201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0721 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_0721  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
244 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874736  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0738  DSBA oxidoreductase  98.77 
 
 
244 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.122622 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0818  DSBA oxidoreductase  91.77 
 
 
243 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3936  DSBA oxidoreductase  90.95 
 
 
270 aa  440  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.763999  hitchhiker  0.00370443 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0363  DSBA oxidoreductase  91.36 
 
 
243 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0846  DSBA oxidoreductase  91.36 
 
 
243 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96876  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2541  DSBA oxidoreductase  90.12 
 
 
247 aa  432  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  46.38 
 
 
235 aa  195  6e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  40.43 
 
 
236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1488  DSBA oxidoreductase  42.92 
 
 
234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0591  DSBA oxidoreductase  45.19 
 
 
238 aa  182  4.0000000000000006e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.699138  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1893  DSBA oxidoreductase  43.93 
 
 
238 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4148  DSBA oxidoreductase  42.8 
 
 
241 aa  174  8e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0704  DSBA oxidoreductase  41.7 
 
 
235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0550  polyketide biosynthesis associated protein  39.57 
 
 
233 aa  171  6.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2694  DSBA oxidoreductase  38.89 
 
 
235 aa  170  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2073  DSBA oxidoreductase  42.21 
 
 
256 aa  170  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.232317  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5000  DSBA oxidoreductase  37.23 
 
 
233 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324442  normal  0.0420894 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1267  frnE protein  45.19 
 
 
223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.454512  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1278  DSBA oxidoreductase  43.13 
 
 
222 aa  166  5e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000336164  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4436  DSBA oxidoreductase  41.77 
 
 
239 aa  165  5.9999999999999996e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0941  DSBA oxidoreductase  38.89 
 
 
240 aa  165  8e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.203124  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1057  DSBA oxidoreductase  37.87 
 
 
235 aa  162  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0567  DSBA oxidoreductase  38.27 
 
 
244 aa  162  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1261  DSBA oxidoreductase  42.19 
 
 
235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2594  DSBA oxidoreductase  45.85 
 
 
212 aa  162  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4882  DSBA oxidoreductase  42.25 
 
 
229 aa  161  9e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  34.85 
 
 
243 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3550  DSBA oxidoreductase  43.14 
 
 
220 aa  159  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.916573  normal  0.901837 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  46.01 
 
 
230 aa  159  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2493  dithiol-disulfide isomerase  34.3 
 
 
242 aa  159  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  34.85 
 
 
243 aa  159  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2343  DSBA oxidoreductase  37.23 
 
 
234 aa  159  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590857  normal  0.036783 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  34.44 
 
 
243 aa  158  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  34.44 
 
 
243 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0308  FrnE protein  34.02 
 
 
243 aa  156  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00686429  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18220  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  43.87 
 
 
218 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  34.44 
 
 
243 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  39.05 
 
 
209 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0252  DSBA oxidoreductase  33.61 
 
 
243 aa  154  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1639  DSBA oxidoreductase  45.49 
 
 
250 aa  151  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4261  isomerase, putative  38.4 
 
 
232 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3441  DSBA oxidoreductase  39.25 
 
 
215 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22650  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  37.66 
 
 
228 aa  149  3e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.483834 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1398  DSBA oxidoreductase  40.53 
 
 
237 aa  148  8e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394424  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2174  DSBA oxidoreductase  41.55 
 
 
209 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132146  hitchhiker  0.0000045366 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0258  DSBA oxidoreductase  36.84 
 
 
208 aa  145  5e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  40.49 
 
 
223 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.474005 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1148  DSBA oxidoreductase  35.15 
 
 
237 aa  144  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22550  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  42.44 
 
 
227 aa  142  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  39.51 
 
 
223 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0326  DSBA oxidoreductase  43.14 
 
 
237 aa  141  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  38.83 
 
 
223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5431  DSBA oxidoreductase  40.1 
 
 
213 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2107  DSBA oxidoreductase  37.23 
 
 
226 aa  138  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  41.55 
 
 
225 aa  135  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  37.5 
 
 
231 aa  132  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1979  DSBA oxidoreductase  38.56 
 
 
224 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2136  DSBA oxidoreductase  34.47 
 
 
213 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.883465  normal  0.0421817 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3424  DSBA oxidoreductase  37.23 
 
 
226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4435  DSBA oxidoreductase  37.28 
 
 
226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.639129  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1174  DSBA oxidoreductase  33.47 
 
 
239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.196548 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1200  DSBA oxidoreductase  35.86 
 
 
237 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153386  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6909  DSBA oxidoreductase  36.36 
 
 
226 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4898  DSBA oxidoreductase  37.07 
 
 
226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3265  DSBA oxidoreductase  37.07 
 
 
226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0024  DSBA oxidoreductase  37.98 
 
 
211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3914  DSBA oxidoreductase  34.63 
 
 
215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  36.15 
 
 
221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4177  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  34.15 
 
 
215 aa  124  9e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.743231  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4753  DSBA oxidoreductase  40.61 
 
 
219 aa  125  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1700  DSBA oxidoreductase  35.68 
 
 
227 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4389  DSBA oxidoreductase  36.49 
 
 
221 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0887682  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6638  DsbA oxidoreductase  37.23 
 
 
231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1717  DSBA oxidoreductase  38.16 
 
 
221 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0979  DSBA oxidoreductase  30.62 
 
 
215 aa  119  6e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00033798  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01724  polyketide synthase  41.55 
 
 
213 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3756  DSBA oxidoreductase  36.84 
 
 
221 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.734213  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0020  DSBA oxidoreductase  38.16 
 
 
211 aa  115  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7204  DSBA oxidoreductase  34.15 
 
 
221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0416  putative dithiol-disulfide isomerase  34.63 
 
 
221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  32.69 
 
 
214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5468  hypothetical protein  36.89 
 
 
221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3751  DSBA oxidoreductase  33.01 
 
 
222 aa  112  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  32.69 
 
 
217 aa  112  8.000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4106  DSBA oxidoreductase  35.92 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3598  DSBA oxidoreductase  35.44 
 
 
220 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.432657 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3008  DSBA oxidoreductase  33.18 
 
 
248 aa  109  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1605  DSBA oxidoreductase  33.66 
 
 
215 aa  108  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  33.03 
 
 
220 aa  108  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2296  DSBA oxidoreductase  34.74 
 
 
221 aa  108  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00720993  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  30.92 
 
 
224 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1583  DSBA oxidoreductase  32.21 
 
 
210 aa  105  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0515  DSBA oxidoreductase  26.42 
 
 
221 aa  105  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2720  thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.05 
 
 
219 aa  103  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.162153 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6424  DSBA oxidoreductase  31.9 
 
 
217 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.450496 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0577  frnE protein, putative  30.29 
 
 
224 aa  102  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0543  dsba oxidoreductase  30.29 
 
 
224 aa  102  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0728  DSBA oxidoreductase  32.26 
 
 
230 aa  102  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1642  DSBA oxidoreductase  30.19 
 
 
218 aa  101  9e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.420211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>