50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2266 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2266  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  100 
 
 		 285 aa  568  1e-161  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.355475  hitchhiker  0.000527063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5385  Peptidoglycan-binding LysM  50.62 
 
 		 251 aa  251  8.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1905  hypothetical protein  48.06 
 
 		 256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211998  hitchhiker  0.0023156 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0927  hypothetical protein  45.27 
 
 		 254 aa  228  6e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4389  Peptidoglycan-binding LysM  42.37 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.855659  normal  0.278561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2944  Peptidoglycan-binding LysM  41.7 
 
 		 236 aa  183  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.34706  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3821  peptidoglycan-binding LysM  36.21 
 
 		 229 aa  142  8e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.018492  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26580  LysM domain-containing protein  34.63 
 
 		 219 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1052  Peptidoglycan-binding LysM  34.3 
 
 		 219 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2818  peptidoglycan-binding LysM  33.66 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1662  hypothetical protein  33.83 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.595279  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0771  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  26.73 
 
 		 222 aa  85.5  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4346  hypothetical protein  31.94 
 
 		 230 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0319387  normal  0.0732619 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0981  hypothetical protein  28.71 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3663  hypothetical protein  30.88 
 
 		 159 aa  75.1  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000726508 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1870  peptidoglycan-binding LysM  27.23 
 
 		 224 aa  75.1  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3154  hypothetical protein  22.33 
 
 		 229 aa  75.5  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1041  hypothetical protein  23.91 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3926  hypothetical protein  26.42 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000265791  hitchhiker  0.00532364 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2549  hypothetical protein  24.58 
 
 		 234 aa  67  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0677  Peptidoglycan-binding LysM  33.62 
 
 		 215 aa  67  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3610  hypothetical protein  26.34 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000791027 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1955  Peptidoglycan-binding LysM  25.94 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5251  hypothetical protein  27.41 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000337466 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0233  hypothetical protein  30.22 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.916377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1683  hypothetical protein  25.62 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2463  hypothetical protein  25.71 
 
 		 220 aa  65.1  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.258952 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0670  hypothetical protein  24.14 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.528126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1627  hypothetical protein  28.99 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0432384 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1744  hypothetical protein  24.82 
 
 		 169 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1507  LysM domain-containing protein  27.32 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0370  hypothetical protein  27 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3004  hypothetical protein  29.06 
 
 		 213 aa  54.7  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1878  hypothetical protein  26.85 
 
 		 239 aa  54.7  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3686  Peptidoglycan-binding LysM  44.9 
 
 		 97 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  38.71 
 
 		 234 aa  47.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  36.59 
 
 		 1051 aa  46.2  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4948  Peptidoglycan-binding LysM  37.74 
 
 		 153 aa  45.8  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1751  hypothetical protein  27.38 
 
 		 215 aa  45.4  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.176689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1923  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 5189 aa  45.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3683  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 5236 aa  45.8  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  43.75 
 
 		 954 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  45.45 
 
 		 1910 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1342  peptidoglycan-binding LysM  41.82 
 
 		 389 aa  43.5  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.779699  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1944  LysM domain/BON superfamily protein  39.22 
 
 		 161 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123188  normal  0.0308749 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2267  LysM domain/BON superfamily protein  39.22 
 
 		 161 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0461572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  45.45 
 
 		 394 aa  43.1  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1297  transport-associated protein  36.67 
 
 		 156 aa  42.7  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.451371  normal  0.073309 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0533  peptidoglycan-binding LysM  36.84 
 
 		 162 aa  42.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.235675  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0549  Peptidoglycan-binding LysM  36.84 
 
 		 162 aa  42.4  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>