95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_32270 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_32270  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  274  4e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.265116  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0670  TPR repeat-containing protein  67.52 
 
 		 127 aa  152  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0904  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  52.25 
 
 		 334 aa  103  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0436  tetratricopeptide domain-containing protein  50 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.122916  hitchhiker  0.0000856563 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0366  hypothetical protein  50 
 
 		 120 aa  89  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210731  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3982  DSBA oxidoreductase  54 
 
 		 328 aa  87.8  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3305  hypothetical protein  49.4 
 
 		 108 aa  83.6  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5189  DSBA oxidoreductase  45.83 
 
 		 265 aa  74.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2037  hypothetical protein  38.46 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0732088  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2133  hypothetical protein  45.78 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.420216  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0854  Tetratricopeptide domain protein  48.24 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.679313  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0578  hypothetical protein  45.24 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.67116  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3081  hypothetical protein  41.18 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298167  normal  0.458032 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4164  hypothetical protein  41.18 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1748  tetratricopeptide domain-containing protein  39.6 
 
 		 162 aa  57  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00737181  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6063  hypothetical protein  33.91 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3164  hypothetical protein  35.8 
 
 		 233 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0427407  normal  0.28931 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  31.88 
 
 		 864 aa  51.2  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3151  hypothetical protein  39.08 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.876304 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 		 399 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3111  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 		 631 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.651134 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03140  hypothetical protein  40.45 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3430  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.96 
 
 		 633 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3215  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.44 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.17261 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2165  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00018031  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1370  hypothetical protein  37.66 
 
 		 690 aa  46.2  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.47 
 
 		 880 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2017  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.137477 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0774  TPR repeat-containing protein  30.16 
 
 		 1534 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1304  TPR repeat-containing protein  37.68 
 
 		 690 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.107632  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.93 
 
 		 633 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.412793 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.59 
 
 		 594 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 405 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1251  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.365631 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3556  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 291 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5440  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.12 
 
 		 619 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.842579  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 		 592 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0990  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.7 
 
 		 410 aa  45.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113297  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  32.99 
 
 		 573 aa  45.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2747  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 617 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538174  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  30.84 
 
 		 560 aa  45.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4074  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 622 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 		 366 aa  44.7  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.29 
 
 		 344 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1837  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 344 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.57 
 
 		 293 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 878 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  36 
 
 		 863 aa  43.9  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4434  Tetratricopeptide domain protein  24.8 
 
 		 282 aa  43.9  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 		 280 aa  43.9  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.19 
 
 		 1838 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.4844  normal  0.543205 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  29.41 
 
 		 592 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  26.74 
 
 		 795 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2187  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 		 571 aa  43.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 804 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  29.49 
 
 		 436 aa  43.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  38.46 
 
 		 591 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  26.8 
 
 		 593 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  44.26 
 
 		 562 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28 
 
 		 810 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0666  protein kinase  31.17 
 
 		 889 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415154 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3799  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 691 aa  41.6  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.487228 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 		 722 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0237  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.98 
 
 		 984 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 968 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  35.56 
 
 		 573 aa  41.2  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0677  TPR repeat-containing protein  34.72 
 
 		 616 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03573  tetratricopeptide repeat family  33.7 
 
 		 690 aa  41.6  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432087  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  43.84 
 
 		 502 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4064  protein kinase  31.9 
 
 		 863 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.731546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  43.84 
 
 		 502 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 595 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  37.7 
 
 		 402 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  43.84 
 
 		 502 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 377 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30 
 
 		 798 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  36 
 
 		 653 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  32.48 
 
 		 621 aa  40.8  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  36 
 
 		 653 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 		 870 aa  40.4  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.27 
 
 		 632 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  29.29 
 
 		 643 aa  40.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0208  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 		 923 aa  40.4  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.877042 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  35.63 
 
 		 572 aa  40.4  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  28.7 
 
 		 632 aa  40.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0032  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 1445 aa  40.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2356  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.23 
 
 		 359 aa  40.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.337618  normal  0.0354802 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  30.59 
 
 		 621 aa  40.4  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  30.59 
 
 		 621 aa  40.4  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 265 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2787  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.53 
 
 		 333 aa  40  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2716  hypothetical protein  28.4 
 
 		 905 aa  40  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  hitchhiker  0.00105391 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 685 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 		 617 aa  40  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>