210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4389 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4389  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 221 aa  454  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0887682  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1717  DSBA oxidoreductase  81 
 
 		 221 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3756  DSBA oxidoreductase  79.19 
 
 		 221 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.734213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5468  hypothetical protein  76.47 
 
 		 221 aa  352  2.9999999999999997e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1542  DSBA oxidoreductase  67.42 
 
 		 224 aa  278  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1557  putative DSBA oxidoreductase  42.58 
 
 		 222 aa  182  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1922  DSBA oxidoreductase  42.72 
 
 		 218 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1347  DSBA oxidoreductase  38.71 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1700  DSBA oxidoreductase  37.85 
 
 		 227 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  40.09 
 
 		 224 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3082  DSBA oxidoreductase  38.54 
 
 		 216 aa  164  8e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  0.192023 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  40.18 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.474005 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  39.27 
 
 		 223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1502  DSBA oxidoreductase  39.91 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0283596 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2709  DSBA oxidoreductase  38.35 
 
 		 214 aa  159  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.111017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  40.47 
 
 		 223 aa  159  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1034  DSBA oxidoreductase  40.09 
 
 		 215 aa  158  6e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0577  frnE protein, putative  39.19 
 
 		 224 aa  157  9e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0543  dsba oxidoreductase  39.19 
 
 		 224 aa  157  9e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  36.49 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1083  DSBA oxidoreductase  39.71 
 
 		 216 aa  156  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.979731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3914  DSBA oxidoreductase  41.43 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1441  DSBA oxidoreductase  38.97 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0402577 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2852  polyketide biosynthesis associated protein  38.5 
 
 		 214 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  39.45 
 
 		 231 aa  148  6e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4177  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  41.23 
 
 		 215 aa  147  9e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.743231  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2316  DSBA oxidoreductase  36.36 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  35.32 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7204  DSBA oxidoreductase  38.36 
 
 		 221 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2795  DSBA oxidoreductase  39.49 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2073  DSBA oxidoreductase  41.18 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.232317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0967  DSBA oxidoreductase  37.5 
 
 		 220 aa  143  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.431519  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0115  DSBA oxidoreductase  37.85 
 
 		 232 aa  142  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.133072  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1564  DsbA oxidoreductase  40.47 
 
 		 212 aa  141  9e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0406976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  38.28 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2061  DSBA oxidoreductase  38.03 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0024  DSBA oxidoreductase  39.62 
 
 		 211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3550  DSBA oxidoreductase  39.05 
 
 		 220 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.916573  normal  0.901837 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3318  DSBA oxidoreductase  39.55 
 
 		 227 aa  139  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  37.32 
 
 		 225 aa  138  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  35.41 
 
 		 217 aa  138  7e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3008  DSBA oxidoreductase  37.56 
 
 		 248 aa  137  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1583  DSBA oxidoreductase  39 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5431  DSBA oxidoreductase  39.52 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1605  DSBA oxidoreductase  37.38 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01056  probable DSBA oxidoreductase  33.49 
 
 		 211 aa  137  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0416  putative dithiol-disulfide isomerase  37.33 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0952  DSBA oxidoreductase  33.01 
 
 		 219 aa  134  8e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.440606  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3751  DSBA oxidoreductase  34.42 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3598  DSBA oxidoreductase  37.09 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.432657 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4948  DSBA oxidoreductase  35.56 
 
 		 221 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.576797 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  35.41 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  35.65 
 
 		 236 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1642  DSBA oxidoreductase  34.88 
 
 		 218 aa  131  6.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.420211  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0796  DSBA oxidoreductase  35.11 
 
 		 221 aa  131  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1937  DSBA oxidoreductase  35.5 
 
 		 222 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2343  DSBA oxidoreductase  35.65 
 
 		 234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590857  normal  0.036783 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0567  DSBA oxidoreductase  35.75 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2694  DSBA oxidoreductase  35.07 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1200  DSBA oxidoreductase  36.41 
 
 		 237 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  35.94 
 
 		 230 aa  128  6e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1174  DSBA oxidoreductase  35.27 
 
 		 239 aa  127  9.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.196548 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0261  DSBA oxidoreductase  35.85 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0132035 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1267  frnE protein  37.32 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.454512  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2832  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84064  normal  0.0678708 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6424  DSBA oxidoreductase  35.94 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.450496 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0970  DSBA oxidoreductase  35 
 
 		 216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227612 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0728  DSBA oxidoreductase  34.88 
 
 		 230 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1398  DSBA oxidoreductase  36.32 
 
 		 237 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394424  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0704  DSBA oxidoreductase  33.8 
 
 		 235 aa  126  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01681  hypothetical protein  34.91 
 
 		 222 aa  125  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5788  DSBA oxidoreductase  35.89 
 
 		 215 aa  125  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487063 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0633  DSBA oxidoreductase  35.62 
 
 		 220 aa  125  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218426  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2720  thiol:disulfide interchange protein DsbA  33.64 
 
 		 219 aa  125  6e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.162153 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0654  DSBA oxidoreductase  35.62 
 
 		 220 aa  125  6e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1948  DSBA oxidoreductase  37.96 
 
 		 216 aa  125  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31619  predicted protein  32.87 
 
 		 267 aa  124  9e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.947079  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4436  DSBA oxidoreductase  39.9 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5000  DSBA oxidoreductase  34.12 
 
 		 233 aa  123  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324442  normal  0.0420894 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0210  DSBA oxidoreductase  36.71 
 
 		 213 aa  122  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0746  DSBA oxidoreductase  33.85 
 
 		 215 aa  122  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0515  DSBA oxidoreductase  31.48 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3441  DSBA oxidoreductase  37.76 
 
 		 215 aa  122  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0721  DSBA oxidoreductase  36.49 
 
 		 244 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874736  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0020  DSBA oxidoreductase  38.5 
 
 		 211 aa  122  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0738  DSBA oxidoreductase  36.49 
 
 		 244 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122622 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4882  DSBA oxidoreductase  36.45 
 
 		 229 aa  122  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1261  DSBA oxidoreductase  36.87 
 
 		 235 aa  121  7e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3961  DSBA oxidoreductase  34.29 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  33.82 
 
 		 209 aa  121  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2296  DSBA oxidoreductase  35.59 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00720993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1100  hypothetical protein  32.41 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1057  DSBA oxidoreductase  37.02 
 
 		 235 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0818  DSBA oxidoreductase  37.62 
 
 		 243 aa  118  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0363  DSBA oxidoreductase  37.62 
 
 		 243 aa  118  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0846  DSBA oxidoreductase  37.62 
 
 		 243 aa  118  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96876  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6638  DsbA oxidoreductase  37.75 
 
 		 231 aa  118  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2493  dithiol-disulfide isomerase  30.49 
 
 		 242 aa  118  7e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3936  DSBA oxidoreductase  37.62 
 
 		 270 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.763999  hitchhiker  0.00370443 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2594  DSBA oxidoreductase  38.05 
 
 		 212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>