44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0628 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0628  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 302 aa  608  1e-173  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  49.3 
 
 		 1910 aa  72  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0285  peptidoglycan-binding LysM  58.82 
 
 		 1095 aa  68.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1487  peptidoglycan-binding LysM  52.94 
 
 		 425 aa  64.3  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2228  Peptidoglycan-binding LysM  57.14 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00208524  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  46.48 
 
 		 627 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1342  peptidoglycan-binding LysM  43.24 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.779699  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0233  peptidoglycan-binding LysM  38.46 
 
 		 242 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4948  Peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 153 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1338  protein serine/threonine phosphatase  27.5 
 
 		 474 aa  52  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000169814  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  38.1 
 
 		 219 aa  50.1  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1486  peptidoglycan-binding LysM  49.02 
 
 		 351 aa  49.7  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  33.06 
 
 		 663 aa  48.9  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0939  peptidoglycan-binding LysM  41.67 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.013426  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0917  LysM domain/BON superfamily protein  40.82 
 
 		 166 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2044  LysM domain/BON superfamily protein  27.84 
 
 		 143 aa  47.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0490  peptidoglycan-binding LysM  39.58 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860962  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4170  peptidoglycan-binding LysM  29.29 
 
 		 163 aa  47.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301843  normal  0.177746 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0453  LysM domain/BON superfamily protein  40.82 
 
 		 158 aa  46.2  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0533  peptidoglycan-binding LysM  37.25 
 
 		 162 aa  45.8  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.235675  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0549  Peptidoglycan-binding LysM  37.25 
 
 		 162 aa  45.8  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1297  transport-associated protein  35.48 
 
 		 156 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.451371  normal  0.073309 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2167  LysM domain/BON superfamily protein  43.14 
 
 		 156 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.420767  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  41.67 
 
 		 234 aa  45.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0149  hypothetical protein  39.34 
 
 		 422 aa  45.4  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0952  LysM domain/BON superfamily protein  40.82 
 
 		 167 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.954636  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4246  Peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 217 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.995524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3922  cell wall hydrolase/autolysin  32 
 
 		 542 aa  44.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00766484  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2304  LysM domain/BON superfamily protein  43.14 
 
 		 156 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2264  LysM domain/BON superfamily protein  43.14 
 
 		 156 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2427  LysM domain/BON superfamily protein  43.14 
 
 		 156 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2267  LysM domain/BON superfamily protein  34.55 
 
 		 161 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0461572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3686  Peptidoglycan-binding LysM  38.46 
 
 		 97 aa  44.3  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 4079 aa  43.9  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2004  LysM domain/BON superfamily protein  40.82 
 
 		 161 aa  44.3  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1944  LysM domain/BON superfamily protein  34.55 
 
 		 161 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123188  normal  0.0308749 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2006  Peptidoglycan-binding LysM  38.71 
 
 		 154 aa  43.5  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.899391  normal  0.48043 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02210  hypothetical protein  40.82 
 
 		 166 aa  43.5  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1744  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  36.49 
 
 		 913 aa  43.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0662  putative cell wall turnover protein  28.43 
 
 		 185 aa  42.7  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  40.38 
 
 		 1051 aa  42.7  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2266  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  43.14 
 
 		 285 aa  42.7  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.355475  hitchhiker  0.000527063 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2273  Peptidoglycan-binding LysM  40.35 
 
 		 546 aa  42.7  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000673972  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1052  Peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 219 aa  42.7  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>