196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1917 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1917  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 217 aa  450  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4948  DSBA oxidoreductase  55.14 
 
 		 221 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.576797 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0796  DSBA oxidoreductase  55.14 
 
 		 221 aa  239  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2391  putative DSBA oxidoreductase  48.11 
 
 		 217 aa  204  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5500  DSBA oxidoreductase  47.87 
 
 		 217 aa  191  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.790496  normal  0.0537626 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5763  DSBA oxidoreductase  45.02 
 
 		 218 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47977  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01681  hypothetical protein  40.48 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1583  DSBA oxidoreductase  38.65 
 
 		 210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2795  DSBA oxidoreductase  37.8 
 
 		 207 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2316  DSBA oxidoreductase  35.81 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1922  DSBA oxidoreductase  36.06 
 
 		 218 aa  133  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1557  putative DSBA oxidoreductase  36.1 
 
 		 222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2832  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 213 aa  125  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84064  normal  0.0678708 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1347  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 		 233 aa  125  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01056  probable DSBA oxidoreductase  31.78 
 
 		 211 aa  116  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  30.84 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.474005 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3756  DSBA oxidoreductase  31.16 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.734213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0967  DSBA oxidoreductase  34.88 
 
 		 220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.431519  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3082  DSBA oxidoreductase  30.2 
 
 		 216 aa  112  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  0.192023 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4389  DSBA oxidoreductase  32.72 
 
 		 221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0887682  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  29.95 
 
 		 214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0746  DSBA oxidoreductase  30.92 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5468  hypothetical protein  31.16 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  31.05 
 
 		 221 aa  109  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0577  frnE protein, putative  29.52 
 
 		 224 aa  108  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0543  dsba oxidoreductase  29.52 
 
 		 224 aa  108  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  29.84 
 
 		 224 aa  108  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  32.7 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1502  DSBA oxidoreductase  33.65 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0283596 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1937  DSBA oxidoreductase  30.66 
 
 		 222 aa  106  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2709  DSBA oxidoreductase  29.58 
 
 		 214 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.111017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0515  DSBA oxidoreductase  32.57 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1700  DSBA oxidoreductase  29.73 
 
 		 227 aa  105  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0970  DSBA oxidoreductase  30.99 
 
 		 216 aa  104  9e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227612 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1717  DSBA oxidoreductase  29.3 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  31.22 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1441  DSBA oxidoreductase  33.81 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0402577 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2852  polyketide biosynthesis associated protein  34.45 
 
 		 214 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0261  DSBA oxidoreductase  32.08 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0132035 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6638  DsbA oxidoreductase  30.65 
 
 		 231 aa  99.8  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1542  DSBA oxidoreductase  30.23 
 
 		 224 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2720  thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.91 
 
 		 219 aa  99.4  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.162153 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  30.33 
 
 		 217 aa  99  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0728  DSBA oxidoreductase  32.72 
 
 		 230 aa  99.4  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7204  DSBA oxidoreductase  32.09 
 
 		 221 aa  98.6  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3598  DSBA oxidoreductase  33.64 
 
 		 220 aa  98.6  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.432657 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6424  DSBA oxidoreductase  35.35 
 
 		 217 aa  98.2  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.450496 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3008  DSBA oxidoreductase  32.13 
 
 		 248 aa  97.8  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2493  dithiol-disulfide isomerase  28.85 
 
 		 242 aa  97.8  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3318  DSBA oxidoreductase  32.23 
 
 		 227 aa  96.3  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1034  DSBA oxidoreductase  30.96 
 
 		 215 aa  96.3  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0654  DSBA oxidoreductase  31.16 
 
 		 220 aa  95.1  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0416  putative dithiol-disulfide isomerase  30.7 
 
 		 221 aa  95.1  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0210  DSBA oxidoreductase  31.22 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0633  DSBA oxidoreductase  30.37 
 
 		 220 aa  94  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218426  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3987  DSBA oxidoreductase  34.74 
 
 		 228 aa  93.6  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0952  DSBA oxidoreductase  30.05 
 
 		 219 aa  93.2  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.440606  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3751  DSBA oxidoreductase  30.28 
 
 		 222 aa  92.4  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1564  DsbA oxidoreductase  30.84 
 
 		 212 aa  92.4  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0406976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0024  DSBA oxidoreductase  32.14 
 
 		 211 aa  92.8  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  30.14 
 
 		 236 aa  91.7  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2061  DSBA oxidoreductase  30.52 
 
 		 215 aa  91.3  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1100  hypothetical protein  29.29 
 
 		 217 aa  91.3  9e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1083  DSBA oxidoreductase  28.3 
 
 		 216 aa  90.9  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.979731  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1488  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 234 aa  90.5  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1200  DSBA oxidoreductase  33.49 
 
 		 237 aa  90.1  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5788  DSBA oxidoreductase  34.5 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487063 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01724  polyketide synthase  31.88 
 
 		 213 aa  89.4  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1948  DSBA oxidoreductase  33.18 
 
 		 216 aa  89  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  28.71 
 
 		 225 aa  89  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5000  DSBA oxidoreductase  28.04 
 
 		 233 aa  87.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324442  normal  0.0420894 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0115  DSBA oxidoreductase  29.11 
 
 		 232 aa  87.8  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.133072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4177  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  28.04 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.743231  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  29.65 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0963  DSBA oxidoreductase  30.1 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0391729  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2296  DSBA oxidoreductase  30.18 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00720993  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  29.05 
 
 		 243 aa  86.3  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 		 209 aa  85.9  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10938  DSBA-like thioredoxin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G06250)  29.36 
 
 		 262 aa  85.5  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.487418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3914  DSBA oxidoreductase  28.97 
 
 		 215 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  30.84 
 
 		 235 aa  85.1  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1605  DSBA oxidoreductase  31.28 
 
 		 215 aa  84.7  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2145  DSBA oxidoreductase  35.57 
 
 		 232 aa  84.7  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  29.05 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1398  DSBA oxidoreductase  29.33 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394424  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  29.2 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  29.05 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  28.1 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1160  dithiol-disulfide isomerase  26.27 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000467454  hitchhiker  3.85744e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  28.57 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1642  DSBA oxidoreductase  27.78 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.420211  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1174  DSBA oxidoreductase  30.84 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.196548 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3441  DSBA oxidoreductase  28.5 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0020  DSBA oxidoreductase  33.16 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2073  DSBA oxidoreductase  33.64 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.232317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22650  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  32.08 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.483834 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2195  DSBA oxidoreductase  29.33 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1057  DSBA oxidoreductase  29.81 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>