12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0846 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0846  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 593 aa  1194    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03770  hypothetical protein  40.03 
 
 		 593 aa  417  9.999999999999999e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3505  hypothetical protein  29.41 
 
 		 602 aa  193  7e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.012069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3805  Tetratricopeptide domain protein  28.5 
 
 		 595 aa  187  5e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00975228  normal  0.247571 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5521  Tetratricopeptide repeat protein  27.63 
 
 		 607 aa  186  7e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0375374  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0363  Tetratricopeptide TPR_3  27.41 
 
 		 602 aa  152  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1963  Tetratricopeptide TPR_4  26.98 
 
 		 607 aa  60.5  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 718 aa  50.4  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  22.2 
 
 		 828 aa  48.5  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66638  glucose repression mediator protein  23.38 
 
 		 815 aa  48.1  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 		 597 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 264 aa  46.6  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>