97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6860 on replicon NC_008545
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008545  Bcen2424_6860  DsbA oxidoreductase  100 
 
 
79 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1979  DSBA oxidoreductase  63.89 
 
 
224 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3265  DSBA oxidoreductase  61.11 
 
 
226 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4898  DSBA oxidoreductase  61.11 
 
 
226 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4435  DSBA oxidoreductase  61.11 
 
 
226 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.639129  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3424  DSBA oxidoreductase  61.11 
 
 
226 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6909  DSBA oxidoreductase  59.72 
 
 
226 aa  100  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2107  DSBA oxidoreductase  56.94 
 
 
226 aa  93.6  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4261  isomerase, putative  50.7 
 
 
232 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01724  polyketide synthase  40 
 
 
213 aa  61.2  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18220  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  56.82 
 
 
218 aa  60.8  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1278  DSBA oxidoreductase  34.38 
 
 
222 aa  60.5  0.000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000336164  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1057  DSBA oxidoreductase  42.19 
 
 
235 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  43.75 
 
 
236 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2073  DSBA oxidoreductase  40.28 
 
 
256 aa  57.8  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.232317  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0721  DSBA oxidoreductase  35.37 
 
 
244 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874736  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2594  DSBA oxidoreductase  59.46 
 
 
212 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0567  DSBA oxidoreductase  48.94 
 
 
244 aa  55.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2541  DSBA oxidoreductase  38.57 
 
 
247 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0704  DSBA oxidoreductase  48 
 
 
235 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0738  DSBA oxidoreductase  37.14 
 
 
244 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.122622 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0818  DSBA oxidoreductase  37.14 
 
 
243 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0363  DSBA oxidoreductase  37.14 
 
 
243 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0308  FrnE protein  41.54 
 
 
243 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00686429  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3936  DSBA oxidoreductase  37.14 
 
 
270 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.763999  hitchhiker  0.00370443 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0846  DSBA oxidoreductase  37.14 
 
 
243 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96876  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0252  DSBA oxidoreductase  41.54 
 
 
243 aa  53.9  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3550  DSBA oxidoreductase  39.66 
 
 
220 aa  53.5  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.916573  normal  0.901837 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  41.54 
 
 
243 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4882  DSBA oxidoreductase  44.23 
 
 
229 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  41.54 
 
 
243 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1267  frnE protein  41.38 
 
 
223 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.454512  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  41.54 
 
 
243 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  41.54 
 
 
243 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5431  DSBA oxidoreductase  41.94 
 
 
213 aa  52  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0020  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
211 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0258  DSBA oxidoreductase  41.54 
 
 
208 aa  52.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0550  polyketide biosynthesis associated protein  34.48 
 
 
233 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  41.54 
 
 
243 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1398  DSBA oxidoreductase  48.98 
 
 
237 aa  51.6  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394424  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1639  DSBA oxidoreductase  49.06 
 
 
250 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1261  DSBA oxidoreductase  37.66 
 
 
235 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  32.86 
 
 
231 aa  50.8  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  31.51 
 
 
221 aa  50.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0024  DSBA oxidoreductase  28.99 
 
 
211 aa  50.1  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  30.3 
 
 
223 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0941  DSBA oxidoreductase  32.39 
 
 
240 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.203124  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  41.3 
 
 
223 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.474005 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  38.81 
 
 
235 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1488  DSBA oxidoreductase  38.3 
 
 
234 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  41.3 
 
 
223 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1893  DSBA oxidoreductase  46.34 
 
 
238 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4436  DSBA oxidoreductase  42.59 
 
 
239 aa  47.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  62.5 
 
 
230 aa  47.4  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2694  DSBA oxidoreductase  44.68 
 
 
235 aa  47.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_003296  RS01681  hypothetical protein  35.94 
 
 
222 aa  47  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5000  DSBA oxidoreductase  46.34 
 
 
233 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324442  normal  0.0420894 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2136  DSBA oxidoreductase  44.19 
 
 
213 aa  45.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.883465  normal  0.0421817 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3104  thioredoxin domain-containing protein  41.07 
 
 
240 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  34.38 
 
 
225 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1444  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  44.9 
 
 
240 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1564  DsbA oxidoreductase  33.33 
 
 
212 aa  44.7  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0406976  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0326  DSBA oxidoreductase  50 
 
 
237 aa  44.3  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1148  DSBA oxidoreductase  46.88 
 
 
237 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  33.82 
 
 
220 aa  43.9  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2391  putative DSBA oxidoreductase  37.14 
 
 
217 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2174  DSBA oxidoreductase  35 
 
 
209 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132146  hitchhiker  0.0000045366 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  30.77 
 
 
214 aa  42.7  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2795  DSBA oxidoreductase  37.5 
 
 
207 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2493  dithiol-disulfide isomerase  38.64 
 
 
242 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3441  DSBA oxidoreductase  30.23 
 
 
215 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  34.85 
 
 
214 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4948  DSBA oxidoreductase  30.65 
 
 
221 aa  42  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.576797 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0591  DSBA oxidoreductase  35.62 
 
 
238 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.699138  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1583  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 
210 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22650  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  44.44 
 
 
228 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.483834 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3751  DSBA oxidoreductase  30.16 
 
 
222 aa  41.6  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4753  DSBA oxidoreductase  35.71 
 
 
219 aa  41.6  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1026  DSBA oxidoreductase  40.62 
 
 
225 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.834563 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4148  DSBA oxidoreductase  29.69 
 
 
241 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2343  DSBA oxidoreductase  34.88 
 
 
234 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590857  normal  0.036783 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01056  probable DSBA oxidoreductase  34.78 
 
 
211 aa  41.6  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0654  DSBA oxidoreductase  29.69 
 
 
220 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0728  DSBA oxidoreductase  31.34 
 
 
230 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5468  hypothetical protein  51.85 
 
 
221 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22550  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  33.33 
 
 
227 aa  41.2  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4106  DSBA oxidoreductase  38.1 
 
 
229 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3987  DSBA oxidoreductase  32.86 
 
 
228 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  30.91 
 
 
209 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6638  DsbA oxidoreductase  41.03 
 
 
231 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5500  DSBA oxidoreductase  32.47 
 
 
217 aa  40.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.790496  normal  0.0537626 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4389  DSBA oxidoreductase  46.43 
 
 
221 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0887682  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3982  DSBA oxidoreductase  44.44 
 
 
328 aa  40.4  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3756  DSBA oxidoreductase  51.85 
 
 
221 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.734213  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1100  hypothetical protein  30.14 
 
 
217 aa  40.4  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0543  dsba oxidoreductase  27.94 
 
 
224 aa  40  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0577  frnE protein, putative  27.94 
 
 
224 aa  40  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>