179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2107 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2107  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 226 aa  462  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4435  DSBA oxidoreductase  47.77 
 
 		 226 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.639129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4898  DSBA oxidoreductase  46.88 
 
 		 226 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1979  DSBA oxidoreductase  45.78 
 
 		 224 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3265  DSBA oxidoreductase  46.88 
 
 		 226 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3424  DSBA oxidoreductase  47.77 
 
 		 226 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6909  DSBA oxidoreductase  46.43 
 
 		 226 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4261  isomerase, putative  38.84 
 
 		 232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3936  DSBA oxidoreductase  37.44 
 
 		 270 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.763999  hitchhiker  0.00370443 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0818  DSBA oxidoreductase  36.12 
 
 		 243 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0363  DSBA oxidoreductase  36.24 
 
 		 243 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0846  DSBA oxidoreductase  36.24 
 
 		 243 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96876  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0738  DSBA oxidoreductase  37.23 
 
 		 244 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122622 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0721  DSBA oxidoreductase  37.23 
 
 		 244 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874736  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2541  DSBA oxidoreductase  36.56 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1261  DSBA oxidoreductase  34.89 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  33.62 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2073  DSBA oxidoreductase  33.62 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.232317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6855  DsbA oxidoreductase  40.52 
 
 		 155 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.57052  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1057  DSBA oxidoreductase  32.79 
 
 		 235 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4882  DSBA oxidoreductase  34.27 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1278  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000336164  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0567  DSBA oxidoreductase  32.9 
 
 		 244 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  33.96 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0308  FrnE protein  33.33 
 
 		 243 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00686429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  33.02 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2343  DSBA oxidoreductase  31.2 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590857  normal  0.036783 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  30.45 
 
 		 223 aa  113  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2493  dithiol-disulfide isomerase  29.36 
 
 		 242 aa  113  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  33.02 
 
 		 243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  33.02 
 
 		 243 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0704  DSBA oxidoreductase  30.38 
 
 		 235 aa  112  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2594  DSBA oxidoreductase  36.49 
 
 		 212 aa  112  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0258  DSBA oxidoreductase  33.01 
 
 		 208 aa  112  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  33.02 
 
 		 243 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0252  DSBA oxidoreductase  33.49 
 
 		 243 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  33.18 
 
 		 221 aa  111  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  33.76 
 
 		 235 aa  111  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4148  DSBA oxidoreductase  31.51 
 
 		 241 aa  109  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  32.52 
 
 		 225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1893  DSBA oxidoreductase  32.49 
 
 		 238 aa  108  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4436  DSBA oxidoreductase  33.47 
 
 		 239 aa  108  9.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5000  DSBA oxidoreductase  32.87 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324442  normal  0.0420894 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1148  DSBA oxidoreductase  30.38 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0941  DSBA oxidoreductase  28.88 
 
 		 240 aa  105  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.203124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  31.13 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18220  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  32.87 
 
 		 218 aa  105  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  28.14 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3441  DSBA oxidoreductase  29.67 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6638  DsbA oxidoreductase  30.97 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1488  DSBA oxidoreductase  31.9 
 
 		 234 aa  102  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5431  DSBA oxidoreductase  32.41 
 
 		 213 aa  101  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  33.33 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2694  DSBA oxidoreductase  30.88 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01724  polyketide synthase  32.04 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  30.73 
 
 		 223 aa  99.4  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0550  polyketide biosynthesis associated protein  29 
 
 		 233 aa  99.4  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01681  hypothetical protein  32.88 
 
 		 222 aa  99  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1557  putative DSBA oxidoreductase  31.88 
 
 		 222 aa  99.4  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2174  DSBA oxidoreductase  32.02 
 
 		 209 aa  97.8  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132146  hitchhiker  0.0000045366 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22550  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  30.69 
 
 		 227 aa  97.4  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1700  DSBA oxidoreductase  31.16 
 
 		 227 aa  96.7  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  30.28 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.474005 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1174  DSBA oxidoreductase  31.39 
 
 		 239 aa  96.3  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.196548 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1200  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 237 aa  95.1  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  29.49 
 
 		 220 aa  95.1  8e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  27.36 
 
 		 224 aa  95.1  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1267  frnE protein  30.95 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.454512  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3550  DSBA oxidoreductase  29.61 
 
 		 220 aa  94.7  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.916573  normal  0.901837 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0746  DSBA oxidoreductase  29.76 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1639  DSBA oxidoreductase  30.54 
 
 		 250 aa  94.4  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1583  DSBA oxidoreductase  29.61 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6860  DsbA oxidoreductase  56.94 
 
 		 79 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4177  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  30 
 
 		 215 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.743231  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3914  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 215 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1717  DSBA oxidoreductase  31.63 
 
 		 221 aa  92.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4753  DSBA oxidoreductase  29.9 
 
 		 219 aa  92.4  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4389  DSBA oxidoreductase  28.97 
 
 		 221 aa  92  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0887682  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2136  DSBA oxidoreductase  29.95 
 
 		 213 aa  92  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.883465  normal  0.0421817 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3987  DSBA oxidoreductase  32.42 
 
 		 228 aa  91.7  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0591  DSBA oxidoreductase  30.13 
 
 		 238 aa  90.9  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.699138  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3756  DSBA oxidoreductase  31.6 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.734213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0326  DSBA oxidoreductase  32.52 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0654  DSBA oxidoreductase  28.97 
 
 		 220 aa  90.5  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2832  DSBA oxidoreductase  26.85 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84064  normal  0.0678708 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1398  DSBA oxidoreductase  29.76 
 
 		 237 aa  88.2  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394424  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1564  DsbA oxidoreductase  31.16 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0406976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1922  DSBA oxidoreductase  32.02 
 
 		 218 aa  87.4  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5468  hypothetical protein  29.3 
 
 		 221 aa  87.4  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2795  DSBA oxidoreductase  29.06 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2316  DSBA oxidoreductase  31.88 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1441  DSBA oxidoreductase  28.99 
 
 		 214 aa  86.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0402577 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1347  DSBA oxidoreductase  32.06 
 
 		 233 aa  86.3  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1502  DSBA oxidoreductase  28.5 
 
 		 214 aa  85.9  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0283596 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  27.44 
 
 		 214 aa  85.5  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  29.36 
 
 		 217 aa  85.5  7e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2852  polyketide biosynthesis associated protein  29.47 
 
 		 214 aa  85.1  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3082  DSBA oxidoreductase  28.29 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  0.192023 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2709  DSBA oxidoreductase  28.17 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.111017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0633  DSBA oxidoreductase  28.04 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>