165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4261 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4261  isomerase, putative  100 
 
 		 232 aa  480  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3424  DSBA oxidoreductase  45.78 
 
 		 226 aa  204  7e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4435  DSBA oxidoreductase  45.78 
 
 		 226 aa  204  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.639129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6909  DSBA oxidoreductase  44.89 
 
 		 226 aa  201  9e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4898  DSBA oxidoreductase  44.44 
 
 		 226 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3265  DSBA oxidoreductase  44.44 
 
 		 226 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1979  DSBA oxidoreductase  42.22 
 
 		 224 aa  182  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2107  DSBA oxidoreductase  39.01 
 
 		 226 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0363  DSBA oxidoreductase  38.89 
 
 		 243 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0846  DSBA oxidoreductase  38.89 
 
 		 243 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96876  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3936  DSBA oxidoreductase  39.22 
 
 		 270 aa  155  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.763999  hitchhiker  0.00370443 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0818  DSBA oxidoreductase  38.46 
 
 		 243 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2541  DSBA oxidoreductase  38.36 
 
 		 247 aa  154  9e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0738  DSBA oxidoreductase  38.82 
 
 		 244 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122622 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0721  DSBA oxidoreductase  38.4 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874736  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1261  DSBA oxidoreductase  36.91 
 
 		 235 aa  138  7.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0704  DSBA oxidoreductase  34.85 
 
 		 235 aa  133  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0567  DSBA oxidoreductase  33.2 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  32.62 
 
 		 236 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1278  DSBA oxidoreductase  31.31 
 
 		 222 aa  128  9.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000336164  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4882  DSBA oxidoreductase  34.82 
 
 		 229 aa  125  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6855  DsbA oxidoreductase  41.94 
 
 		 155 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.57052  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2073  DSBA oxidoreductase  33.04 
 
 		 256 aa  122  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.232317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0941  DSBA oxidoreductase  30.87 
 
 		 240 aa  122  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.203124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0550  polyketide biosynthesis associated protein  30.57 
 
 		 233 aa  118  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3550  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 		 220 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.916573  normal  0.901837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1893  DSBA oxidoreductase  31.49 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2174  DSBA oxidoreductase  34.16 
 
 		 209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132146  hitchhiker  0.0000045366 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5000  DSBA oxidoreductase  30.13 
 
 		 233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324442  normal  0.0420894 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  30.47 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1148  DSBA oxidoreductase  29.49 
 
 		 237 aa  109  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  32.07 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0258  DSBA oxidoreductase  32.04 
 
 		 208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1267  frnE protein  30.67 
 
 		 223 aa  108  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.454512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  32.07 
 
 		 243 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2493  dithiol-disulfide isomerase  26.47 
 
 		 242 aa  108  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1057  DSBA oxidoreductase  33.66 
 
 		 235 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22650  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  27.63 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.483834 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  31.65 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0591  DSBA oxidoreductase  32.19 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.699138  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  33.19 
 
 		 230 aa  106  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  31.46 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3441  DSBA oxidoreductase  30.24 
 
 		 215 aa  105  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2694  DSBA oxidoreductase  29.57 
 
 		 235 aa  105  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1639  DSBA oxidoreductase  32.78 
 
 		 250 aa  104  9e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0252  DSBA oxidoreductase  30.8 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  32.04 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2594  DSBA oxidoreductase  33.65 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  31.7 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0308  FrnE protein  30.66 
 
 		 243 aa  102  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00686429  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2343  DSBA oxidoreductase  32.21 
 
 		 234 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590857  normal  0.036783 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  31 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  30.09 
 
 		 243 aa  102  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1488  DSBA oxidoreductase  28.51 
 
 		 234 aa  102  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4436  DSBA oxidoreductase  30.86 
 
 		 239 aa  102  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0024  DSBA oxidoreductase  31.53 
 
 		 211 aa  102  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  28.29 
 
 		 209 aa  102  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4148  DSBA oxidoreductase  30.54 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5431  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6638  DsbA oxidoreductase  31.58 
 
 		 231 aa  99.8  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0020  DSBA oxidoreductase  31.68 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  31.08 
 
 		 223 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2136  DSBA oxidoreductase  29.27 
 
 		 213 aa  98.2  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.883465  normal  0.0421817 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18220  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  33.66 
 
 		 218 aa  96.7  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1174  DSBA oxidoreductase  27.98 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.196548 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1583  DSBA oxidoreductase  31.19 
 
 		 210 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  30.48 
 
 		 223 aa  95.1  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.474005 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1200  DSBA oxidoreductase  27.04 
 
 		 237 aa  94.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0326  DSBA oxidoreductase  32.51 
 
 		 237 aa  93.2  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  30.1 
 
 		 221 aa  93.2  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1398  DSBA oxidoreductase  30.05 
 
 		 237 aa  92.8  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394424  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22550  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  28.99 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0746  DSBA oxidoreductase  29.82 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2795  DSBA oxidoreductase  28.71 
 
 		 207 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4753  DSBA oxidoreductase  27.09 
 
 		 219 aa  85.9  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3914  DSBA oxidoreductase  27.75 
 
 		 215 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1922  DSBA oxidoreductase  28.44 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  26.7 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3082  DSBA oxidoreductase  27.18 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  0.192023 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01724  polyketide synthase  31.68 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4106  DSBA oxidoreductase  28.5 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7204  DSBA oxidoreductase  26.7 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4177  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  26.79 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.743231  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1034  DSBA oxidoreductase  28.3 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1717  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1700  DSBA oxidoreductase  27.54 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6860  DsbA oxidoreductase  50.7 
 
 		 79 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2145  DSBA oxidoreductase  27.8 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1557  putative DSBA oxidoreductase  27.19 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0577  frnE protein, putative  25.91 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3756  DSBA oxidoreductase  31.53 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.734213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3104  thioredoxin domain-containing protein  28.77 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0543  dsba oxidoreductase  25.91 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0979  DSBA oxidoreductase  24.17 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00033798  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1444  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  29.38 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4389  DSBA oxidoreductase  28.83 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0887682  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  25.35 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1564  DsbA oxidoreductase  26.42 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0406976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0416  putative dithiol-disulfide isomerase  25.46 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>