38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5521 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5521  Tetratricopeptide repeat protein  100 
 
 		 607 aa  1227    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0375374  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3805  Tetratricopeptide domain protein  47.42 
 
 		 595 aa  553  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00975228  normal  0.247571 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3505  hypothetical protein  41.71 
 
 		 602 aa  434  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.012069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0363  Tetratricopeptide TPR_3  33.39 
 
 		 602 aa  273  7e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03770  hypothetical protein  28.29 
 
 		 593 aa  201  3.9999999999999996e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0846  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 		 593 aa  186  7e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1963  Tetratricopeptide TPR_4  25.63 
 
 		 607 aa  122  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  26.64 
 
 		 263 aa  54.3  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  26.64 
 
 		 263 aa  54.3  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  26.64 
 
 		 263 aa  54.3  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  26.64 
 
 		 263 aa  54.3  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  26.64 
 
 		 263 aa  54.3  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  26.64 
 
 		 263 aa  54.3  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  26.64 
 
 		 263 aa  53.9  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  26.64 
 
 		 263 aa  53.9  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  26.64 
 
 		 263 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1158  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 257 aa  52.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.188926  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  25.46 
 
 		 262 aa  52  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  25.46 
 
 		 262 aa  52  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  25.46 
 
 		 262 aa  51.6  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  25.46 
 
 		 262 aa  51.6  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  27.82 
 
 		 262 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2246  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 		 1004 aa  50.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  27.82 
 
 		 264 aa  49.3  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1511  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.21 
 
 		 577 aa  48.5  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00018605  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0006  hypothetical protein  26.09 
 
 		 283 aa  47  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000521994  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  27.68 
 
 		 262 aa  46.6  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  25.22 
 
 		 269 aa  45.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  25.22 
 
 		 269 aa  45.8  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 		 264 aa  45.8  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  25.22 
 
 		 269 aa  45.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3603  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.3 
 
 		 304 aa  46.2  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0965  tol-pal system protein YbgF  29.63 
 
 		 487 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.666424  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0016  hypothetical protein  27.34 
 
 		 293 aa  45.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3712  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.27 
 
 		 304 aa  45.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0729  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 		 255 aa  43.9  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.032974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  32.61 
 
 		 715 aa  43.9  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  24.8 
 
 		 272 aa  43.5  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>