56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1251 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1251  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 156 aa  306  8e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.365631 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6063  hypothetical protein  58.4 
 
 		 143 aa  134  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1748  tetratricopeptide domain-containing protein  57.03 
 
 		 162 aa  134  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00737181  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3164  hypothetical protein  63.21 
 
 		 233 aa  130  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0427407  normal  0.28931 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2017  hypothetical protein  58.46 
 
 		 143 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.137477 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3016  tetratricopeptide domain-containing protein  61.21 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0349866  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5440  TPR repeat-containing protein  50 
 
 		 148 aa  117  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2165  TPR repeat-containing protein  58.4 
 
 		 137 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00018031  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3151  hypothetical protein  45.99 
 
 		 146 aa  83.6  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.876304 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0366  hypothetical protein  32.2 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3215  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.6 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.17261 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3305  hypothetical protein  34.21 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2133  hypothetical protein  30.93 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.420216  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0854  Tetratricopeptide domain protein  33.33 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.679313  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32270  hypothetical protein  33.71 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.265116  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0436  tetratricopeptide domain-containing protein  28.21 
 
 		 120 aa  48.1  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.122916  hitchhiker  0.0000856563 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0670  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 127 aa  47.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0774  TPR repeat-containing protein  32.39 
 
 		 1534 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  29.29 
 
 		 510 aa  47.4  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0904  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  39.19 
 
 		 334 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  30.17 
 
 		 593 aa  47  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 617 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.54 
 
 		 739 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  35.42 
 
 		 739 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1536  TPR domain-containing protein  27.84 
 
 		 174 aa  45.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3564  hypothetical protein  31.58 
 
 		 433 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 		 592 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3630  protein of unknown function DUF124  31.58 
 
 		 428 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1063  TPR repeat-containing protein  32.39 
 
 		 1129 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.194908  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  28.57 
 
 		 1979 aa  43.9  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 		 4079 aa  43.9  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3685  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 495 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3704  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.58 
 
 		 426 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.07 
 
 		 1838 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.4844  normal  0.543205 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  28.7 
 
 		 592 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 		 572 aa  43.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0678  extracellular ligand-binding receptor  28.72 
 
 		 1073 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3127  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.1 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.255476 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3982  TPR repeat-containing protein  29.77 
 
 		 305 aa  42.4  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.588459  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  29.66 
 
 		 1077 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2321  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 475 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.084712  decreased coverage  0.00212856 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  28.57 
 
 		 564 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 870 aa  41.6  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  31.51 
 
 		 725 aa  41.2  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4222  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 		 1757 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3624  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.63 
 
 		 571 aa  41.2  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  31.31 
 
 		 573 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2856  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 		 297 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2378  TPR domain-containing protein  25.81 
 
 		 743 aa  41.2  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3982  DSBA oxidoreductase  31.87 
 
 		 328 aa  41.2  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 405 aa  40.8  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3329  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 397 aa  40.8  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 585 aa  40.4  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2822  tetratricopeptide repeat-containing protein  31.4 
 
 		 290 aa  40.4  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0986349  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  28.09 
 
 		 1127 aa  40.4  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 		 565 aa  40.4  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>