200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6424 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6424  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
217 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.450496 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7204  DSBA oxidoreductase  80.75 
 
 
221 aa  354  5e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0416  putative dithiol-disulfide isomerase  78.34 
 
 
221 aa  353  8.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1948  DSBA oxidoreductase  81.13 
 
 
216 aa  342  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1605  DSBA oxidoreductase  64.15 
 
 
215 aa  294  7e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5788  DSBA oxidoreductase  69.52 
 
 
215 aa  294  8e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0487063 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2061  DSBA oxidoreductase  53.49 
 
 
215 aa  242  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3008  DSBA oxidoreductase  52.25 
 
 
248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4177  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  52.56 
 
 
215 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.743231  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0115  DSBA oxidoreductase  51.85 
 
 
232 aa  228  7e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.133072  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3914  DSBA oxidoreductase  51.63 
 
 
215 aa  226  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3318  DSBA oxidoreductase  53.52 
 
 
227 aa  226  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1564  DsbA oxidoreductase  52.2 
 
 
212 aa  223  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0406976  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3598  DSBA oxidoreductase  51.39 
 
 
220 aa  222  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.432657 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2296  DSBA oxidoreductase  50 
 
 
221 aa  221  9e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00720993  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3751  DSBA oxidoreductase  48.6 
 
 
222 aa  218  5e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0261  DSBA oxidoreductase  53.05 
 
 
213 aa  210  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0132035 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0654  DSBA oxidoreductase  49.54 
 
 
220 aa  206  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0515  DSBA oxidoreductase  43.32 
 
 
221 aa  205  4e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0633  DSBA oxidoreductase  49.07 
 
 
220 aa  202  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218426  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  45.07 
 
 
214 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3987  DSBA oxidoreductase  52.8 
 
 
228 aa  198  7e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1642  DSBA oxidoreductase  44.39 
 
 
218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.420211  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1083  DSBA oxidoreductase  42.06 
 
 
216 aa  187  8e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.979731  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1937  DSBA oxidoreductase  43.06 
 
 
222 aa  181  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2720  thiol:disulfide interchange protein DsbA  39.05 
 
 
219 aa  167  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.162153 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0970  DSBA oxidoreductase  42.79 
 
 
216 aa  166  4e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227612 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1100  hypothetical protein  40.65 
 
 
217 aa  164  8e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  39.71 
 
 
217 aa  160  1e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0746  DSBA oxidoreductase  38.32 
 
 
215 aa  159  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0210  DSBA oxidoreductase  40.1 
 
 
213 aa  157  8e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0728  DSBA oxidoreductase  39.45 
 
 
230 aa  156  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  34.43 
 
 
214 aa  154  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01056  probable DSBA oxidoreductase  38.89 
 
 
211 aa  148  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0963  DSBA oxidoreductase  36.68 
 
 
230 aa  143  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0391729  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  37.85 
 
 
223 aa  140  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  37.67 
 
 
235 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1557  putative DSBA oxidoreductase  36.62 
 
 
222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  35.35 
 
 
236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2316  DSBA oxidoreductase  37.62 
 
 
221 aa  138  7.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3441  DSBA oxidoreductase  39.72 
 
 
215 aa  131  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3756  DSBA oxidoreductase  37.33 
 
 
221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.734213  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0941  DSBA oxidoreductase  35.07 
 
 
240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.203124  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1502  DSBA oxidoreductase  37.04 
 
 
214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0283596 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2694  DSBA oxidoreductase  32.86 
 
 
235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  35.21 
 
 
243 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  35.05 
 
 
243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4389  DSBA oxidoreductase  35.94 
 
 
221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0887682  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0952  DSBA oxidoreductase  35.35 
 
 
219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.440606  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0308  FrnE protein  35.05 
 
 
243 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00686429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1441  DSBA oxidoreductase  37.04 
 
 
214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0402577 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  34.3 
 
 
209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0577  frnE protein, putative  34.88 
 
 
224 aa  126  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  35.89 
 
 
223 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.474005 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1347  DSBA oxidoreductase  35.43 
 
 
233 aa  126  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0543  dsba oxidoreductase  34.88 
 
 
224 aa  126  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  35.05 
 
 
243 aa  125  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5468  hypothetical protein  35.94 
 
 
221 aa  125  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  35.41 
 
 
223 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  34.58 
 
 
243 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1261  DSBA oxidoreductase  33.03 
 
 
235 aa  124  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1057  DSBA oxidoreductase  35.24 
 
 
235 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1700  DSBA oxidoreductase  33.01 
 
 
227 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  34.58 
 
 
243 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0252  DSBA oxidoreductase  34.58 
 
 
243 aa  123  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5000  DSBA oxidoreductase  32.38 
 
 
233 aa  123  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324442  normal  0.0420894 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2852  polyketide biosynthesis associated protein  36.57 
 
 
214 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  37.44 
 
 
230 aa  122  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  34.26 
 
 
224 aa  122  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1717  DSBA oxidoreductase  35.94 
 
 
221 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2073  DSBA oxidoreductase  35.24 
 
 
256 aa  122  6e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.232317  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18220  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  36.11 
 
 
218 aa  121  9e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1893  DSBA oxidoreductase  33.81 
 
 
238 aa  120  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  31.94 
 
 
220 aa  118  6e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3082  DSBA oxidoreductase  34.45 
 
 
216 aa  118  7.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  0.192023 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2136  DSBA oxidoreductase  30.81 
 
 
213 aa  117  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.883465  normal  0.0421817 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2832  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
213 aa  114  7.999999999999999e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84064  normal  0.0678708 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2493  dithiol-disulfide isomerase  27.91 
 
 
242 aa  114  8.999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0591  DSBA oxidoreductase  37.16 
 
 
238 aa  112  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.699138  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  31.28 
 
 
221 aa  112  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0258  DSBA oxidoreductase  33.49 
 
 
208 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1542  DSBA oxidoreductase  34.86 
 
 
224 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1034  DSBA oxidoreductase  36.15 
 
 
215 aa  111  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1488  DSBA oxidoreductase  32 
 
 
234 aa  110  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1267  frnE protein  33.65 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.454512  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0024  DSBA oxidoreductase  35.85 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4948  DSBA oxidoreductase  34.7 
 
 
221 aa  109  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.576797 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0326  DSBA oxidoreductase  36.27 
 
 
237 aa  109  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3550  DSBA oxidoreductase  33.18 
 
 
220 aa  108  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.916573  normal  0.901837 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1583  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 
210 aa  108  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5431  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
213 aa  108  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4882  DSBA oxidoreductase  33.49 
 
 
229 aa  107  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01681  hypothetical protein  33.02 
 
 
222 aa  106  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4148  DSBA oxidoreductase  33.8 
 
 
241 aa  106  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1922  DSBA oxidoreductase  36.67 
 
 
218 aa  106  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22650  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  33.8 
 
 
228 aa  106  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.483834 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0567  DSBA oxidoreductase  30.52 
 
 
244 aa  106  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  32.26 
 
 
231 aa  105  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0796  DSBA oxidoreductase  33.64 
 
 
221 aa  105  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2174  DSBA oxidoreductase  33.85 
 
 
209 aa  105  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132146  hitchhiker  0.0000045366 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>