20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1092 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1092  hypothetical protein  100 
 
 		 1119 aa  2251    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0330  tetratricopeptide repeat domain protein  24.19 
 
 		 931 aa  157  1e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.905094  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0830  TPR repeat-containing protein  23.93 
 
 		 1364 aa  102  6e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 1737 aa  72  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  24.17 
 
 		 2262 aa  62.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4236  tetratricopeptide TPR_2  22.9 
 
 		 824 aa  58.5  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.707034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 		 2262 aa  53.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.11 
 
 		 1000 aa  52  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2041  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  21.99 
 
 		 884 aa  51.2  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.443497 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  26.88 
 
 		 979 aa  50.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.98 
 
 		 565 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  25.61 
 
 		 1013 aa  50.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  24.37 
 
 		 957 aa  49.3  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_011654  BCAH187_D0008  hypothetical protein  31.96 
 
 		 429 aa  47  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.24 
 
 		 810 aa  47.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02410  general transcriptional repressor, putative  31.11 
 
 		 1101 aa  47  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5036  tetratricopeptide TPR_2  28.41 
 
 		 288 aa  46.2  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0840723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  23.12 
 
 		 1406 aa  46.2  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  21.66 
 
 		 620 aa  45.8  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1877 aa  44.7  0.01  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>