39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3305 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3305  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  223  9e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2133  hypothetical protein  67.59 
 
 		 108 aa  156  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.420216  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0578  hypothetical protein  46.15 
 
 		 106 aa  99  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.67116  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3081  hypothetical protein  48.54 
 
 		 107 aa  93.6  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298167  normal  0.458032 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0436  tetratricopeptide domain-containing protein  48.94 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.122916  hitchhiker  0.0000856563 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0670  TPR repeat-containing protein  44.66 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0366  hypothetical protein  45 
 
 		 120 aa  85.1  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32270  hypothetical protein  49.4 
 
 		 138 aa  83.6  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.265116  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4164  hypothetical protein  50.62 
 
 		 105 aa  80.1  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0854  Tetratricopeptide domain protein  39.58 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.679313  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0904  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  41.05 
 
 		 334 aa  72  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2037  hypothetical protein  42.86 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0732088  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3982  DSBA oxidoreductase  35.79 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6063  hypothetical protein  37.08 
 
 		 143 aa  60.1  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5189  DSBA oxidoreductase  35.96 
 
 		 265 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03140  hypothetical protein  38.14 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1251  TPR repeat-containing protein  32.93 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.365631 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2017  hypothetical protein  37.08 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.137477 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1748  tetratricopeptide domain-containing protein  35.8 
 
 		 162 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00737181  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2165  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00018031  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5440  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  35.16 
 
 		 1069 aa  47  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3016  tetratricopeptide domain-containing protein  30.69 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0349866  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3215  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.58 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.17261 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3164  hypothetical protein  34.21 
 
 		 233 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0427407  normal  0.28931 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3754  FkbM family methyltransferase  25.81 
 
 		 569 aa  44.3  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1578  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.44 
 
 		 602 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000346283  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3694  TPR repeat-containing protein  36.9 
 
 		 638 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3151  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  42.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.876304 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0262  Peptidoglycan-binding LysM  34.02 
 
 		 318 aa  42  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3472  Tetratricopeptide TPR_4  40.68 
 
 		 1018 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 		 934 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3280  peptidase M48 Ste24p  25.47 
 
 		 452 aa  41.2  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.227869  normal  0.68858 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  32.81 
 
 		 448 aa  41.2  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 315 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.23 
 
 		 1838 aa  41.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.4844  normal  0.543205 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3704  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 426 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.71 
 
 		 880 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0666  protein kinase  38.1 
 
 		 889 aa  40  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415154 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>