198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3751 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3751  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 222 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2296  DSBA oxidoreductase  59.36 
 
 		 221 aa  258  5.0000000000000005e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00720993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2061  DSBA oxidoreductase  57.48 
 
 		 215 aa  258  6e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3914  DSBA oxidoreductase  57.48 
 
 		 215 aa  257  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3008  DSBA oxidoreductase  58.45 
 
 		 248 aa  256  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0654  DSBA oxidoreductase  58.41 
 
 		 220 aa  255  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4177  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  56.54 
 
 		 215 aa  254  6e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.743231  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0633  DSBA oxidoreductase  57.48 
 
 		 220 aa  250  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218426  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0115  DSBA oxidoreductase  55.61 
 
 		 232 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.133072  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3598  DSBA oxidoreductase  53.24 
 
 		 220 aa  244  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.432657 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3318  DSBA oxidoreductase  53.27 
 
 		 227 aa  243  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3987  DSBA oxidoreductase  57.82 
 
 		 228 aa  234  7e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0515  DSBA oxidoreductase  49.09 
 
 		 221 aa  232  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1564  DsbA oxidoreductase  50.96 
 
 		 212 aa  226  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0406976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1948  DSBA oxidoreductase  53.21 
 
 		 216 aa  223  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7204  DSBA oxidoreductase  49.08 
 
 		 221 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6424  DSBA oxidoreductase  48.6 
 
 		 217 aa  218  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.450496 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2720  thiol:disulfide interchange protein DsbA  47.62 
 
 		 219 aa  218  7.999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.162153 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1083  DSBA oxidoreductase  47.91 
 
 		 216 aa  216  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.979731  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0416  putative dithiol-disulfide isomerase  48.61 
 
 		 221 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  43.87 
 
 		 214 aa  209  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  47.62 
 
 		 217 aa  206  2e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1605  DSBA oxidoreductase  45.5 
 
 		 215 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1642  DSBA oxidoreductase  44.04 
 
 		 218 aa  202  4e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.420211  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0261  DSBA oxidoreductase  50 
 
 		 213 aa  201  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0132035 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  46.92 
 
 		 214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5788  DSBA oxidoreductase  47.39 
 
 		 215 aa  198  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487063 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01056  probable DSBA oxidoreductase  46.23 
 
 		 211 aa  195  6e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1937  DSBA oxidoreductase  45.45 
 
 		 222 aa  194  1e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0970  DSBA oxidoreductase  46.41 
 
 		 216 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227612 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0746  DSBA oxidoreductase  43.6 
 
 		 215 aa  182  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0728  DSBA oxidoreductase  43.26 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0210  DSBA oxidoreductase  39.44 
 
 		 213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1100  hypothetical protein  38.6 
 
 		 217 aa  171  6.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0963  DSBA oxidoreductase  40.27 
 
 		 230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0391729  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1057  DSBA oxidoreductase  40.76 
 
 		 235 aa  142  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  38.39 
 
 		 236 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  34.25 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0577  frnE protein, putative  34.11 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0543  dsba oxidoreductase  34.11 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  34.12 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  34.72 
 
 		 223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1502  DSBA oxidoreductase  34.45 
 
 		 214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0283596 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2316  DSBA oxidoreductase  33.49 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1557  putative DSBA oxidoreductase  33.49 
 
 		 222 aa  134  9e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  37.26 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4389  DSBA oxidoreductase  34.42 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0887682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  37.26 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2832  DSBA oxidoreductase  35.71 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84064  normal  0.0678708 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1717  DSBA oxidoreductase  35.94 
 
 		 221 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  34.88 
 
 		 223 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1542  DSBA oxidoreductase  36.61 
 
 		 224 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  36.79 
 
 		 243 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1441  DSBA oxidoreductase  33.03 
 
 		 214 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0402577 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  36.79 
 
 		 243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  36.79 
 
 		 243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  34.88 
 
 		 223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.474005 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2852  polyketide biosynthesis associated protein  33.96 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  32.26 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4148  DSBA oxidoreductase  36.49 
 
 		 241 aa  128  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0252  DSBA oxidoreductase  36.32 
 
 		 243 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0308  FrnE protein  36.32 
 
 		 243 aa  127  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00686429  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0258  DSBA oxidoreductase  36.36 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  36.28 
 
 		 235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5468  hypothetical protein  34.11 
 
 		 221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1347  DSBA oxidoreductase  31.98 
 
 		 233 aa  126  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2073  DSBA oxidoreductase  34.51 
 
 		 256 aa  125  5e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.232317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0567  DSBA oxidoreductase  32.24 
 
 		 244 aa  125  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01681  hypothetical protein  33.94 
 
 		 222 aa  124  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0704  DSBA oxidoreductase  32.09 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0952  DSBA oxidoreductase  32.23 
 
 		 219 aa  122  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.440606  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3756  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.734213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1700  DSBA oxidoreductase  28.97 
 
 		 227 aa  122  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3082  DSBA oxidoreductase  33.85 
 
 		 216 aa  121  7e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  0.192023 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1261  DSBA oxidoreductase  33.02 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  32.69 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0591  DSBA oxidoreductase  33.96 
 
 		 238 aa  119  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.699138  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1583  DSBA oxidoreductase  36.04 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2694  DSBA oxidoreductase  30.56 
 
 		 235 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1034  DSBA oxidoreductase  32.87 
 
 		 215 aa  118  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2795  DSBA oxidoreductase  35.2 
 
 		 207 aa  118  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0024  DSBA oxidoreductase  30.99 
 
 		 211 aa  118  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1893  DSBA oxidoreductase  32.54 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1488  DSBA oxidoreductase  29.17 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3441  DSBA oxidoreductase  33.18 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1922  DSBA oxidoreductase  33.8 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  34.84 
 
 		 230 aa  115  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2594  DSBA oxidoreductase  33.02 
 
 		 212 aa  115  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0941  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 		 240 aa  114  8.999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.203124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5000  DSBA oxidoreductase  29.47 
 
 		 233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324442  normal  0.0420894 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0738  DSBA oxidoreductase  33.01 
 
 		 244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122622 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0721  DSBA oxidoreductase  33.01 
 
 		 244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874736  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18220  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  32.41 
 
 		 218 aa  112  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1148  DSBA oxidoreductase  32.43 
 
 		 237 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2493  dithiol-disulfide isomerase  29.65 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1398  DSBA oxidoreductase  31.16 
 
 		 237 aa  109  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394424  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0326  DSBA oxidoreductase  34.62 
 
 		 237 aa  109  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2136  DSBA oxidoreductase  28.64 
 
 		 213 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.883465  normal  0.0421817 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0363  DSBA oxidoreductase  32.52 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0846  DSBA oxidoreductase  32.52 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>