21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2037 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2037  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  307  2.9999999999999997e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0732088  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0904  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  48.18 
 
 		 334 aa  87.8  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0366  hypothetical protein  43.36 
 
 		 120 aa  84.7  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0670  TPR repeat-containing protein  43.36 
 
 		 127 aa  84  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0436  tetratricopeptide domain-containing protein  43.56 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.122916  hitchhiker  0.0000856563 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32270  hypothetical protein  38.46 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.265116  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0854  Tetratricopeptide domain protein  50.59 
 
 		 122 aa  73.6  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.679313  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3305  hypothetical protein  42.86 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0578  hypothetical protein  47.06 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.67116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5189  DSBA oxidoreductase  44.21 
 
 		 265 aa  65.1  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2133  hypothetical protein  41.05 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.420216  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3982  DSBA oxidoreductase  41 
 
 		 328 aa  60.1  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3081  hypothetical protein  42.86 
 
 		 107 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298167  normal  0.458032 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4164  hypothetical protein  35.29 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03140  hypothetical protein  37 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0237  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.23 
 
 		 984 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6063  hypothetical protein  30.28 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2255  hypothetical protein  30.56 
 
 		 191 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3151  hypothetical protein  35.53 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.876304 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2185  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  31.76 
 
 		 285 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 423 aa  40  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>