187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2136 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2136  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 213 aa  439  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.883465  normal  0.0421817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2694  DSBA oxidoreductase  49.51 
 
 		 235 aa  206  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2493  dithiol-disulfide isomerase  46.15 
 
 		 242 aa  205  3e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5000  DSBA oxidoreductase  48.06 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324442  normal  0.0420894 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  47.32 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1488  DSBA oxidoreductase  45.19 
 
 		 234 aa  195  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  45.89 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0258  DSBA oxidoreductase  44.71 
 
 		 208 aa  186  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  45.19 
 
 		 243 aa  184  9e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  44.23 
 
 		 243 aa  181  7e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0308  FrnE protein  44.23 
 
 		 243 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00686429  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  43.75 
 
 		 243 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  43.75 
 
 		 243 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0252  DSBA oxidoreductase  43.75 
 
 		 243 aa  176  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  43.27 
 
 		 243 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1261  DSBA oxidoreductase  41.78 
 
 		 235 aa  171  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2343  DSBA oxidoreductase  39.81 
 
 		 234 aa  169  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590857  normal  0.036783 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0567  DSBA oxidoreductase  39.61 
 
 		 244 aa  169  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2073  DSBA oxidoreductase  40.58 
 
 		 256 aa  169  4e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.232317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0941  DSBA oxidoreductase  39.71 
 
 		 240 aa  166  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.203124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0704  DSBA oxidoreductase  40.1 
 
 		 235 aa  165  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1174  DSBA oxidoreductase  43.41 
 
 		 239 aa  162  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.196548 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1057  DSBA oxidoreductase  42.51 
 
 		 235 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1200  DSBA oxidoreductase  43.33 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5431  DSBA oxidoreductase  40.28 
 
 		 213 aa  158  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2174  DSBA oxidoreductase  37.62 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132146  hitchhiker  0.0000045366 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3550  DSBA oxidoreductase  37.62 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.916573  normal  0.901837 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  38.21 
 
 		 230 aa  156  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4436  DSBA oxidoreductase  38.25 
 
 		 239 aa  149  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1267  frnE protein  36.27 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.454512  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  38.39 
 
 		 235 aa  149  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4882  DSBA oxidoreductase  37.38 
 
 		 229 aa  147  9e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0591  DSBA oxidoreductase  37.8 
 
 		 238 aa  146  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.699138  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2594  DSBA oxidoreductase  35.71 
 
 		 212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0550  polyketide biosynthesis associated protein  37.75 
 
 		 233 aa  145  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3441  DSBA oxidoreductase  35.27 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18220  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  36.36 
 
 		 218 aa  142  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22650  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  36.06 
 
 		 228 aa  141  8e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.483834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4753  DSBA oxidoreductase  38.83 
 
 		 219 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1893  DSBA oxidoreductase  37.98 
 
 		 238 aa  140  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1148  DSBA oxidoreductase  34.27 
 
 		 237 aa  140  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0024  DSBA oxidoreductase  34.93 
 
 		 211 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2368  DSBA oxidoreductase  36.71 
 
 		 203 aa  134  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.919583  normal  0.0250813 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0979  DSBA oxidoreductase  32.55 
 
 		 215 aa  135  7.000000000000001e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00033798  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22550  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  41 
 
 		 227 aa  134  8e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0738  DSBA oxidoreductase  34.95 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122622 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  33.81 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  36.49 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  34.76 
 
 		 221 aa  132  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0721  DSBA oxidoreductase  34.47 
 
 		 244 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874736  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2541  DSBA oxidoreductase  34.11 
 
 		 247 aa  131  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  33.81 
 
 		 223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.474005 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0363  DSBA oxidoreductase  33.02 
 
 		 243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0846  DSBA oxidoreductase  33.02 
 
 		 243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96876  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0818  DSBA oxidoreductase  33.02 
 
 		 243 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0728  DSBA oxidoreductase  36.11 
 
 		 230 aa  129  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2795  DSBA oxidoreductase  32.38 
 
 		 207 aa  128  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  37.32 
 
 		 225 aa  127  9.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3914  DSBA oxidoreductase  32.37 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1639  DSBA oxidoreductase  35.38 
 
 		 250 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1398  DSBA oxidoreductase  35.85 
 
 		 237 aa  126  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394424  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3936  DSBA oxidoreductase  32.08 
 
 		 270 aa  125  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.763999  hitchhiker  0.00370443 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0326  DSBA oxidoreductase  35.29 
 
 		 237 aa  126  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4148  DSBA oxidoreductase  36.14 
 
 		 241 aa  125  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0577  frnE protein, putative  32.56 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0543  dsba oxidoreductase  32.56 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1347  DSBA oxidoreductase  32.39 
 
 		 233 aa  122  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  34.74 
 
 		 231 aa  122  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4106  DSBA oxidoreductase  32.35 
 
 		 229 aa  122  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1937  DSBA oxidoreductase  31.43 
 
 		 222 aa  122  6e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1583  DSBA oxidoreductase  33.18 
 
 		 210 aa  121  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4177  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  31.4 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.743231  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1557  putative DSBA oxidoreductase  33.64 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1700  DSBA oxidoreductase  31.51 
 
 		 227 aa  120  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1083  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.979731  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2061  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6638  DsbA oxidoreductase  34.62 
 
 		 231 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0020  DSBA oxidoreductase  34.74 
 
 		 211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  32.56 
 
 		 224 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0515  DSBA oxidoreductase  31.73 
 
 		 221 aa  118  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2709  DSBA oxidoreductase  35 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.111017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6424  DSBA oxidoreductase  30.81 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.450496 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0416  putative dithiol-disulfide isomerase  29.86 
 
 		 221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7204  DSBA oxidoreductase  29.38 
 
 		 221 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1278  DSBA oxidoreductase  29.95 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000336164  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3008  DSBA oxidoreductase  30.7 
 
 		 248 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0633  DSBA oxidoreductase  31.75 
 
 		 220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218426  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0261  DSBA oxidoreductase  31.9 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0132035 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2720  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.33 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.162153 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01724  polyketide synthase  36.32 
 
 		 213 aa  112  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0654  DSBA oxidoreductase  31.28 
 
 		 220 aa  111  9e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3082  DSBA oxidoreductase  30.77 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  0.192023 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01056  probable DSBA oxidoreductase  34.17 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3987  DSBA oxidoreductase  31.31 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1564  DsbA oxidoreductase  32.54 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0406976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1100  hypothetical protein  30.48 
 
 		 217 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3318  DSBA oxidoreductase  31.63 
 
 		 227 aa  109  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2316  DSBA oxidoreductase  29.91 
 
 		 221 aa  109  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3751  DSBA oxidoreductase  28.64 
 
 		 222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>