220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3550 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3550  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
220 aa  449  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.916573  normal  0.901837 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1267  frnE protein  62.2 
 
 
223 aa  276  2e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.454512  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2174  DSBA oxidoreductase  61.76 
 
 
209 aa  258  4e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132146  hitchhiker  0.0000045366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2594  DSBA oxidoreductase  61.46 
 
 
212 aa  251  5.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5431  DSBA oxidoreductase  58.54 
 
 
213 aa  244  6e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2073  DSBA oxidoreductase  50.72 
 
 
256 aa  208  5e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.232317  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5000  DSBA oxidoreductase  45.59 
 
 
233 aa  208  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324442  normal  0.0420894 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4882  DSBA oxidoreductase  52.94 
 
 
229 aa  206  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2343  DSBA oxidoreductase  48.29 
 
 
234 aa  205  4e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590857  normal  0.036783 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1488  DSBA oxidoreductase  43.2 
 
 
234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2493  dithiol-disulfide isomerase  43.69 
 
 
242 aa  195  6e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  48.46 
 
 
235 aa  191  6e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0567  DSBA oxidoreductase  45.37 
 
 
244 aa  189  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  44.66 
 
 
209 aa  188  5e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1261  DSBA oxidoreductase  46.92 
 
 
235 aa  187  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2694  DSBA oxidoreductase  41.95 
 
 
235 aa  186  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  42.01 
 
 
236 aa  186  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0704  DSBA oxidoreductase  41.51 
 
 
235 aa  185  4e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  46.26 
 
 
230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  49.76 
 
 
225 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0941  DSBA oxidoreductase  42.41 
 
 
240 aa  180  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.203124  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4436  DSBA oxidoreductase  47.87 
 
 
239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18220  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  47.8 
 
 
218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0326  DSBA oxidoreductase  46.08 
 
 
237 aa  171  6.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1398  DSBA oxidoreductase  43.96 
 
 
237 aa  170  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394424  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0258  DSBA oxidoreductase  41.35 
 
 
208 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  39.9 
 
 
243 aa  165  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  39.42 
 
 
243 aa  164  9e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3441  DSBA oxidoreductase  41.31 
 
 
215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0550  polyketide biosynthesis associated protein  39.81 
 
 
233 aa  162  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0738  DSBA oxidoreductase  43.63 
 
 
244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.122622 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0363  DSBA oxidoreductase  43.63 
 
 
243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0846  DSBA oxidoreductase  43.63 
 
 
243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96876  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0818  DSBA oxidoreductase  43.63 
 
 
243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  39.42 
 
 
243 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  39.42 
 
 
243 aa  161  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  39.42 
 
 
243 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0024  DSBA oxidoreductase  44.65 
 
 
211 aa  161  9e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0308  FrnE protein  38.94 
 
 
243 aa  160  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00686429  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2541  DSBA oxidoreductase  43.14 
 
 
247 aa  160  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1057  DSBA oxidoreductase  43 
 
 
235 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0721  DSBA oxidoreductase  43.14 
 
 
244 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874736  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3936  DSBA oxidoreductase  43.14 
 
 
270 aa  159  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.763999  hitchhiker  0.00370443 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1639  DSBA oxidoreductase  47.17 
 
 
250 aa  159  3e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2136  DSBA oxidoreductase  37.62 
 
 
213 aa  157  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.883465  normal  0.0421817 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0252  DSBA oxidoreductase  37.98 
 
 
243 aa  155  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1893  DSBA oxidoreductase  41.26 
 
 
238 aa  152  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3756  DSBA oxidoreductase  41.67 
 
 
221 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.734213  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22550  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  42.93 
 
 
227 aa  148  7e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1200  DSBA oxidoreductase  38.05 
 
 
237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153386  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0020  DSBA oxidoreductase  45.1 
 
 
211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1174  DSBA oxidoreductase  38.35 
 
 
239 aa  146  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.196548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6638  DsbA oxidoreductase  41.35 
 
 
231 aa  145  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1148  DSBA oxidoreductase  34.53 
 
 
237 aa  144  8.000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4106  DSBA oxidoreductase  42.36 
 
 
229 aa  143  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4389  DSBA oxidoreductase  38.43 
 
 
221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0887682  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4148  DSBA oxidoreductase  41.95 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0591  DSBA oxidoreductase  41.06 
 
 
238 aa  138  7e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.699138  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1278  DSBA oxidoreductase  36.11 
 
 
222 aa  137  8.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000336164  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1717  DSBA oxidoreductase  40.74 
 
 
221 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  39.45 
 
 
223 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.474005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4753  DSBA oxidoreductase  39.32 
 
 
219 aa  136  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0979  DSBA oxidoreductase  33.02 
 
 
215 aa  134  8e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00033798  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5468  hypothetical protein  39.63 
 
 
221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22650  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  34.47 
 
 
228 aa  132  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.483834 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  36.36 
 
 
231 aa  132  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  38.07 
 
 
223 aa  131  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  38.5 
 
 
223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2368  DSBA oxidoreductase  37.68 
 
 
203 aa  129  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.919583  normal  0.0250813 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  38.57 
 
 
221 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1642  DSBA oxidoreductase  33.02 
 
 
218 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.420211  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3914  DSBA oxidoreductase  30.81 
 
 
215 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1605  DSBA oxidoreductase  36.45 
 
 
215 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  37.32 
 
 
224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3082  DSBA oxidoreductase  34.62 
 
 
216 aa  118  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  0.192023 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  36.36 
 
 
220 aa  118  7e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1034  DSBA oxidoreductase  37.61 
 
 
215 aa  118  7.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01681  hypothetical protein  36.04 
 
 
222 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0577  frnE protein, putative  35.89 
 
 
224 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3008  DSBA oxidoreductase  32.09 
 
 
248 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1026  DSBA oxidoreductase  35.92 
 
 
225 aa  117  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.834563 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0543  dsba oxidoreductase  35.89 
 
 
224 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1542  DSBA oxidoreductase  41.67 
 
 
224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2795  DSBA oxidoreductase  33.66 
 
 
207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4261  isomerase, putative  32.86 
 
 
232 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3961  DSBA oxidoreductase  40.64 
 
 
222 aa  116  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4177  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  30.43 
 
 
215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.743231  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  30.33 
 
 
217 aa  115  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  34.76 
 
 
214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2709  DSBA oxidoreductase  37.5 
 
 
214 aa  113  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.111017  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1583  DSBA oxidoreductase  32.08 
 
 
210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1083  DSBA oxidoreductase  32.18 
 
 
216 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.979731  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0261  DSBA oxidoreductase  34.29 
 
 
213 aa  111  8.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0132035 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0746  DSBA oxidoreductase  33.01 
 
 
215 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6424  DSBA oxidoreductase  33.03 
 
 
217 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.450496 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1937  DSBA oxidoreductase  31.73 
 
 
222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1700  DSBA oxidoreductase  33.18 
 
 
227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1160  dithiol-disulfide isomerase  31.16 
 
 
223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000467454  hitchhiker  3.85744e-21 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01724  polyketide synthase  38.35 
 
 
213 aa  109  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  30.61 
 
 
214 aa  109  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>