54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1963 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1963  Tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 607 aa  1165    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5521  Tetratricopeptide repeat protein  25.29 
 
 		 607 aa  148  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0375374  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03770  hypothetical protein  24.58 
 
 		 593 aa  137  6.0000000000000005e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3505  hypothetical protein  24.03 
 
 		 602 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.012069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0363  Tetratricopeptide TPR_3  24.65 
 
 		 602 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3805  Tetratricopeptide domain protein  22.49 
 
 		 595 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00975228  normal  0.247571 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0846  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 593 aa  69.7  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 1069 aa  58.5  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 		 878 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.61 
 
 		 557 aa  52  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 		 543 aa  51.6  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.88 
 
 		 2240 aa  51.6  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.2 
 
 		 572 aa  51.2  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  25 
 
 		 587 aa  50.4  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.63 
 
 		 1000 aa  50.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  21.3 
 
 		 927 aa  48.9  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  22.47 
 
 		 810 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2423  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.79 
 
 		 415 aa  48.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 		 280 aa  47.8  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0016  TPR repeat-containing protein  22.94 
 
 		 229 aa  47.8  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0964608  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.98 
 
 		 572 aa  47.8  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  26.15 
 
 		 576 aa  47.8  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  32.45 
 
 		 3035 aa  47.4  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  22.94 
 
 		 622 aa  47.4  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  21.07 
 
 		 1486 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  23.77 
 
 		 486 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0626  tetratricopeptide TPR_2  22.08 
 
 		 2059 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00762464 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1311  hypothetical protein  28.07 
 
 		 331 aa  45.8  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.24 
 
 		 1737 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  23.49 
 
 		 722 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1008  TPR repeat-containing protein  24.05 
 
 		 359 aa  45.8  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000389173  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3052  peptidase S1C, HrtA/DegP2/Q/S  21.1 
 
 		 772 aa  45.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00233494  normal  0.413301 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2167  tetratricopeptide TPR_2  21.76 
 
 		 1014 aa  45.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  22.89 
 
 		 4079 aa  45.4  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1065  TPR repeat-containing protein  22.58 
 
 		 449 aa  45.4  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  25.34 
 
 		 764 aa  45.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0115  Tetratricopeptide domain protein  29.03 
 
 		 409 aa  45.1  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  27.8 
 
 		 2262 aa  45.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2032  response regulator receiver protein  23.81 
 
 		 387 aa  45.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0686114 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3428  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 		 250 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  21.71 
 
 		 568 aa  44.7  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  28.57 
 
 		 560 aa  44.7  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  24.37 
 
 		 949 aa  44.3  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.76 
 
 		 364 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 		 607 aa  44.3  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  29.44 
 
 		 584 aa  44.3  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3220  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1178 aa  43.9  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.166794 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4615  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.77 
 
 		 1402 aa  43.9  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  28.17 
 
 		 3301 aa  43.9  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3012  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.31 
 
 		 254 aa  43.9  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 344 aa  43.9  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  25.17 
 
 		 545 aa  43.9  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2038  TPR repeat-containing protein  31.2 
 
 		 1024 aa  43.9  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.144797 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 366 aa  43.5  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>