95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6855 on replicon NC_008545
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008545  Bcen2424_6855  DsbA oxidoreductase  100 
 
 
155 aa  311  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.57052  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4435  DSBA oxidoreductase  64.71 
 
 
226 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.639129  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3424  DSBA oxidoreductase  64.71 
 
 
226 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6909  DSBA oxidoreductase  63.4 
 
 
226 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3265  DSBA oxidoreductase  63.4 
 
 
226 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4898  DSBA oxidoreductase  63.4 
 
 
226 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1979  DSBA oxidoreductase  60.78 
 
 
224 aa  184  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4261  isomerase, putative  41.94 
 
 
232 aa  124  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2107  DSBA oxidoreductase  40.52 
 
 
226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2541  DSBA oxidoreductase  40.25 
 
 
247 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0846  DSBA oxidoreductase  39.75 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96876  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0721  DSBA oxidoreductase  39.24 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874736  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0363  DSBA oxidoreductase  39.75 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0738  DSBA oxidoreductase  39.24 
 
 
244 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.122622 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0818  DSBA oxidoreductase  39.13 
 
 
243 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  36.91 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3936  DSBA oxidoreductase  37.97 
 
 
270 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.763999  hitchhiker  0.00370443 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1148  DSBA oxidoreductase  32.91 
 
 
237 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1278  DSBA oxidoreductase  33.82 
 
 
222 aa  69.3  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000336164  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0941  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 
240 aa  69.3  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.203124  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2343  DSBA oxidoreductase  37.5 
 
 
234 aa  68.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590857  normal  0.036783 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1200  DSBA oxidoreductase  38.71 
 
 
237 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153386  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2493  dithiol-disulfide isomerase  29.81 
 
 
242 aa  65.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  33.57 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5000  DSBA oxidoreductase  32.65 
 
 
233 aa  65.5  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324442  normal  0.0420894 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1893  DSBA oxidoreductase  32.45 
 
 
238 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1174  DSBA oxidoreductase  33.77 
 
 
239 aa  65.1  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.196548 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1057  DSBA oxidoreductase  36.42 
 
 
235 aa  63.9  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0704  DSBA oxidoreductase  32.72 
 
 
235 aa  63.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0550  polyketide biosynthesis associated protein  31.85 
 
 
233 aa  63.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0326  DSBA oxidoreductase  37.21 
 
 
237 aa  62.4  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2136  DSBA oxidoreductase  32.8 
 
 
213 aa  62.8  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.883465  normal  0.0421817 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0567  DSBA oxidoreductase  31.18 
 
 
244 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1488  DSBA oxidoreductase  31.54 
 
 
234 aa  60.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0591  DSBA oxidoreductase  34.23 
 
 
238 aa  60.5  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.699138  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  32.8 
 
 
243 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2694  DSBA oxidoreductase  30.13 
 
 
235 aa  58.9  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  33.86 
 
 
225 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  32.8 
 
 
243 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  32 
 
 
243 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  32.8 
 
 
243 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  34.29 
 
 
220 aa  58.2  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0308  FrnE protein  33.06 
 
 
243 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00686429  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2073  DSBA oxidoreductase  26.92 
 
 
256 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.232317  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22650  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  30.26 
 
 
228 aa  56.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.483834 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  32.26 
 
 
243 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  31.39 
 
 
209 aa  55.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4148  DSBA oxidoreductase  32.67 
 
 
241 aa  55.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0252  DSBA oxidoreductase  31.2 
 
 
243 aa  55.1  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4882  DSBA oxidoreductase  29.94 
 
 
229 aa  54.7  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6638  DsbA oxidoreductase  30.32 
 
 
231 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1261  DSBA oxidoreductase  29.63 
 
 
235 aa  53.5  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1922  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 
218 aa  53.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18220  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  36.03 
 
 
218 aa  53.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  30.14 
 
 
223 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0258  DSBA oxidoreductase  30.58 
 
 
208 aa  51.6  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1700  DSBA oxidoreductase  31.69 
 
 
227 aa  50.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  28.57 
 
 
223 aa  51.2  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2709  DSBA oxidoreductase  30.07 
 
 
214 aa  50.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.111017  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0979  DSBA oxidoreductase  32.43 
 
 
215 aa  50.4  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00033798  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4753  DSBA oxidoreductase  35.59 
 
 
219 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22550  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  30.95 
 
 
227 aa  50.4  0.000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  29.01 
 
 
235 aa  50.4  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1398  DSBA oxidoreductase  29.55 
 
 
237 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394424  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  29.86 
 
 
223 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.474005 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  30 
 
 
217 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0020  DSBA oxidoreductase  30.71 
 
 
211 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3441  DSBA oxidoreductase  29.55 
 
 
215 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0746  DSBA oxidoreductase  26.92 
 
 
215 aa  48.1  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0024  DSBA oxidoreductase  31.82 
 
 
211 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1717  DSBA oxidoreductase  30.88 
 
 
221 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2296  DSBA oxidoreductase  31.93 
 
 
221 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00720993  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3756  DSBA oxidoreductase  30.88 
 
 
221 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.734213  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2174  DSBA oxidoreductase  31.85 
 
 
209 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132146  hitchhiker  0.0000045366 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2061  DSBA oxidoreductase  31.36 
 
 
215 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1564  DsbA oxidoreductase  32.26 
 
 
212 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0406976  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0633  DSBA oxidoreductase  29.2 
 
 
220 aa  45.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218426  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0654  DSBA oxidoreductase  29.2 
 
 
220 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4436  DSBA oxidoreductase  29.45 
 
 
239 aa  45.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3550  DSBA oxidoreductase  30.95 
 
 
220 aa  44.7  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.916573  normal  0.901837 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  29.08 
 
 
221 aa  43.9  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0115  DSBA oxidoreductase  28.15 
 
 
232 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.133072  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5468  hypothetical protein  25.87 
 
 
221 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1444  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  32.95 
 
 
240 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4389  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 
221 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0887682  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4177  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  27.78 
 
 
215 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.743231  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3104  thioredoxin domain-containing protein  32.95 
 
 
240 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3008  DSBA oxidoreductase  32.5 
 
 
248 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01056  probable DSBA oxidoreductase  31.34 
 
 
211 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3914  DSBA oxidoreductase  26.19 
 
 
215 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  27.48 
 
 
214 aa  42  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5431  DSBA oxidoreductase  31.85 
 
 
213 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1267  frnE protein  31.08 
 
 
223 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.454512  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7204  DSBA oxidoreductase  29.01 
 
 
221 aa  41.2  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1557  putative DSBA oxidoreductase  27.82 
 
 
222 aa  40.4  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.262117 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>