141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4236 on replicon NC_007801
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007801  Jann_4236  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 824 aa  1623    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.707034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3385  tetratricopeptide  43.62 
 
 		 811 aa  601  1e-170  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1011  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 		 800 aa  210  8e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  23.31 
 
 		 729 aa  134  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2579  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.25 
 
 		 786 aa  112  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  22.67 
 
 		 729 aa  100  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 		 767 aa  89.4  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1943  TPR repeat-containing protein  24.25 
 
 		 952 aa  73.9  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0781  TPR domain-containing protein  25.34 
 
 		 924 aa  72.4  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.55707  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  21.04 
 
 		 567 aa  72  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  29.33 
 
 		 572 aa  70.5  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01444  TPR repeat protein  25.44 
 
 		 937 aa  68.2  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0688079  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.71 
 
 		 557 aa  68.6  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  21.29 
 
 		 568 aa  68.2  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 2262 aa  64.7  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 		 900 aa  62.4  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.68 
 
 		 582 aa  61.6  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 		 607 aa  61.2  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  26.77 
 
 		 566 aa  60.1  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 		 722 aa  60.1  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.84 
 
 		 610 aa  59.7  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  21.25 
 
 		 573 aa  59.7  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3694  TPR repeat-containing protein  31.02 
 
 		 638 aa  59.7  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  24.89 
 
 		 579 aa  59.7  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  26.41 
 
 		 610 aa  59.7  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1284  TPR repeat-containing protein  28.52 
 
 		 612 aa  60.1  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1092  hypothetical protein  22.9 
 
 		 1119 aa  59.3  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4107  TPR repeat-containing protein  30.2 
 
 		 552 aa  58.9  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 		 931 aa  58.9  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  27.65 
 
 		 632 aa  58.9  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  30.62 
 
 		 642 aa  58.5  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  25.69 
 
 		 935 aa  58.5  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0626  tetratricopeptide TPR_2  18.74 
 
 		 2059 aa  57.8  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00762464 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  20.37 
 
 		 882 aa  57.8  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  21.46 
 
 		 1138 aa  57  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.37 
 
 		 572 aa  57  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  30.29 
 
 		 886 aa  55.8  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1499  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 		 620 aa  55.8  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  22.51 
 
 		 573 aa  55.5  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 		 594 aa  55.8  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.92 
 
 		 572 aa  55.5  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1338  tetratricopeptide TPR_2  27.32 
 
 		 931 aa  55.1  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  31.47 
 
 		 585 aa  55.1  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  19.32 
 
 		 566 aa  55.1  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  22.87 
 
 		 934 aa  54.7  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 572 aa  54.7  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2472  TPR repeat-containing protein  26.38 
 
 		 566 aa  54.3  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.27 
 
 		 2240 aa  53.9  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.59 
 
 		 553 aa  53.5  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.62 
 
 		 810 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  22.59 
 
 		 603 aa  53.9  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  25 
 
 		 583 aa  53.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  29.37 
 
 		 425 aa  52.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0382  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 		 576 aa  52.8  0.00003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 566 aa  52.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  22.86 
 
 		 417 aa  52.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  22.71 
 
 		 677 aa  52.4  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  28.99 
 
 		 586 aa  51.6  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  23.35 
 
 		 883 aa  51.6  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.15 
 
 		 571 aa  51.6  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 		 585 aa  51.2  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 		 595 aa  51.2  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  32.79 
 
 		 621 aa  50.4  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  23.71 
 
 		 619 aa  50.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  20.99 
 
 		 573 aa  50.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  24.46 
 
 		 576 aa  50.4  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  24.54 
 
 		 315 aa  50.4  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  28.47 
 
 		 591 aa  50.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  32.79 
 
 		 621 aa  50.4  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  25.34 
 
 		 2262 aa  50.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.97 
 
 		 563 aa  49.7  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2393  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 		 944 aa  50.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  24.03 
 
 		 733 aa  49.7  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.24 
 
 		 574 aa  49.3  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3074  TPR domain protein  31.43 
 
 		 584 aa  49.3  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0488  TPR repeat-containing protein  30.37 
 
 		 485 aa  48.9  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160649 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  20.21 
 
 		 436 aa  48.9  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  32.6 
 
 		 584 aa  48.9  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.41 
 
 		 878 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 		 621 aa  48.9  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  25.07 
 
 		 789 aa  48.5  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2439  TPR repeat-containing protein  23.51 
 
 		 923 aa  48.5  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  31.17 
 
 		 593 aa  48.5  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0694  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.93 
 
 		 577 aa  48.5  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0342  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.08 
 
 		 582 aa  48.5  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  20.24 
 
 		 884 aa  48.5  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  23.88 
 
 		 718 aa  47.8  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.13 
 
 		 364 aa  47.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.3 
 
 		 804 aa  47.8  0.0009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152731  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  22.01 
 
 		 864 aa  47.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  20.63 
 
 		 927 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 		 581 aa  47.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  30.39 
 
 		 593 aa  47.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1566  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 		 738 aa  47.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.411848  hitchhiker  0.00925631 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 		 464 aa  47.8  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  19.89 
 
 		 725 aa  47.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  22.02 
 
 		 1069 aa  47  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 573 aa  47  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3495  tetratricopeptide TPR_4  25.12 
 
 		 620 aa  47  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000742446 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2121  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 		 559 aa  47.4  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000963892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>