52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5440 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5440  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 148 aa  296  5e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6063  hypothetical protein  48.39 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1251  TPR repeat-containing protein  50.41 
 
 		 156 aa  114  6e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.365631 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3016  tetratricopeptide domain-containing protein  52.5 
 
 		 131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0349866  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1748  tetratricopeptide domain-containing protein  50 
 
 		 162 aa  112  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00737181  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3164  hypothetical protein  54.13 
 
 		 233 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0427407  normal  0.28931 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2017  hypothetical protein  47.15 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.137477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2165  TPR repeat-containing protein  47.62 
 
 		 137 aa  97.1  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00018031  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3151  hypothetical protein  50 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.876304 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0366  hypothetical protein  35.58 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0436  tetratricopeptide domain-containing protein  35.85 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.122916  hitchhiker  0.0000856563 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0854  Tetratricopeptide domain protein  35.64 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.679313  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  35.24 
 
 		 4079 aa  52.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2133  hypothetical protein  30.85 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.420216  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3982  DSBA oxidoreductase  32.35 
 
 		 328 aa  50.8  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3215  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.18 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.17261 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  31.31 
 
 		 1979 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3305  hypothetical protein  30.56 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0990  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.63 
 
 		 410 aa  47.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113297  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2716  hypothetical protein  29.63 
 
 		 905 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  hitchhiker  0.00105391 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 		 1069 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 		 375 aa  47  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 		 284 aa  46.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 581 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1025  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 1827 aa  45.4  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  37.5 
 
 		 474 aa  45.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3235  tetratricopeptide TPR_2  26.77 
 
 		 734 aa  45.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32270  hypothetical protein  32.26 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.265116  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  31.31 
 
 		 677 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3076  TPR repeat-containing protein  35.92 
 
 		 697 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 		 207 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0904  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  32.43 
 
 		 334 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1194  Tetratricopeptide domain protein  27.03 
 
 		 208 aa  44.3  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1008  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 359 aa  43.9  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000389173  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 		 870 aa  43.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0048  tetratricopeptide domain-containing protein  30.56 
 
 		 897 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467809 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  36 
 
 		 484 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  27.62 
 
 		 560 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.52 
 
 		 689 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 		 361 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3181  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.67 
 
 		 254 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.385251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4966  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.13 
 
 		 155 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4894  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964612 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.77 
 
 		 3145 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  22.68 
 
 		 543 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  29.29 
 
 		 586 aa  41.2  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2378  TPR domain-containing protein  27.88 
 
 		 743 aa  40.8  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.45 
 
 		 264 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0224916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2045  tetratricopeptide TPR_2  25.96 
 
 		 199 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.00000000000222916  normal  0.0184394 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.76 
 
 		 2240 aa  40.4  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0670  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 		 127 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>