
 
 
219 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3914  DSBA oxidoreductase  34.93 
 
 
215 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  35.89 
 
 
214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  36.07 
 
 
224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4177  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  34.76 
 
 
215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.743231  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0577  frnE protein, putative  35.32 
 
 
224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1717  DSBA oxidoreductase  39.52 
 
 
221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0543  dsba oxidoreductase  35.32 
 
 
224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3756  DSBA oxidoreductase  39.05 
 
 
221 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.734213  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1937  DSBA oxidoreductase  31.88 
 
 
222 aa  125  7e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  35.38 
 
 
223 aa  124  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  35.38 
 
 
223 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.474005 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  32.86 
 
 
217 aa  122  3e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0979  DSBA oxidoreductase  29.19 
 
 
215 aa  122  4e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00033798  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5468  hypothetical protein  37.74 
 
 
221 aa  122  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  34.91 
 
 
221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4389  DSBA oxidoreductase  38.05 
 
 
221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0887682  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1347  DSBA oxidoreductase  34.45 
 
 
233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  34.58 
 
 
223 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0970  DSBA oxidoreductase  33.65 
 
 
216 aa  115  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227612 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0261  DSBA oxidoreductase  35.21 
 
 
213 aa  115  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0132035 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0654  DSBA oxidoreductase  35.62 
 
 
220 aa  115  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3751  DSBA oxidoreductase  33.02 
 
 
222 aa  115  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3987  DSBA oxidoreductase  40.93 
 
 
228 aa  115  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0633  DSBA oxidoreductase  34.86 
 
 
220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218426  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3008  DSBA oxidoreductase  31.96 
 
 
248 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1083  DSBA oxidoreductase  31.6 
 
 
216 aa  112  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.979731  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3598  DSBA oxidoreductase  36.87 
 
 
220 aa  112  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.432657 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0515  DSBA oxidoreductase  30 
 
 
221 aa  111  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  32.21 
 
 
214 aa  111  7.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0728  DSBA oxidoreductase  31.72 
 
 
230 aa  111  9e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1564  DsbA oxidoreductase  34.91 
 
 
212 aa  111  9e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0406976  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01056  probable DSBA oxidoreductase  32.55 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1034  DSBA oxidoreductase  36.19 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1605  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01724  polyketide synthase  36.54 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0115  DSBA oxidoreductase  34.11 
 
 
232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.133072  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1700  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
227 aa  109  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1642  DSBA oxidoreductase  32.7 
 
 
218 aa  109  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.420211  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  33.8 
 
 
220 aa  108  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.109842 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>