32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3016 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3016  tetratricopeptide domain-containing protein  100 
 
 		 131 aa  252  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0349866  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6063  hypothetical protein  60.66 
 
 		 143 aa  143  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1748  tetratricopeptide domain-containing protein  62.71 
 
 		 162 aa  140  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00737181  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1251  TPR repeat-containing protein  61.26 
 
 		 156 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.365631 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2165  TPR repeat-containing protein  61.79 
 
 		 137 aa  130  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00018031  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3164  hypothetical protein  61.47 
 
 		 233 aa  128  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0427407  normal  0.28931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5440  TPR repeat-containing protein  52.5 
 
 		 148 aa  124  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2017  hypothetical protein  57.38 
 
 		 143 aa  121  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.137477 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3151  hypothetical protein  60 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.876304 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0366  hypothetical protein  35.59 
 
 		 120 aa  60.1  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0436  tetratricopeptide domain-containing protein  36.44 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.122916  hitchhiker  0.0000856563 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2133  hypothetical protein  34.02 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.420216  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3305  hypothetical protein  30.69 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3081  hypothetical protein  36.17 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298167  normal  0.458032 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0670  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3982  DSBA oxidoreductase  34.02 
 
 		 328 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3097  hypothetical protein  35.96 
 
 		 933 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.681672  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0904  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  37.14 
 
 		 334 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3215  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.63 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.17261 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  30.3 
 
 		 1979 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 523 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3630  protein of unknown function DUF124  32.63 
 
 		 428 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 		 1212 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3564  hypothetical protein  32.63 
 
 		 433 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 		 847 aa  41.2  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2037  hypothetical protein  33.05 
 
 		 154 aa  41.2  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0732088  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.5 
 
 		 277 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3704  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.63 
 
 		 426 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  34.91 
 
 		 598 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 566 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0772  integral membrane protein  35.9 
 
 		 788 aa  40.8  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  28.75 
 
 		 314 aa  40  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>