201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3082 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3082  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 216 aa  442  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  0.192023 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  48.5 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0577  frnE protein, putative  47.5 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1700  DSBA oxidoreductase  45.41 
 
 		 227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0543  dsba oxidoreductase  47.5 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  41.47 
 
 		 221 aa  195  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1347  DSBA oxidoreductase  42.59 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1557  putative DSBA oxidoreductase  44.39 
 
 		 222 aa  187  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  42.06 
 
 		 220 aa  184  8e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  42.4 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2709  DSBA oxidoreductase  42.86 
 
 		 214 aa  178  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.111017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  39.25 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1922  DSBA oxidoreductase  40.95 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  40.19 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.474005 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5468  hypothetical protein  40.74 
 
 		 221 aa  172  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1717  DSBA oxidoreductase  40.58 
 
 		 221 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1502  DSBA oxidoreductase  41.46 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0283596 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2852  polyketide biosynthesis associated protein  43.96 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1441  DSBA oxidoreductase  43 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0402577 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2316  DSBA oxidoreductase  39.32 
 
 		 221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4389  DSBA oxidoreductase  38.32 
 
 		 221 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0887682  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3756  DSBA oxidoreductase  39.72 
 
 		 221 aa  164  8e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.734213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1583  DSBA oxidoreductase  38.73 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1542  DSBA oxidoreductase  40.18 
 
 		 224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0952  DSBA oxidoreductase  36.49 
 
 		 219 aa  154  7e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.440606  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2795  DSBA oxidoreductase  37.44 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2832  DSBA oxidoreductase  36.02 
 
 		 213 aa  151  8e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84064  normal  0.0678708 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0024  DSBA oxidoreductase  39.32 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  39.42 
 
 		 225 aa  148  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1034  DSBA oxidoreductase  37.91 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  38.07 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1564  DsbA oxidoreductase  37.14 
 
 		 212 aa  139  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0406976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01056  probable DSBA oxidoreductase  37.56 
 
 		 211 aa  139  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0261  DSBA oxidoreductase  37.8 
 
 		 213 aa  138  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0132035 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1083  DSBA oxidoreductase  32.23 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.979731  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  33.03 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0967  DSBA oxidoreductase  37.31 
 
 		 220 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.431519  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  34.3 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1261  DSBA oxidoreductase  37.5 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0020  DSBA oxidoreductase  40.2 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0728  DSBA oxidoreductase  32.56 
 
 		 230 aa  132  6e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2296  DSBA oxidoreductase  35.65 
 
 		 221 aa  131  6.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00720993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7204  DSBA oxidoreductase  36.92 
 
 		 221 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4177  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  35.24 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.743231  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10641  DSBA-like thioredoxin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G06250)  34.6 
 
 		 202 aa  129  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2720  thiol:disulfide interchange protein DsbA  31 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.162153 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3008  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 248 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0416  putative dithiol-disulfide isomerase  35.71 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3914  DSBA oxidoreductase  33.65 
 
 		 215 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5788  DSBA oxidoreductase  35.24 
 
 		 215 aa  126  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487063 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  34.31 
 
 		 209 aa  126  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0941  DSBA oxidoreductase  35.64 
 
 		 240 aa  124  9e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.203124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3751  DSBA oxidoreductase  32.72 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01681  hypothetical protein  34.93 
 
 		 222 aa  123  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2391  putative DSBA oxidoreductase  31.78 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3825  DSBA oxidoreductase  33.51 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0328358 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0550  polyketide biosynthesis associated protein  34.8 
 
 		 233 aa  123  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1200  DSBA oxidoreductase  35.92 
 
 		 237 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1937  DSBA oxidoreductase  31.55 
 
 		 222 aa  122  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3441  DSBA oxidoreductase  39.39 
 
 		 215 aa  122  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6638  DsbA oxidoreductase  35.45 
 
 		 231 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2061  DSBA oxidoreductase  31.43 
 
 		 215 aa  121  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0115  DSBA oxidoreductase  34.01 
 
 		 232 aa  121  8e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.133072  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  32.23 
 
 		 217 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0704  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2073  DSBA oxidoreductase  32.34 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.232317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6424  DSBA oxidoreductase  34.76 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.450496 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  34.5 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  33.18 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5431  DSBA oxidoreductase  35.15 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0515  DSBA oxidoreductase  29.3 
 
 		 221 aa  119  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2195  DSBA oxidoreductase  30.24 
 
 		 215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1057  DSBA oxidoreductase  35.51 
 
 		 235 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3598  DSBA oxidoreductase  30.84 
 
 		 220 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.432657 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31619  predicted protein  35.65 
 
 		 267 aa  118  6e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.947079  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3550  DSBA oxidoreductase  34.62 
 
 		 220 aa  118  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.916573  normal  0.901837 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1948  DSBA oxidoreductase  34.88 
 
 		 216 aa  118  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  33.5 
 
 		 243 aa  117  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5000  DSBA oxidoreductase  31.4 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324442  normal  0.0420894 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1488  DSBA oxidoreductase  31.07 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3987  DSBA oxidoreductase  33.96 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  33.5 
 
 		 243 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3961  DSBA oxidoreductase  36.82 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0308  FrnE protein  33.5 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00686429  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0567  DSBA oxidoreductase  33.65 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1642  DSBA oxidoreductase  32.7 
 
 		 218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.420211  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1100  hypothetical protein  30.05 
 
 		 217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0963  DSBA oxidoreductase  32.11 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0391729  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0210  DSBA oxidoreductase  32.37 
 
 		 213 aa  116  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2174  DSBA oxidoreductase  35.64 
 
 		 209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132146  hitchhiker  0.0000045366 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  30.77 
 
 		 214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1398  DSBA oxidoreductase  32.68 
 
 		 237 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394424  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  33 
 
 		 243 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3318  DSBA oxidoreductase  31.9 
 
 		 227 aa  114  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4882  DSBA oxidoreductase  34.76 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2694  DSBA oxidoreductase  31.43 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  33 
 
 		 243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1605  DSBA oxidoreductase  32.23 
 
 		 215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0258  DSBA oxidoreductase  31.1 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0746  DSBA oxidoreductase  29.52 
 
 		 215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>