203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0952 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0952  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 219 aa  450  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.440606  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1502  DSBA oxidoreductase  56.04 
 
 		 214 aa  234  8e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0283596 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1441  DSBA oxidoreductase  55.02 
 
 		 214 aa  224  6e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0402577 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1557  putative DSBA oxidoreductase  49.76 
 
 		 222 aa  221  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2852  polyketide biosynthesis associated protein  53.55 
 
 		 214 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2316  DSBA oxidoreductase  49.03 
 
 		 221 aa  218  3.9999999999999997e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1347  DSBA oxidoreductase  45.54 
 
 		 233 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3082  DSBA oxidoreductase  38.86 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  0.192023 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  35.51 
 
 		 223 aa  145  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  35.35 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.474005 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  34.88 
 
 		 223 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2709  DSBA oxidoreductase  40.84 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.111017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5468  hypothetical protein  31.71 
 
 		 221 aa  138  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1542  DSBA oxidoreductase  39.39 
 
 		 224 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3756  DSBA oxidoreductase  36.45 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.734213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1564  DsbA oxidoreductase  35.71 
 
 		 212 aa  134  8e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0406976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4389  DSBA oxidoreductase  33.01 
 
 		 221 aa  134  8e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0887682  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1717  DSBA oxidoreductase  34.98 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0115  DSBA oxidoreductase  33.48 
 
 		 232 aa  131  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.133072  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1700  DSBA oxidoreductase  33.18 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  32.24 
 
 		 221 aa  129  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  35.44 
 
 		 220 aa  129  5.0000000000000004e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0577  frnE protein, putative  31.75 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  32.38 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6424  DSBA oxidoreductase  35.35 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.450496 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0261  DSBA oxidoreductase  35.15 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0132035 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0543  dsba oxidoreductase  31.75 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2296  DSBA oxidoreductase  33.03 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00720993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  32.23 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1937  DSBA oxidoreductase  32.86 
 
 		 222 aa  125  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3008  DSBA oxidoreductase  33.18 
 
 		 248 aa  125  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2061  DSBA oxidoreductase  31.34 
 
 		 215 aa  123  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3751  DSBA oxidoreductase  32.23 
 
 		 222 aa  122  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3318  DSBA oxidoreductase  31.48 
 
 		 227 aa  122  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0515  DSBA oxidoreductase  30.81 
 
 		 221 aa  121  9e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  33.49 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4177  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  36.32 
 
 		 215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.743231  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3914  DSBA oxidoreductase  33.01 
 
 		 215 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1922  DSBA oxidoreductase  31.84 
 
 		 218 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0970  DSBA oxidoreductase  32.52 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227612 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5788  DSBA oxidoreductase  34.78 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487063 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1034  DSBA oxidoreductase  33.82 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3598  DSBA oxidoreductase  32.24 
 
 		 220 aa  116  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.432657 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2832  DSBA oxidoreductase  30.1 
 
 		 213 aa  116  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84064  normal  0.0678708 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1948  DSBA oxidoreductase  35.29 
 
 		 216 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1583  DSBA oxidoreductase  35 
 
 		 210 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  31.75 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7204  DSBA oxidoreductase  33.5 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0416  putative dithiol-disulfide isomerase  33.5 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2720  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.91 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.162153 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  29.49 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0746  DSBA oxidoreductase  31.46 
 
 		 215 aa  112  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1642  DSBA oxidoreductase  29.3 
 
 		 218 aa  112  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.420211  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1100  hypothetical protein  29.81 
 
 		 217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0633  DSBA oxidoreductase  31.8 
 
 		 220 aa  112  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218426  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0654  DSBA oxidoreductase  30.7 
 
 		 220 aa  111  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0728  DSBA oxidoreductase  32.43 
 
 		 230 aa  111  9e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  32.06 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2795  DSBA oxidoreductase  32.02 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1083  DSBA oxidoreductase  30.96 
 
 		 216 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.979731  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0967  DSBA oxidoreductase  31.28 
 
 		 220 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.431519  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4948  DSBA oxidoreductase  33.18 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.576797 
 
 
-
 
NC_003296  RS01681  hypothetical protein  30.85 
 
 		 222 aa  106  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01056  probable DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  29.3 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0796  DSBA oxidoreductase  32.72 
 
 		 221 aa  105  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  30.19 
 
 		 235 aa  105  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3987  DSBA oxidoreductase  32.39 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0024  DSBA oxidoreductase  33.68 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0963  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0391729  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2195  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4882  DSBA oxidoreductase  32.7 
 
 		 229 aa  100  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1200  DSBA oxidoreductase  31.55 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3961  DSBA oxidoreductase  35.12 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1605  DSBA oxidoreductase  29.95 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1174  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 		 239 aa  98.2  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.196548 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0210  DSBA oxidoreductase  29.47 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  30.39 
 
 		 243 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0258  DSBA oxidoreductase  29.11 
 
 		 208 aa  96.3  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  30.39 
 
 		 243 aa  95.5  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4436  DSBA oxidoreductase  33.18 
 
 		 239 aa  95.5  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5000  DSBA oxidoreductase  28.3 
 
 		 233 aa  94.4  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324442  normal  0.0420894 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2136  DSBA oxidoreductase  26.54 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.883465  normal  0.0421817 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0020  DSBA oxidoreductase  32.64 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22550  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  29.7 
 
 		 227 aa  92.8  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0308  FrnE protein  29.9 
 
 		 243 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00686429  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  30.88 
 
 		 243 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1917  DSBA oxidoreductase  30.05 
 
 		 217 aa  93.2  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  26.54 
 
 		 236 aa  92.8  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0567  DSBA oxidoreductase  25.84 
 
 		 244 aa  92.8  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  30.39 
 
 		 243 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1261  DSBA oxidoreductase  28.97 
 
 		 235 aa  92  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3550  DSBA oxidoreductase  29.11 
 
 		 220 aa  91.7  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.916573  normal  0.901837 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0941  DSBA oxidoreductase  28.93 
 
 		 240 aa  91.3  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.203124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2594  DSBA oxidoreductase  30.05 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31619  predicted protein  25.81 
 
 		 267 aa  91.3  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.947079  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  29.9 
 
 		 243 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  28.18 
 
 		 230 aa  90.1  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0704  DSBA oxidoreductase  26.09 
 
 		 235 aa  89.7  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0252  DSBA oxidoreductase  29.21 
 
 		 243 aa  90.1  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>